（IUCr）结晶学报第D节第59卷第8部分，2003年8月

《水晶学报》。（2003年）。D类59,1347-1356
doi:10.1107/S0907444903011107

蛋白质晶体中分子间接触的形态和强度

Y.Matsuura先生和A.A.切尔诺夫

计算了多形溶菌酶晶体的分子间接触强度。计算表面能以与形态相关。

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大西洋鳕鱼尿嘧啶-DNA糖苷酶的结构(加杜斯·莫鲁瓦)揭示了冷适应特征

I.雷罗斯,E.Moe公司,O.车道,A.O.斯马洛斯和N.P.威拉森

与人类相比，在1.9°分辨率下测定的cod uracil-DNA糖苷酶的晶体结构表明，离子对相互作用的数量减少，核心的最佳填充更少，DNA结合区域的静电表面电位也得到了优化。

PDB参考:尿嘧啶-DNA糖苷酶，1okb，r1okbsf

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核糖体激活蛋白β-luffin的晶体结构，分辨率为2.0º

Q.马,J.李,H.李,吴圣美（S.Wu）和Y.Dong先生

以聚乙酰天花粉蛋白为搜索模型，用分子置换法求解了β-luffin在2.0°分辨率下的晶体结构。

PDB参考:β-luffin，1nio，r1niosf

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基于五自由度快速傅立叶变换加速度的刚体快速旋转匹配

J.A.科瓦茨,P.Chacón先生,Y.聪,E.梅特瓦利和W.Wriggers公司

将三维“快速旋转匹配”方法扩展到两个三维对象之间的全六维（旋转和平移）匹配场景。该方法允许通过快速傅里叶变换处理六个自由度中的五个自由度。

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柔红霉素与B型DNA/RNA嵌合物（dC）（rG）d（ATCG）的结构

K.Shi先生,B.锅和M.Sundalingam先生

与柔红霉素复合的DNA/RNA嵌合体（dC）（rC）d（ATCG）的晶体结构为B型螺旋构象，类似于DNA对应物的双链。提出了一种B型RNA双链模型，其中2′-羟基的相互作用取决于其3′-侧核苷酸。

PDB参考:（dC）（rG）d（ATCG）–柔红霉素复合物，1jo2，r1jo2sf

NDB参考:DD0041号

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陈年干燥的T晶体的教训₆人胰岛素

G.D.史密斯和R.H.祝福

在室温下空气干燥的晶体中，如果没有有序的水结构，a链的N端就会部分展开。在室温和100K下，气干晶体中六聚体中心核心的大多数GluB13侧链都是无序的。

PDB参考:100千吨₆胰岛素，1os3，r1os3sf；295千吨₆胰岛素，1os4，r1os4sf

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2.15º分辨率下KCl/磷酸盐晶体中组蛋白-核心八聚体的结构

L.香塔拉特,J.M.尼科尔森,S.J.兰伯特,A.J.里德,M.J.多诺万,C.D.雷诺兹,C.M.木材和J.P.鲍德温

在KCl/磷酸盐中结晶的组蛋白核心八聚体的结构与核小体中的八聚体相比很好，但表现出独特的晶间嵌合相互作用。

PDB参考:组蛋白-核心八聚体，1hq3，r1hq3sf

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人工纳米级蛋白质结晶方法

J.I.Yeh是

报道了一种使用纳升体积的手动结晶方法。

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HFCD家族FAD结合蛋白MrsD的结构

M.布莱斯,T.库普克,R.Huber公司和斯坦巴赫

描述了2.54℃下LanD蛋白MrsD的结构。

PDB参考:D女士，1p3y，r1p3ysf

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洗涤剂和双亲对捕光I络合物溶解度的影响

M.A.Rosenow博士,D.布鲁纳和J.P.艾伦

研究发现，捕光I复合物在洗涤剂和两性化合物中最易溶解，也能产生蛋白质晶体。质谱法发现对结晶有效的两亲性物质可以取代结合洗涤剂。

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使用三碘化物、较软X射线和一些辐射损伤帮助SAD阶段化

G.埃文斯,波伦塔鲁蒂,K.Djinovic葡萄牙语和G.布里科内

猪胰腺弹性蛋白酶三碘化物衍生物在λ=2.0º时记录的低冗余SAD数据表明，碘重原子位置存在辐射损伤，可在夏普以增强相位信号。

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利用群-亚群关系对蛋白质结构进行定相

L.Di Costanzo先生,F.福内里斯,老年链球菌和L.兰达乔

利用多态性蛋白质晶体空间群之间的群-子群关系，求解了四螺旋束蛋白质的两种晶体形式的结构。

PDB参考:di-Co公司^二-DF1-L13A，形式1，1ovu，r1ovusf；di-Co公司^二-DF1-L13A，形式2，1ovv，r1ovvsf

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不借助XAFS测量使用MAD方法的实用定相程序：成功解决了外膜脂蛋白载体LolA的结构测定

K.武田,H.宫崎骏,N.横田,S.松山,H.德田和K.米奇

在不借助XAFS测量的情况下，成功地执行了MAD定相的实用程序，以解决外膜脂蛋白载体LolA的晶体结构大肠杆菌。

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木聚糖酶Xys1Δ的结构哈氏链霉菌

A.运河,M.C.织女星,F.X.戈米斯·吕斯,米亚兹,R.I.桑塔马利亚和M.科尔

催化结构域的三维结构以1.78º的分辨率报告，显示a（β/α）₈桶折叠，并与相关木聚糖酶进行比较。

PDB参考:Xys1Δ，1nq6，r1nq6sf

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2-酮-3-脱氧-6-葡糖磷酸（KDPG）醛缩酶的结构恶臭假单胞菌

B.J.贝尔,渡边长,J.L.Rios-Steiner公司,A.塔林斯基,莱比奥达和R.K.Arni公司

三聚体KDPG醛缩酶的晶体结构恶臭杆菌描述了Entner–Doudoroff途径中的一种I类Schiff-base形成酶。

PDB参考:KDPG醛缩酶，1mxs，r1mxssf

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一种四铜漆酶的结晶和初步X射线分析毛云芝菌

T.V.佩加索娃,P.兹瓦特,O.V.科洛列娃,E.V.斯蒂芬诺娃,D.V.雷布里科夫和V.S.兰津

一种四种含铜漆酶多毛梭菌结晶了。收集的数据分辨率为1.85º，并使用SAD方法获得了初始相。

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光系统Ⅱ放氧复合物中外源性23kDa蛋白的结晶和初步晶体学研究

K.Ifuku公司,T.Nakatsu公司,H.加藤和F.佐藤

光系统II的析氧复合物（OEC23）中的外源性蛋白质，烟草OEC23，通过具有PEG 4000的悬滴蒸汽扩散技术结晶，并收集到2.0Å的衍射数据。

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LC3-I的结晶和初步X射线分析

K.Sugawara（苏加瓦拉）,N.N.铃木,Y.藤冈,北水岛,Y.Ohsumi先生和F.稻垣祯一

LC3，一种参与哺乳动物细胞自噬的蛋白质，被结晶。收集的完整衍射数据集的分辨率极限为2.1º。

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S层蛋白SbsC C末端截断结构域的结晶和初步结构测定

T.巴夫科夫,M.Oberer先生,E.M.Egelseer先生,M.Sára先生,U.B.斯莱特和W.凯勒

S层蛋白SbsC的C末端截断结构域的晶体嗜热脂肪肝已获得。衍射数据从天然晶体收集到3.0º的分辨率，从铂衍生物收集到3.2º的精度。

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谷胱甘肽的结晶和初步X射线衍射研究S公司-转移酶来自恶性疟原虫

C.伯梅斯特,M.Perbandt先生,Ch.Betzel餐厅,R.D.沃尔特和E.利博

谷胱甘肽S公司-人类疟疾寄生虫的转移酶恶性疟原虫已经结晶，可以确定其X射线结构。

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羧酸酯酶Est30的结晶和初步X射线衍射数据嗜热脂肪芽孢杆菌

P.刘,Y.-F.王,H.E.尤斯,A.阿卜杜勒,C.D.卢和I.T.韦伯

羧酸酯酶Est30来自嗜热脂肪杆菌已在空间群中结晶C222₁，带有单位-细胞参数一= 55.83,b条= 58.15,c（c）= 179.65 Å. 晶体的衍射分辨率高于2.0º。

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mavicyanin的结晶和初步X射线晶体学研究西葫芦

Y.谢,井上T,宫本雅美,H.松村,卡托卡（K.Kataoka）,山口K,S.铃木和Y.Kai先生

重组蛋白mavicyanin西瓜对铜氧还蛋白中的一个植物色素亚类进行了结晶，并报道了其初步晶体学数据。

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人尿苷胞苷激酶2的结晶及初步X射线分析

N.N.铃木,小泉纯一郎,福岛M,A.松田和F.稻垣

人尿苷-胞苷激酶2单独或与配体形成六种结晶形式的复合物。一种形式衍射到1.8Å的分辨率。

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p47串联SH3结构域自抑制形式的结晶和初步晶体学分析^{凤凰（phox）}

南越泽,N.N.铃木,Y.藤冈,K.Ogura公司,H.住本和F.稻垣祯一

p47串联SH3结构域的一种自抑制形式^{凤凰（phox）}吞噬细胞NADPH氧化酶调节成分已结晶，X射线衍射数据已使用同步辐射收集到2.1º分辨率。

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芙蓉褪绿环斑病毒的纯化、结晶及X射线分析

K.-C.李,D.林,S.-M.Wong先生和T.多克兰

芙蓉褪绿环斑病毒（HCRSV），家族成员猪病毒科已被提纯并随后在太空群中结晶P（P）23

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分子内LMO4–ldb1复合物FLINC4的结晶

J.E.迪恩,M.J.马赫,D.B.兰利,S.C.格雷厄姆,J.E.维斯瓦德,J.M.格斯和J.M.马修斯

一个分子内复合物由来自两个转录调控因子LMO4和ldb1的相互作用域组成，已经结晶。除了MAD数据达到1.7º分辨率外，还收集了1.3º分辨率的数据。

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金针菇真菌免疫调节蛋白Fve的结晶及初步X射线晶体学研究(金针菇)

S.V.Seow公司,I.-C.郭台铭,帕瓦文坦,P.R.科拉特卡尔和蔡国耀（K.Y.Chua）

食用金针菇真菌免疫调节蛋白Fve的晶体(金针菇)已经获得并衍射到1.4Å的分辨率。

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KsgA（一种普遍保守的RNA腺嘌呤二甲基转移酶）的结晶和初步X射线衍射分析大肠杆菌

H.C.奥法雷尔,F.N.穆萨耶夫,J.N.斯卡斯代尔,H.T.赖特和J.P.里夫

KsgA是一种普遍存在的rRNA二甲基转移酶，已在空间群中结晶C2，带单位-细胞参数一= 173.9,b条= 38.4,c（c）= 83.0 Å, β = 90.0°. X射线数据用铜收集到1.9ºK（K）α辐射。

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限制性内切酶结晶Sfi公司我与DNA复杂

H.维亚迪,É. S.Vanamee公司,E.M.雅各布森,一、席尔德克劳特和A.K.阿加瓦尔

四聚体IIF限制性内切酶的结晶Sfi公司我与DNA复合物被报道。

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人梨红素的纯化、结晶及初步X射线分析

Q.曾,十、李,M.Bartlam先生,G.王,H.庞和Z.饶

人pirin是一种新型的高度保守的核蛋白，已被克隆、表达、纯化并以聚乙二醇为沉淀剂结晶。

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PL-7家族成员褐藻酸裂解酶的结晶和初步X射线分析铜绿假单胞菌

山崎实,S.Moriwaki公司,W.桥本,B.米卡米和K.村田

褐藻酸裂解酶（PL-7家族）的结晶和初步X射线表征铜绿假单胞菌显示了。

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与男性生育力和帕金森综合征相关的蛋白DJ-1的结晶和初步晶体学分析

K.Honbou公司,铃木N.N,M.Horiuchi先生,T.泰拉,T.尼基,H.阿里加和F.稻垣祯一

人类DJ-1，一种与男性生育能力和帕金森综合征相关的蛋白质已经结晶。收集的数据集分辨率为2.00Ω。

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猪繁殖与呼吸综合征病毒核衣壳N蛋白结构域的克隆、表达、纯化、结晶及初步X射线衍射分析

D.N.P.Doan博士和T.多克兰

PRRSV核衣壳N蛋白的结构域在大肠杆菌并以2.7º的分辨率收集了完整的原生数据集。

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新生霉素生物合成簇dTDP糖差向异构酶NovW的结晶和初步X射线研究球形链霉菌

P.贾基莫维奇,C.L.Freel Meyers公司,C.T.沃尔什,M.J.巴特纳和D.M.劳森

一种推定的dTDP糖差向异构酶（NovW），来自球形链球菌与新生霉素生物合成有关，在大肠杆菌获得了纯度和晶体衍射X射线至2.0º分辨率。

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提纯、结晶和初步X射线分析大肠杆菌UDP协议-N个-乙酰鼠酰：L（左）-丙氨酸连接酶（MurC）

T.德瓦,K.D.普赖尔,B.雷廷,E.N.贝克和C.A.史密斯

MurC负责添加肽聚糖的五肽单元的第一步。天然和SeMet晶体大肠杆菌制备了酶。

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F因子TraI松弛区的结晶和初步X射线表征

C.拉金,S.达塔,A.内扎米,J.A.多姆和J.F.席尔德巴赫

结合质粒F因子TraI蛋白的36kDa松弛酶结构域已通过坐滴法结晶为天然形式和硒代蛋氨酸取代形式。三角晶体的数据集已收集到天然蛋白质的2.5º分辨率和硒蛋氨酸蛋白质的3.1º分辨率。

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磷酸转乙酰酶的表达、纯化、结晶及初步X射线分析甲烷八叠球菌

P.P.伊耶,S.H.劳伦斯,H.P.Yennawar先生和J.G.Ferry公司

磷酸三乙酰化酶首次结晶。酶来自嗜热分枝杆菌在太空小组中结晶我4₁，带有单位-细胞参数一=b条=114.8，c（c）= 127.8 Å, α = β = γ = 90°; 晶体衍射到2.5º的分辨率。

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分辨率为1.8°的U1A RNA-结合域

P.B.鲁珀特,H.肖和A.R.Ferré-达马雷

与RNA结合有关的C末端螺旋已被证明在之前的游离U1A溶液结构中封闭了结合表面。游离蛋白的一个新的1.8°分辨率结构显示，螺旋位于与RNA-结合复合物相同的位置。

PDB参考:U1A RNA结合域，1nu4，r1nu4sf

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5-碘-2′-脱氧尿苷掺入对d[CACG（IDU）G]结构影响的探讨

G.舒尔曼,K·范·赫克和L.Van Meervelt先生

5-碘-2′-脱氧尿苷（IDU）是第一个抗1型和2型单纯疱疹病毒的核苷。d[CACG（IDU）G]的结构揭示了两种钴六胺络合物的结合模式，类似于其他含钴六胺的Z-DNA片段。

PDB参考:d[CACG（IDU）G]，1omk，r1omksf

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β-甲壳胺，龙虾壳的蓝紫色胡萝卜素蛋白：考虑蛋白结合虾青素的底色变化

P.F.扎加尔斯基

蛋白结合虾青素的构象变化和氢键被认为是导致龙虾壳胡萝卜素蛋白β-壳聚糖呈紫蓝色的主要因素。带有环戊烯二酮环的类胡萝卜素的可见光谱还有待解释。

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血红蛋白疾病、分子方法和方案

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莱纳斯·鲍林（Linus Pauling）科学论文精选

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