生物序列分析中的K-mer计数和聚类

公里是用于快速计算距离矩阵和使用快速无对齐k-mer计数和递归k表示分区。

要下载公里从CRAN加载程序包，运行

安装.包("公里")图书馆("公里")

从下载开发版本GitHub，首先确保C/C++编译器可用，并且开发工具R包已安装。Linux用户通常会默认安装编译器；但是Windows用户可能需要下载R工具和MacOSX用户需要X代码（请注意，这些不是R包）。要下载并安装devtools，请运行

安装.包("开发工具")

这个公里然后可以通过运行

开发工具::安装github("肖普威尔金森/kmer") 图书馆("公里")

运行以下命令可以查看包及其功能的概述

?公里

要查看教程，您可以运行

渐晕("kmer渐晕")

或直接从CRAN（起重机）.

如果您在使用此软件包时遇到问题，请随时将其作为问题提出github.感谢您的任何反馈。

该软件是在惠灵顿维多利亚大学由卢瑟福基金会博士后研究奖学金资助新西兰皇家学会颁发的奖项。