翻译依赖性和非依赖性信使核糖核酸衰变通过核糖体密度定义的互斥途径发生T细胞激活
- 布兰丁·C·梅西耶1,
- Emmanuel Labaronne公司2,
- 大卫·克鲁特2,
- 劳拉·吉格塔兹2,
- 尼古拉斯·丰罗多纳2,
- 艾丽西娅·比克内尔1,
- 安托万·科尔宾三,
- 梅兰妮·温克三,
- 法比安·奥贝2,
- 劳伦特·莫多洛2,
- 卡琳娜·朱拉夫列娃2,
- 迪迪埃·奥博夫2,
- 梅利莎·J·摩尔1和
- 埃米利亚诺·P·里奇2,4
-
1马萨诸塞大学医学院RNA治疗研究所；
-
2里昂ENS；
-
三ENS de Lyon，国际传染病研究中心
↵*通讯作者；电子邮件：埃米利亚诺·里奇{网址}ens-lyon.org
摘要
在mRNA质量控制途径和功能性mRNA的降解。通过密码子使用、核糖体碰撞和核糖体对特定蛋白质的补充是mRNA转换的重要决定因素。然而翻译依赖性（TDD）和独立性（TID）mRNA衰变途径参与mRNA的降解尚未被证实还没有研究过。在这里，我们描述了对小鼠原发性CD4中基础和信号诱导的TDD和TID的综合分析+T细胞。我们的结果表明，大多数细胞转录物在一定程度上以翻译依赖的方式衰减。我们的分析进一步确定了非翻译区的长度、核糖体的密度和GC3含量是重要的TDD大小的决定因素。一直以来，所有在编码范围内发生核糖体密度变化的转录物T细胞激活后的序列显示其TDD水平的相应变化。此外，我们还揭示了一种动态调制GC3含量和TDD对T细胞激活的关系，GC3和AU3富集的影响发生逆转密码子。总之，我们的数据表明哺乳动物的mRNA翻译和衰变之间存在着强大的动态联系原代细胞。
- 收到2023年3月7日。
- 认可的2024年3月9日。
