susieR:单效应线性回归之和

实现线性变量选择方法基于“单一效应总和”(SuSiE)模型的回归Wang等人(2020年)对此进行了描述<doi:10.1101/501114>和Zou等人(2021) <doi:10.1101/20211.11.03.467167>. 这些方法提供简单摘要,称为“可信集”,用于准确地量化应选择哪些变量的不确定性。这些方法的动机是遗传精细地图的应用,和特别适用于变量高度相关和可检测的效果很少。配件算法,逐步选择方法的贝叶斯模拟被称为“迭代贝叶斯逐步选择”(IBSS),很简单并且速度快,允许SuSiE模型适合大型数据集(数千个样本和数十万个变量)。

版本: 0.12.35
取决于: R(≥3.0.0)
进口: 方法,图形,grDevices,统计数据,矩阵,矩阵统计,混合sqp,重塑,蜡笔,ggplot2
建议: 卷曲,测试那个,微基准,针织物,市场营销,快速,奶牛场
出版: 2023-02-17
内政部: 10.32614/CRAN.包装.使用
作者: 高旺[aut],邹玉新[aut],张凯谦[aut],彼得·卡博内托[aut,cre],马修·斯蒂芬斯
维护人员: 彼得·卡博内托(Peter Carbonetto)<Peter.Carbonetto at gmail.com>
错误报告: https://github.com/stephenslab/susieR/issues
许可证: BSD_3_条款+文件许可证
网址: https://github.com/stephenslab/susieR
需要编译:
引用: susieR引文信息
材料: 自述文件
CRAN检查: susieR结果

文件:

参考手册: 苏西埃R.pdf
渐晕图: 使用汇总统计数据进行精细映射
精细映射示例
最小示例
使用稀疏矩阵运算的SuSiE
优化SuSiE模型
比较susie_rss变量
使用摘要统计数据进行精细映射的诊断
趋势过滤演示
SuSiE趋势过滤的实现

下载内容:

包源: 可持续性R_0.12.35.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:苏西R_0.12.35.zip,r版本:苏西R_0.12.35.zip,r-oldrel:苏西R_0.12.35.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):苏西R_0.12.35.tgz,r-oldrel(arm64):苏西R_0.12.35.tgz,r-版本(x86_64):苏西R_0.12.35.tgz,r-oldrel(x86_64):苏西R_0.12.35.tgz
旧来源: susieR存档

反向依赖关系:

反向进口: 哥伦比亚

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