ssMutPA:基于单样本突变的通路分析
一种系统生物信息学工具,通过将体细胞突变数据与蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络相结合,进行基于单样本突变的途径分析。在该方法中,我们根据网络拓扑结构,使用局部和全局加权策略评估突变产生的网络基因的影响,然后计算基于突变的路径富集分数(ssMutPES),以反映每个路径的突变累积效应。随后,ssMutPES谱用于无监督光谱聚类,以识别癌症亚型。
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