nosoi:一种基于前向代理的传输链模拟器

“nosoi”(发音为no.si)的目的是提供一个灵活的基于代理的随机传播链/流行病模拟器(Lequime等人,《生态学与进化方法》11:1002-1007)。它是以希腊神话中逃离潘多拉坛子的瘟疫、疾病和疾病的雏菊命名的。”nosoi’能够单独或综合考虑多种变量对传播过程的影响(例如双宿主系统(如虫媒病毒),包括宿主病毒动力学、运输、种群结构),以创建复杂但相对直观的流行病学模拟。

版本: 1.1.2
取决于: 数据表(≥1.12.0),R(≥3.5.0)
进口: 统计(≥3.5.2)、方法(≥3.5.1)、,光栅(≥ 2.8-19)
建议: 测试那个(≥ 2.1.0),针织物rmarkdown公司记录仪ggplot2gg网络分界线翡翠色吉夫斯基png公司gganimate(gg动画)(≥5.3),潮树(≥ 0.3.3),树(treeio)(≥ 1.14.0),ggtree(ggtree)(≥2.4.0),马格里特(≥ 1.5),数字播放器(≥ 0.8.0),覆盖(covr)
出版: 2024-02-09
作者: 塞巴斯蒂安·勒基姆ORCID标识[aut,cre],保罗·巴斯蒂德ORCID标识[aut],西蒙·德利科尔ORCID标识[aut],菲利普·莱米ORCID标识[aut],盖伊·贝尔ORCID标识[aut],Thijs Janzen女士ORCID标识【ctb】
维护人员: 塞巴斯蒂安·勒奎姆(Sebastian Lequime)<Sebastian.Lequime at gmail.com>
错误报告: https://github.com/slequime/nosoi/issues
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/slequime/nosoihttps://slequime.github.io/nosoi网站/
需要编译:
语言: 英语-美国
引用: nosoi引文信息
材料: 新闻
在视图中: 流行病学
CRAN检查: nosoi结果

文档:

参考手册: 编号.pdf
渐晕图: 病原体在连续空间中的传播
病原体在离散结构人群中的传播
病原体在同质人群中的传播
入门
输出和总结

下载内容:

包源: nosoi_1.1.2.tar.gz号
Windows二进制文件: r-devel公司:nosoi_1.1.2.zip编号,r版本:nosoi_1.1.2.拉链,r-oldrel:nosoi_1.1.2.zip编号
macOS二进制文件: r释放(arm64):nosoi_1.1.2.tgz,r-oldrel(arm64):nosoi_1.1.2.tgz,r-release(x86_64):nosoi_1.1.2.tgz,r-oldrel(x86_64):nosoi_1.1.2.tgz
旧来源: nosoi存档

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