星云:使用大样本近似的负二项混合模型用于ScRNA-Seq数据的差异表达分析

一种快速负二项混合模型,用于对多主题单细胞数据进行关联分析。它可以用于识别标记基因、差异表达和共表达分析。该模型包括主题级随机效应,以解释多主题单单元格数据中的层次结构。参见He等人(2021)<doi:10.1038/s42003-02146-6>.

版本: 1.5.3
取决于: R(≥4.1)
进口: 卢比(≥ 1.0.7),nloptr公司,统计,矩阵、方法、,快速,信任,平行地(≥ 1.34.0),do未来(≥ 0.12.2),未来(≥1.32.0),foreach公司(≥ 1.5.2),doRNG公司(≥ 1.8.6),修拉,单细胞实验
链接到: 卢比,RcppEigen基因
建议: 针织物,实用程序,rmarkdown公司
出版: 2024-02-15
内政部: 10.32614/CRAN.package.nebula公司
作者: 梁河[aut,cre],拉加夫·夏尔马
维护人员: 梁河<hyx520101 at gmail.com>
错误报告: https://github.com/lhe17/nebua/issues
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/lhe17/星云
需要编译:
材料: 自述文件
CRAN检查: 星云结果

文档:

参考手册: 星云.pdf
守夜人: 用于分析多主题单细胞数据的快速负二项混合模型

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旧来源: 星云档案

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