mnda:多路网络差分分析(mnda)
不同生物实体之间的相互作用对生物系统的功能至关重要。在这样的网络中,节点代表生物元素,如基因、蛋白质和微生物,它们的相互作用可以通过边来定义,边可以是二元的,也可以是加权的。这些网络的失调可能与不同的临床条件有关,例如疾病和治疗反应。然而,这种变化经常发生在本地,并不涉及整个网络。为了捕获此类网络的局部变化,我们提出了多重网络差分分析(MNDA)。MNDA可以量化两种给定临床状态之间每个节点(例如基因)局部邻域的变化,并测试这种变化的统计显著性。Yousefi等人(2023年)<doi:10.1101/2023.01.22.525058>.
版本: |
1.0.9 |
进口: |
断言,记录仪,矩阵,珊瑚礁,张量流,网状的,MASS(质量),gggraph图,ggplot2,聚合,用这个,马格里特,统计,图形 |
出版: |
2023-01-25 |
内政部: |
10.32614/CRAN.包装.mnda |
作者: |
贝纳姆·优素菲[aut,cre,cph],Farzaneh Firoozbakht[奥特] |
维护人员: |
贝纳姆·优素福(Behnam Yousefi)<Yousefi.bme at gmail.com> |
许可证: |
GPL(≥3) |
需要编译: |
不 |
CRAN检查: |
mnda结果 |
文档:
下载内容:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=mnda链接到此页面。