longreadvqs:基于长序列数据的病毒准种比较

进行多种病毒准种多样性分析[见Gregori等人(2016)<doi:10.1016/j.virol.2016.03.017>]基于长读取序列对齐。主要功能包括1)测序错误最小化和读取采样,2)单核苷酸变异(SNV)谱比较,以及3)病毒准种谱比较和可视化。

版本: 0.1.2
取决于: R(≥2.10)
进口: ,生物管柱,奶牛场,dplyr公司,ggplot2,ggpubr公司,gr设备,马格里特,胶合板,呜呜声,QSutils公司,R彩色啤酒,重塑2,规模,顺序,统计,字符串主义者,字符串,易怒的,第三年
建议: 针织物,rmarkdown公司,测试那个(≥ 3.0.0)
出版: 2024-04-14
作者: Nakarin Pamornchainavakul公司ORCID标识[aut,cre]
维护人员: Nakarin Pamornchaineavakul<pamornakarin at gmail.com>
错误报告: https://github.com/NakarinP/longreadvqs/问题
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/NakarinP/longreadvqs网址
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材料: 自述 新闻
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渐晕图: longreadvqs-vignette简介

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