landsepi:景观流行病学和进化

模拟传播和进化的随机、空间显式的示范遗传模型在异质景观中评估植物病原菌的抗性部署策略。它基于空间几何学来描述景观和不同品种的分配,传播病原体的扩散核和SEIR具有离散时间步长的(“易感-暴露-感染-清除”)结构。它提供了一个有用的工具来评估各种部署选项的性能对其流行病学、进化和经济结果的尊重。Loup Rimbaud、Julien Papaix、Jean-François Rey、Luke G Barrett、,Peter H Thrall(2018)<doi:10.1371/journal.pcbi.1006067>.

版本: 1.4.0
取决于: R(≥4.2.0),服务提供商(≥ 1.0-17)
进口: methods、utils、stats(≥3.0.2)、grDevices(≥3.0)、graphics(≥3.0.0)、parallel、,卢比(≥ 0.9.0),矩阵(≥1.3-0),mvtnorm公司,领域,内脏,平方英尺,数据库接口,RSQ网站,foreach公司,do并行,解算
链接到: 卢比,测试那个
建议: 测试那个(≥ 3.0.0),闪亮的,闪耀(shinyjs),DT公司,针织物,rmarkdown公司
出版: 2024-03-12
内政部: 10.32614/CRAN.包装.landsepi
作者: Loup兰波ORCID标识[aut],朱利安·帕帕瓦,Jean-François Rey女士ORCID标识[aut,cre],玛尔塔·扎法罗尼ORCID标识【ctb】,珍妮·卢普·高森,马农郡
维护人员: Jean-François Rey<Jean-francois.Rey at inrae.fr>
错误报告: https://gitlab.paca.inae.fr/CSIRO-INRA/landsepi/-/issues网站
许可证: GPL-2型|GPL-3公司|文件许可证[扩展自:GPL(≥2)|文件许可证]
网址: https://csiro-inra.pages.biosp.inrae.fr/landsepi网址/,https://gitlab.paca.inae.fr/CSIRO-INRA/landsepi网站
需要编译:
系统要求: C++,gsl
引用: landsepi引文信息
材料: 新闻
在视图中: 农业
CRAN检查: landsepi结果

文档:

参考手册: landscape.pdf
渐晕图: 1-运行简单模拟
2-进行数值实验设计
3-参数化景观和分散
4-使用带有混合繁殖系统的病原体运行简单模拟
6-海报
5-参数列表

下载内容:

包源: landsepi_1.4.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:landsepi_1.4.0.zip,r版本:landsepi_1.4.0.zip,r-oldrel:landsepi_1.4.0.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):landsepi_1.4.0.tgz,r-oldrel(arm64):陆地景观_1.4.0.tgz,r-版本(x86_64):陆地景观_1.4.0.tgz,r-oldrel(x86_64):landsepi_1.4.0.tgz
旧来源: landsepi档案

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