实施一个通用框架,通过基于系统发生学的零模型分析(缩写为“iCAMP”)定量推断社区组装机制(Ning等人,2020年)<doi:10.1038/s41467-020-18560-z>. 它可以定量评估不同群落组装过程的相对重要性,例如选择、扩散和漂移,对于群落和每个系统发育类群(“bin”)。每个箱子通常由一个科或一个目的不同分类群组成。该软件包还提供了实现一些其他已发布方法的功能,包括中性分类群百分比(Burns等人,2016年)<doi:10.1038/ismej.2015.142>基于中立理论模型,并基于整体社区零模型量化装配过程(“QPEN”,Stegen等人2013)<doi:10.1038/ismej.2013.93>. 它还包括一些方便的功能,特别是对于大数据集,如在群落和库水平上的系统发育和分类零模型分析、分类群之间的生态位差异和系统发育距离计算、系统发育组内的系统发育信号测试、大树的中点根等。1.3.x版主要改进了“QPEN”的函数,并添加了函数“icamp.cate()”,以总结不同分类单元(例如核心分类单元与稀有分类单元)的“icamp”结果。
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