hwep:多倍体中的Hardy-Weinberg平衡

关于平衡和随机交配的推断同源多倍体。有可用的方法来测试平衡在任何偶数倍性水平(>2)随机交配双等位基因座的双重还原。对于同源多倍体群体在平衡状态下,可以使用方法来估计双重还原。我们还提供了计算基因型的函数平衡时的频率,或在一轮或几轮随机交配,给定双倍减重率。主要功能是hwefit()。本材料基于国家科学基金,批准号:2132247。意见,所表达的结论或建议是作者,并不一定反映国家科学基金会。有关这些方法的详细信息,请参见杰拉德(2022a)<doi:10.1111/biom.13722>和杰拉德(2022b)<数字对象标识代码:10.1101/2022.08.11.503635>.

版本: 2.0.2
取决于: R(≥3.4.0)
进口: 桥式取样,do未来,doRNG公司,foreach公司,未来,迭代器、方法、,普拉克马,卢比(≥ 0.12.0),Rcpp并行(≥ 5.0.1),rstan公司(≥ 2.18.1),甾醇(≥ 2.2.0),张力,更新日志
链接到: 伯克希尔哈撒韦(≥ 1.66.0),卢比(≥ 0.12.0),RcppEigen基因(≥ 0.3.3.3.0),Rcpp并行(≥ 5.0.1),rstan公司(≥ 2.18.1),StanHeaders公司(≥2.18.0)
建议: 测试那个(≥ 3.0.0),覆盖(covr),针织物,rmarkdown公司,ggplot2
出版: 2023-05-16
内政部: 10.32614/CRAN.包装.hwep
作者: 大卫·杰拉德ORCID标识[aut,cre],美国国家科学基金会DBI 2132247[fnd](https://www.nsf.gov/awardsearch/showAward?AWD_ID=2132247)
维护人员: 大卫·杰拉德(David Gerard)<Gerard.1787,gmail.com>
错误报告: https://github.com/dcgerard/hwep/issues
许可证: GPL(≥3)
网址: https://dcgerard.github.io/hwep/
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系统要求: GNU品牌
引用: hwep引文信息
材料: 自述文件 新闻
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参考手册: hwep.pdf软件
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旧来源: hwep存档

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