hilldiv：基于Hill数的多样性积分分析

基于希尔数的多样性分析、比较、可视化和划分工具。“hilldiv”是一个R包，它提供了一组函数来帮助分析饮食重建、微生物群落分析或更一般的生态系统特征基于Hill数的分析，使用OTU/ASV表和相关的系统发育树作为输入。该软件包包括（phylo）分集测量、（phylo-）分集功能剖面图，样本和群体之间的（门）多样性比较，（门）多样性划分和（dis）相似性度量。所有这些都基于丰度和基于发病率的Hill数。围绕希尔数字开发的统计框架涵盖了大多数广泛使用的多样性（例如丰富度、香农指数、辛普森指数），系统发育多样性（如Faith的PD、Allen的H、Rao的二次熵）和差异性（例如Sorensen指数、Unifrac距离）指标。这使得基于单一统计数据的多样性通用分析Jost等人（2007）对这些方法进行了描述<doi:10.1890/06-1736.1>,Chao等人（2010）<doi:10.1098/rstb.2010.0272>和Chiu等人（2014）<doi:10.1890/12-0960.1>; 并在分子表征的框架内进行了综述阿尔贝迪和吉尔伯特的生物系统（2019）<doi:10.1111/1755-0998.13014>.

版本：	1.5.1
取决于：	R（≥3.1.0）
进口：	统计数据，ggplot2，规模，ggpubr公司，R彩色啤酒，数据表，猿，素食主义者，盖革，q图，金融服务管理局
出版：	2019-10-01
作者：	安托·阿尔贝蒂[aut，cre]
维护人员：	Antton Alberdi<Antton.Alberdi at bio.ku.dk>
错误报告：	https://github.com/anttonalberdi/hilldiv/issues网站
许可证：	GPL-3公司
网址：	https://github.com/anttonalberdi/hilldiv网址
需要编译：	不
引用：	希尔迪夫引文信息
CRAN检查：	希尔迪夫结果

文档：

参考手册：

希尔迪夫.pdf

下载内容：

包源：	希尔迪夫_1.5.1.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：hilldiv_1.5.1.zip，r版本：希尔迪夫_1.5.1.zip，r-oldrel：hilldiv_1.5.1.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：希尔迪夫1.5.1.tgz，r-oldrel（arm64）：希尔迪夫1.5.1.tgz，r-release（x86_64）：希尔迪夫1.5.1.tgz，r-oldrel（x86_64）：希尔迪夫1.5.1.tgz

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