hacksig:一个流行的黑客基因表达特征框架

癌症转录组学基因签名集以及简单整洁的界面可用于计算单个样本的富集分数使用原始程序或三种备选方案:Lee等人(2008)的“综合z评分”<doi:10.1371/journal.pcbi.1000217>,芭比等(2009)的“单一样本GSEA”<doi:10.1038/nature08460>和Foroutan等人(2018)的“singscore”<doi:10.1186/s12859-018-2435-4>.“get_sig_info()”函数可用于检索每个已实现签名。

版本: 0.1.2
取决于: R(≥4.0)
进口: 数字播放器(≥ 1.0.7),未来应用程序(≥ 1.8.1),爱尔兰航空公司(≥0.4.11),统计值(≥4.0.5),易怒的(≥ 3.1.5),第三年(≥ 1.1.4)
建议: 覆盖(covr),未来(≥ 1.22.1),ggplot2(≥ 3.3.5),针织物(≥1.36),msigdbr(≥ 7.4.1),呜呜声(≥ 0.3.4),rmarkdown公司(≥2.11)
出版: 2022-02-17
内政部: 10.32614/CRAN.包装.黑客签名
作者: 安德烈亚·卡伦佐ORCID标识[aut,cre],洛里斯·德·塞科ORCID标识[aut],费德里科·皮斯托尔
维护人员: 安德烈亚·卡伦佐(Andrea Carenzo)
错误报告: https://github.com/Acare/hacksig/issues网站
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
网址: https://github.com/Acare/hacksig
需要编译:
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: hacksig结果

文档:

参考手册: hacksig.pdf
渐晕图: hacksig简介

下载内容:

包源: 黑客代码_0.1.2.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:hacksig_0.1.2.zip,r版本:hacksig_0.1.2.zip,r-oldrel:hacksig_0.1.2.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):hacksig_0.1.2.tgz,r-oldrel(arm64):hacksig_0.1.2.tgz,r-release(x86_64):hacksig_0.1.2.tgz,r-oldrel(x86_64):hacksig_0.1.2.tgz
旧来源: hacksig档案

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