gemma2:GEMMA多元线性混合模型

根据Zhou&Stephens(2014),拟合了使用多基因术语的多元线性混合效应模型(<https://www.nature.com/articles/nmeth.2848>). 特别有趣的是用限制最大似然(REML)方法估计方差分量。“gemma2”软件包中实现的全基因组高效混合模型关联(GEMMA)使用期望最大化算法进行方差分量推断,用于数量性状位点研究。

版本: 0.1.3
进口: 方法,矩阵
建议: 覆盖(covr),测试那个,针织物,rmarkdown公司,阅读器
出版: 2020-10-24
内政部: 10.32614/CRAN.package.gemma2程序包
作者: 弗雷德里克·博姆ORCID标识[aut,cre]
维护人员: 弗雷德里克·博姆(Frederick Boehm)<Frederick.Boehm at gmail.com>
错误报告: https://github.com/fboehm/gemma2/issues网站
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
网址: https://github.com/fboehm/gemma2
需要编译:
语言: 英语-美国
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: gemma2结果

文档:

参考手册: gemma2.pdf格式
渐晕图: gemma2产量与周氏GEMMA产量的比较

下载内容:

包源: 宝石2_0.1.3.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:gemma2_0.1.3.zip,r版本:gemma2_0.1.3.zip,r-oldrel:gemma2_0.1.3.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):宝石2_0.1.3.tgz,r-oldrel(arm64):宝石2_0.1.3.tgz,r-release(x86_64):宝石2_0.1.3.tgz,r-oldrel(x86_64):宝石2_0.1.3.tgz
旧来源: gemma2存档

反向依赖关系:

反向进口: qtl2pleio个

链接:

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