表观增长拟合:流行病增长的非线性混合效应模型

非线性混合效应模型的极大似然估计使用模板模型生成器('TMB')进行疫情增长。使能够疾病发病时间序列集合的联合估计,包括描述多个疫情波的时间序列。支持一组广泛使用的现象学模型:指数、,logistic,Richards(广义logistic),次指数,和Gompertz。提供查询模型对象的方法和几个辅助功能,包括一个用于计算基本初始指数拟合值的再生数增长率。应用了该软件的初步版本Ma等人(2014)<doi:10.1007/s11538-013-9918-2>和in Earn等人(2020年)<doi:10.1073/pnas.2004904117>.

版本: 0.15.3
取决于: R(≥4.3)
进口: 矩阵(≥ 1.6-2),TMB公司、gr设备、图形、方法,nlme公司,统计,工具,实用程序
链接到: RcppEigen基因(≥ 0.3.4.0.0),TMB公司
出版: 2024-06-18
内政部: 10.32614/CRAN.包装.管道安装
作者: 米凯尔·贾根ORCID标识[aut,cre],本·博尔克ORCID标识[aut],乔纳森·达舍夫ORCID标识【ctb】,大卫·厄恩ORCID标识【ctb】,马俊陵
维护人员: 米凯尔·贾根(Mikael Jagan)
错误报告: https://github.com/davidern/epirowthfit/issues
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/davidearn/epigrowthfit
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材料: 新闻
CRAN检查: 表观生长拟合结果

文档:

参考手册: 表观fit.pdf

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macOS二进制文件: r释放(arm64):表观生长fit 0.15.3.tgz,r-oldrel(arm64):表观生长fit 0.15.3.tgz,r-release(x86_64):表观生长fit 0.15.3.tgz,r-oldrel(x86_64):表观生长fit 0.15.3.tgz
旧来源: 表观生长适合存档

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