细胞成像仪:基于图像的细胞轮廓分析方法

典型的形态分析数据集有数百万个细胞每个单元有数百个功能。使用此数据时,必须清理数据,规范化特征,使其具有可比性实验,转换特征,根据特征选择特征质量,并根据需要聚合单单元格数据。”细胞仪制造这些步骤又快又容易。现场实践中使用的方法有在Caicedo(2017)中讨论<doi:10.1038/nmeth.4397>. 概述该字段在Caicedo(2016)中介绍<doi:10.1016/j.copbio.2016.04.003>.

版本: 0.2.2
取决于: R(≥3.3.0)
进口: 插入符号(≥ 6.0.76),do并行(≥ 1.0.10),数字播放器(≥ 0.8.5),foreach公司(≥ 1.4.3),无用的日志(≥ 1.4.3),马格里特(≥1.5),矩阵(≥ 1.2),呜呜声(≥ 0.3.3),爱尔兰航空公司(≥ 0.4.5),易怒的(≥ 2.1.3),第三年(≥ 1.0.2)
建议: 数据库接口(≥ 0.7),dbplyr公司(≥ 1.4.2),针织物(≥ 1.17),懒惰的(≥ 0.2.0),阅读器(≥ 1.1.1),rmarkdown公司(≥ 1.6),RSQ网站(≥2.0),字符串(≥ 1.2.0),测试那个(≥ 1.0.2)
出版: 2020-05-09
内政部: 10.32614/CRAN.package.cytominer公司
作者: 蒂姆·贝克尔,艾伦·古德曼[aut],克莱尔·麦克奎因,穆罕默德·罗班〔aut〕,尚塔努·辛格
维护人员: 桑塔努·辛格(Shantanu Singh)<shsingh at broadinstitute.org>
错误报告: https://github.com/cytomining/cytominer/issues
许可证: BSD_3_条款+文件许可证
网址: https://github.com/cytomining/cytominer网站
需要编译:
材料: 自述 新闻
CRAN检查: 细胞仪结果

文档:

参考手册: 细胞仪.pdf
渐晕图: 细胞涂片机简介

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旧来源: 细胞描记器档案

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