bulkAnalyseR:用于批量排序数据的交互式闪亮应用程序

给出一个批量测序实验的表达矩阵,对其进行预处理,并为交互式数据创建闪亮的应用程序分析和可视化。该应用程序包含质量检查,差异表达分析,火山和交叉图,富集分析和基因调控网络推断,用户可以自定义包含更多面板。

版本: 1.1.0
取决于: R(≥4.0)
进口: ggplot2,闪亮的,g配置文件2,边缘R,设计2,统计,gg排斥,实用程序,R彩色啤酒,复杂热图,绕圈子,网格,闪亮小工具,闪耀的(shinyjqui),数字播放器,马格里特,gg力,拉朗,,预处理核心,矩阵统计,吵闹的,易怒的,gg新闻量表,ggrastr公司,第3代,visNetwork(可视网络),DT公司,规模,闪耀(shinyjs),第三年,闪亮LP,UpSetR(升级程序),字符串,ggVenn图
建议: rmarkdown公司,针织物,发光体,生物技术经理,注释Dbi,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,读xl,测试那个(≥ 3.0.0)
出版: 2022-12-15
内政部: 10.32614/CRAN.package.bulkAnalyseR公司
作者: 伊利亚斯·穆索普洛斯[aut,cre],埃莉诺·威廉姆斯,伊琳娜·莫霍里亚努[aut,ctb]
维护人员: 伊利亚斯·穆索普洛斯(Ilias Moutsopoulos)<im383 at cam.ac.uk>
错误报告: https://github.com/Core-Bioinformatics/bulkAnalyseR/issues
许可证: GPL-2基因
网址: https://github.com/Core-Bioinformatics/bulkAnalyzerR
需要编译:
材料: 自述
CRAN检查: bulkAnalyzer结果

文档:

参考手册: bulkAnalyseR.pdf文件
渐晕图: 从GEO数据集创建bulkAnalyzer应用程序的初学者指南
bulkAnalyzerR:集成多组分或外部数据
bulkAnalyseR:一个可访问的交互式管道,用于分析和共享批量测序结果

下载内容:

包源: 散货分析R_1.1.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:bulkAnalyseR_1.1.0.zip,r版本:批量分析_1.1.0.zip,r-oldrel:bulkAnalyseR_1.1.0.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):批量分析_1.1.0.tgz,r-oldrel(arm64):散货分析R_1.1.0.tgz,r-release(x86_64):散货分析R_1.1.0.tgz,r-oldrel(x86_64):散货分析R_1.1.0.tgz
旧来源: bulkAnalyzer存档

链接:

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