区块森林:区块森林:临床和Omics区块的随机森林协变量数据

针对使用块结构预测二进制、存活和连续结果协变量数据,例如,临床协变量加上特定组学数据类型或多组学数据,即每个患者都有不同类型的组学数据和/或临床数据。示例不同的组学数据类型包括基因表达测量、突变数据以及拷贝数变化测量。Hornung&Wright(2019年)介绍了块状森林。该套餐包括四个多经济体数据的其他随机森林变量:“RandomBlock”、“BlockVarSel”、,“VarProb”和“SplitWeights”。Hornung&Wright(2019)也考虑了这些因素,但在基于20个真实值的比较研究中,表现不如块林多组学数据集。因此,我们建议使用区块森林(“区块森林”)在应用程序中。然而,可以参考其他随机森林变种例如,在进一步的方法论背景下的学术目的发展。参考文献:Hornung,R.&Wright,M.N.(2019)《区块森林:临床和组学协变量数据区块的随机森林》。BMC生物信息学20:358<doi:10.1186/s12859-019-2942-y>.

版本: 0.2.6
取决于: R(≥3.1)
进口: 卢比(≥ 0.11.2),矩阵、方法、,生存
链接到: 卢比,RcppEigen基因
建议: 测试那个
出版: 2023-03-31
内政部: 10.32614/CRAN.package.block森林
作者: 马文·赖特(Marvin N.Wright),罗曼·霍农(Roman Hornung)
维护人员: 马文·赖特(Marvin N.Wright)
错误报告: https://github.com/bips-hb/blockForest/issues
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/bips-hb/blockForest网站
需要编译:
CRAN检查: blockForest结果

文档:

参考手册: 块森林.pdf

下载内容:

包源: 块森林_0.2.6.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:块Forest_0.2.6.zip,r版本:块Forest_0.2.6.zip,r-oldrel:块Forest_0.2.6.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):区块Forest_0.2.6.tgz,r-oldrel(arm64):区块森林_0.2.6.tgz,r-release(x86_64):区块森林_0.2.6.tgz,r-oldrel(x86_64):区块森林_0.2.6.tgz
旧来源: blockForest存档

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