bioseq:操纵生物序列的工具箱

处理生物序列(DNA、RNA和氨基酸序列)的类和函数。实施S3基础设施以处理Keck(2020)中所述的生物序列<doi:10.1111/2041-210X.13490>.提供一组函数来执行类之间的生物转换(转录、翻译)和序列的基本操作(根据位置或模式进行检测、选择和更换)。该包还提供了从其他包格式导入和导出序列的功能。

版本: 0.1.4
取决于: R(≥3.1.0)
进口: 方法,压控变压器,易怒的,,蜡笔,数字播放器,支柱,斯特林吉,字符串,字符串主义者,读数器,爱尔兰航空公司
建议: 针织物,rmarkdown公司,测试那个(≥ 2.1.0),覆盖(covr)
出版: 2022-09-06
作者: 弗朗索瓦·凯克ORCID标识[aut,cre,cph]
维护人员: 弗朗索瓦·凯克(Francois.Keck at gmail.com>)
错误报告: https://github.com/fkeck/bioseq/issues
许可证: GPL-3公司
网址: https://fkeck.github.io/bioseq网站/
需要编译:
引用: bioseq引文信息
材料: 自述文件 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: bioseq结果

文档:

参考手册: 生物素.pdf
渐晕图: “bioseq”软件包简介
使用“bioseq”包清理和探索NCBI数据

下载内容:

包源: 生物q_0.1.4.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:bioseq_0.1.4.zip文件,r-释放:bioseq_0.1.4.zip文件,r-oldrel:bioseq_0.1.4.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):生物素_0.1.4.tgz,r-oldrel(arm64):生物素_0.1.4.tgz,r-版本(x86_64):生物素_0.1.4.tgz,r-oldrel(x86_64):生物素_0.1.4.tgz
旧来源: bioseq存档

反向依赖关系:

反向进口: 移动RNA,参考数据库
反向建议: tidysq公司

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=bioseq链接到此页面。