bigsnpr:大规模SNP阵列分析

易于使用、高效、灵活和可扩展的分析工具大规模SNP阵列。Privé等人(2018)<doi:10.1093/bioinformatics/bty185>.

版本: 1.12.15
取决于: R(≥3.4),双稳态(≥ 1.5.11)
进口: 大法官(≥ 0.1.6),双并联器,大稀疏(≥ 0.6),大阅读器,bigutilsr公司(≥ 0.3.3),数据表(≥ 1.12.4),doRNG公司,foreach公司,ggplot2,马格里特,矩阵(≥1.3.0),方法,卢比,运行一次(≥0.2.3),统计数据,录像机
链接到: 大稀疏,双稳态,卢比,RcppArmadillo公司(≥ 0.9.600),rmio公司,罗普蒂姆(≥ 0.1.6)
建议: 宾达牌手表,覆盖(covr),dbplyr公司(≥ 1.4),数字播放器,加斯顿,,Hmisc公司,微基准,pcadapt(pcadapt)(≥ 4.1),二次规划优化函数,RhpcBLASctl公司,rmutil公司,R光谱,RSQ网站,R.utils公司,拼写,测试那个,易怒的,xgboost公司
出版: 2024-09-20
内政部: 10.32614/CRAN.包装.bigsnpr
作者: Florian Privé[aut,cre],迈克尔·布鲁姆,Hugues Aschard[ths],比亚尼·Jóhann Vilhjálmsson
维护人员: Florian Privé<Florian.prive.21 at gmail.com>
错误报告: https://github.com/privefl/bigsnpr/issues网站
许可证: GPL-3公司
网址: https://privefl.github.io/bigsnpr/
需要编译:
系统要求: 包“bigsnpr”包装中的几个函数现有软件,如“PLINK”<www.cog-genomics.org/plink2>。功能提供给下载这些软件。请注意,这些外部软件可能不适用于某些操作系统(例如“PLINK”可能不适用于Solaris)。
语言: 英语-美国
引用: bigsnpr引文信息
材料: 自述 新闻
CRAN检查: bigsnpr结果

文档:

参考手册: 大屏幕.pdf

下载内容:

包源: bigsnpr_1.12.15.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:bigsnpr_1.12.2.zip,r版本:bigsnpr_1.12.15.zip码,r-oldrel:bigsnpr_1.12.2.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):大信号_1.12.15.tgz,r-oldrel(arm64):bigsnpr_1.12.15.tgz,r-release(x86_64):bigsnpr_1.12.2.tgz公司,r-oldrel(x86_64):bigsnpr_112.2.tgz
旧来源: bigsnpr存档

反向依赖关系:

反向进口: locStra公司,PRSPGx公司,RapidoPGS公司

链接:

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