baldur:无标签蛋白质组学的贝叶斯层次建模

蛋白质组学数据中使用层次结构的统计决策贝叶斯模型。有两个回归模型用于描述均值-方差趋势、伽马回归或潜在伽马混合回归。然后将回归模型用作经验贝叶斯肽方差先验估计量。此外,它假设每个测量值都有相关的不确定性(增加的方差)这也是推断出来的。最后,它尝试估计后面的平均值差异的分布(通过哈密顿蒙特卡罗)数据中的每个肽。一旦推断出后部,它将tails估计统计决策的错误概率可以制作。有关详细信息,请参阅Berg和Popescu(<doi:10.1101/2023.05.11.540411>).

版本: 0.0.3
取决于: R(≥4.2.0)
进口: 数字播放器(≥ 1.0.9),马格里特(≥2.0.3),方法,呜呜声(≥0.3.4),卢比(≥ 0.12.0),Rcpp并行(≥ 5.0.1),rstan公司(≥2.26.0),甾醇(≥2.2.0),统计,字符串(≥ 1.0.4),第三年(≥ 1.2.0),爱尔兰航空公司(≥ 1.0.2),Rdpack公司(≥ 2.4),多周期(≥ 0.1.1),ggplot2(≥ 3.3.6),易怒的(≥ 3.1.7),绿柱石(≥ 0.4.1),生命周期
链接到: 伯克希尔哈撒韦(≥ 1.66.0),卢比(≥ 0.12.0),Rcpp特征(≥ 0.3.3.3.0),Rcpp并行(≥ 5.0.1),rstan公司(≥ 2.26.0),StanHeaders公司(≥2.26.0)
建议: 针织物,rmarkdown公司
出版: 2023-09-18
内政部: 10.32614/CRAN.包装.巴杜尔
作者: 菲利普·伯格ORCID标识[自动,创建]
维护人员: 菲利普·伯格(Philip Berg)<pb1015 at msstate.edu>
错误报告: https://github.com/PhilipBerg/baldur/issues网站
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
网址: https://github.com/PhilipBerg/baldur
需要编译:
系统要求: GNU品牌
语言: 英语-美国
材料: 自述 新闻
CRAN检查: baldur结果

文档:

参考手册: 巴尔杜.pdf
渐晕图: Baldur UPS教程
Baldur酵母教程

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旧来源: 巴尔杜档案

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