aPCoA:协变量调整PCoA图

在生态学、微生物学和基因组学等领域,非欧几里德距离被广泛应用于描述样本之间的成对差异。鉴于这些成对距离,主坐标分析(PCoA)通常用于构建数据的可视化。然而,混淆的协变量会使与感兴趣的科学问题相关的模式难以观察。我们提供“aPCoA”作为一种易于使用的工具,在这种情况下改进数据可视化,从而增强感兴趣效果的呈现。有关详细信息,请参阅Yushu Shi、Liangliang Zhang、Kim-Anh Do、Christine Peterson和Robert Jenq(2020)《生物信息学》第36卷第13期,4099-4101。

版本: 1.3
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 素食主义者,随机coloR,,汽车,集群
出版: 2021-12-13
作者: 玉树市
维护人员: 史玉树<史玉树2006 gmail.com>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司【扩展自:GPL(≥2)】
需要编译:
CRAN检查: aPCoA结果

文档:

参考手册: aPCoA.pdf格式

下载内容:

包源: aPCoA_1.3.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:aPCoA_1.3.zip,r版本:aPCoA_1.3.zip,r-oldrel:aPCoA_1.3.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):aPCoA_1.3.tgz,r-oldrel(arm64):aPCoA_1.3.tgz,r-release(x86_64):aPCoA_1.3.tgz,r-oldrel(x86_64):aPCoA_1.3.tgz
旧来源: aPCoA存档

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=aPCoA链接到此页面。