树表：计算和绘制系统发生树之间的距离

实现树相似性度量，包括基于信息的广义Robinson-Foulds距离（系统发育信息距离，聚类信息距离，匹配分割信息距离；史密斯2020）<doi:10.1093/bioinformatics/btaa614>; Jaccard-Robinson-Foulds距离（Bocker等人，2013）<doi:10.1007/978-3-642-40453-5_13>, 包括Nye等人（2006）的指标<doi:10.1093/bioinformatics/bti720>;匹配分割距离（Bogdanowicz&Giaro 2012）<doi:10.1109/TCBB.2011.48>;最大协议子树距离；Kendall-Colijn（2016）距离<doi:10.1093/molbev/msw124>、和最近邻互通式立交（NNI）距离，根据Li等人估算。(1996) <doi:10.1007/3-540-61332-3_168>.包括可视化树空间映射的工具（Smith 2022）<doi:10.1093/sysbio/syab100>,为了计算树集合的中值，以及用于计算树和分割的信息内容。

版本：	2.7.0
取决于：	R（≥3.4.0），统计
进口：	猿(≥ 5.0),克莱（≥3.0）时，色彩空间,备忘录,潘戈恩(≥2.2.1),Rdpack公司(≥ 0.7),闪亮的,闪耀（shinyjs）,树工具(≥ 1.7.2)
链接到：	卢比,树工具
建议：	预订,集群,ggplot2,超体积,k密度,针织物,MASS（质量），平行，巧妙地,绘图工具,原教旨主义,四重奏,读xl,rmarkdown公司,卢比(≥ 1.0.8),rgl公司,流氓,拼写,测试那个(≥3.0),三元（≥1.1.2），TreeListData（>0.1.0），树搜索（≥1.4.0），乌马特里克斯,超高速,vdiffr公司(≥ 1.0.0)
出版：	2023-10-25
作者：	马丁·史密斯[aut，cre，cph，prg]，罗伊·容克，杨勇[ctb，cph]，易曹[ctb，cph]
维护人员：	马丁·R·史密斯
错误报告：	https://github.com/ms609/TreeDist/issues/
许可证：	GPL（≥3）
版权：	Jonker-Volgenant线性分配问题的实现Roy Jonker由杨勇和曹毅修改。
网址：	https://ms609.github.io/Tree目录/,https://github.com/ms609/TreeList网站/
需要编译：	对
系统要求：	C++17
其他存储（_R）：	https://ms609.github.io/packages网站/
语言：	en-GB公司
引用：	TreeList引文信息
材料：	新闻
在视图中：	优化,系统发育学
CRAN检查：	TreeList结果

文档：

参考手册：	树目录.pdf
渐晕图：	广义Robinson-Foulds距离 扩展Robinson-Foulds度量 使用“TreeDist”计算树相似性 比较不同分析中的树集 不同叶子的树 利用信息论比较分裂 系统发育树景观分析 树空间分析 树距离的上下文化

下载内容：

包源：	树目录_2.7.0.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：TreeDist_2.7.0.zip目录，r-释放：TreeDist_2.7.0.zip目录，r-oldrel：树目录_2.7.0.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：树表_2.7.0.tgz，r-oldrel（arm64）：树表_2.7.0.tgz，r-版本（x86_64）：树表_2.7.0.tgz，r-oldrel（x86_64）：树表_2.7.0.tgz
旧来源：	TreeDist存档

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反向进口：

流氓,TBR列表,树搜索

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