SeqFeatR:关联FASTA序列和特征的工具

提供用户友好的方法,用于识别与序列属性在统计上显著相关的序列模式。例如,SeqFeatR可以识别特定HLA类型宿主的病毒免疫逃逸突变。基本的统计方法是Fisher精确检验,对多重检验或Bayes进行适当修正。模式可能是点突变或n元组突变。SeqFeatR提供了几种可视化统计分析结果的方法,见Budeus(2016)<doi:10.1371/journal.pone.0146409>.

版本: 0.3.1条
取决于: R(≥3.2.2)、tcltk,tcltk2型,生物串,倍体
进口: 普利尔,潘戈恩,q值,小部件工具,校准,ggplot2,R2jags汽车,尾波,规模,
建议: 可发送的
出版: 2019-04-12
作者: 贝蒂娜·布德斯
维护人员: 贝蒂娜·布德乌斯(Bettina Budeus)
许可证: GPL(≥3)
需要编译:
引用: SeqFeatR引文信息
材料: 新闻 安装
CRAN检查: SeqFeatR结果

文档:

参考手册: SeqFeatR.pdf
渐晕图: SeqFeatR教程

下载内容:

包源: SeqFeatR_0.3.1.tar.gz系列功能
Windows二进制文件: r-devel公司:SeqFeatR_0.3.1.zip文件,r版本:SeqFeatR_0.3.1.zip文件,r-oldrel:SeqFeatR_0.3.1.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):SeqFeatR_0.3.1.tgz,r-oldrel(arm64):SeqFeatR_0.3.1.tgz,r-release(x86_64):SeqFeatR_0.3.1.tgz,r-oldrel(x86_64):SeqFeatR_0.3.1.tgz
旧来源: SeqFeatR存档

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