SeqFeatR:关联FASTA序列和特征的工具
提供用户友好的方法,用于识别与序列属性在统计上显著相关的序列模式。例如,SeqFeatR可以识别特定HLA类型宿主的病毒免疫逃逸突变。基本的统计方法是Fisher精确检验,对多重检验或Bayes进行适当修正。模式可能是点突变或n元组突变。SeqFeatR提供了几种可视化统计分析结果的方法,见Budeus(2016)<doi:10.1371/journal.pone.0146409>.
版本: |
0.3.1条 |
取决于: |
R(≥3.2.2)、tcltk,tcltk2型,生物串,倍体 |
进口: |
普利尔,潘戈恩,q值,小部件工具,校准,ggplot2,R2jags汽车,尾波,规模,猿 |
建议: |
可发送的 |
出版: |
2019-04-12 |
作者: |
贝蒂娜·布德斯 |
维护人员: |
贝蒂娜·布德乌斯(Bettina Budeus) |
许可证: |
GPL(≥3) |
需要编译: |
不 |
引用: |
SeqFeatR引文信息 |
材料: |
新闻 安装 |
CRAN检查: |
SeqFeatR结果 |
文档:
下载内容:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=SeqFeatR链接到此页面。