SMDIC:体细胞突变驱动的免疫细胞的鉴定
开发了一种计算工具来自动识别体细胞突变驱动的免疫细胞。操作模式包括:i)推断肿瘤浸润免疫细胞的相对丰度矩阵,并将其与特定的基因突变状态相结合,ii)检测与基因突变状态相关的差异免疫细胞,并将显著差异免疫细胞的丰度矩阵转换为两个二进制矩阵(一个用于上调,一个用于下调),iii)通过比较所有样本二进制矩阵中每个免疫细胞的基因突变状态来识别体细胞突变驱动的免疫细胞,以及iv)可视化不同突变状态下样本的免疫细胞丰度。。
版本: |
0.1.5 |
取决于: |
R(≥4.3.0) |
进口: |
GSVA公司,萨姆,e1071号,平行,预处理核心,情势图,黑手党,gr设备,生存,监督员,MASS(质量),普拉克马,统计,R彩色啤酒,后端口 |
建议: |
针织物,rmarkdown公司,R.utils公司 |
出版: |
2024-01-12 |
内政部: |
10.32614/CRAN.包装。SMDIC公司 |
作者: |
郑保通、韩俊伟 |
维护人员: |
韩俊伟<hanjunwei 1981 at 163.com> |
许可证: |
GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)] |
需要编译: |
不 |
引用: |
SMDIC引用信息 |
材料: |
自述 |
在视图中: |
组学 |
CRAN检查: |
SMDIC结果 |
文档:
下载内容:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=SMDIC链接到此页面。