流氓:在一组系统发育树中识别流氓红豆杉

流氓(“通配符”)分类群是具有不确定系统发育的叶子位置。在推理方法下,它们的位置可能因树而异树集(例如引导、贝叶斯树搜索、最大简约)。树集中存在的流氓分类群可能会删除所有来自共识树的信息。共识的信息内容树(其分辨率和分支支持值的函数)通常可以是通过移除流氓分类群而增加。“流氓”为流氓提供了明确的信息理论方法检测(史密斯2022)<doi:10.1093/sysbio/syab099>,和“RogueNaRok”接口(Aberer等人,2013年)<doi:10.1093/sysbio/sys078>.

版本: 2.1.6
取决于: R(≥3.5.0)
进口: (≥ 5.0),克莱(≥3.0)时,快速比赛,gr设备,矩阵统计,Rdpack公司(≥ 0.7),快速,统计,树列表(> 2.2.0),树工具(≥1.9.1.9003),实用工具
建议: 针织物,绘图工具,rmarkdown公司,拼写,测试那个
出版: 2023-11-29
作者: 马丁·史密斯ORCID标识[aut,cre,cph],安德烈·J·阿贝尔[aut,cph]
维护人员: 马丁·R·史密斯
错误报告: https://github.com/ms609/Rogue/issues/
许可证: GPL(≥3)
网址: https://github.com/ms609/Rogue(罗格)/,https://github.com/aberer/RogueNaRok/,https://github.com/ms609/RogueNaRok网站/
需要编译:
系统要求: C99
语言: en-GB公司
引用: 流氓引文信息
材料: 新闻
在视图中: 系统发育学
CRAN检查: 流氓结果

文档:

参考手册: 罗格.pdf
渐晕图: 贝叶斯后验树集中恶意分类群的检测

下载内容:

包源: 罗格_2.1.6.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:Rogue_2.1.6.拉链,r-释放:Rogue_2.1.6.拉链,r-oldrel:Rogue_2.1.6.拉链
macOS二进制文件: r释放(arm64):罗格_2.1.6.tgz,r-oldrel(arm64):罗格_2.1.6.tgz,r-版本(x86_64):罗格_2.1.6.tgz,r-oldrel(x86_64):罗格_2.1.6.tgz
旧来源: 盗贼档案

反向依赖关系:

反向进口: 树搜索
反向建议: 树列表

链接:

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