PQLseq:大规模计数数据的高效混合模型分析基因组测序研究

一种有效的工具,设计用于在存在个体相关性和群体结构的情况下对大规模RNA测序(RNAseq)数据和二硫化物测序(BSseq)数据进行差异分析。”PQLseq首先使用调整后的协变量、兴趣预测因子和随机效应拟合广义线性混合模型(GLMM),以解释种群结构和个体相关性,然后对RNAseq中的每个基因或BSseq中的位点进行Wald检验。

版本: 1.2.1
取决于: R(≥2.10)
进口: 卢比(≥ 0.12.14),foreach公司,do并行,平行,矩阵,方法
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司
出版: 2021-06-06
内政部: 10.32614/CRAN.包装。PQLseq公司
作者: 孙石泉、朱家强、周翔
维护人员: 朱家强<朱家强在umich.edu>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
版权: 参见文件版权
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在视图中: 组学
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macOS二进制文件: r释放(arm64):PQL序列_1.2.1.tgz,r-oldrel(arm64):PQLseq_1.2.1.tgz,r-release(x86_64):PQLseq_1.2.1.tgz,r-oldrel(x86_64):PQLseq_1.2.1.tgz
旧来源: PQLseq存档

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