PQLseq:大规模计数数据的高效混合模型分析基因组测序研究
一种有效的工具,设计用于在存在个体相关性和群体结构的情况下对大规模RNA测序(RNAseq)数据和二硫化物测序(BSseq)数据进行差异分析。”PQLseq首先使用调整后的协变量、兴趣预测因子和随机效应拟合广义线性混合模型(GLMM),以解释种群结构和个体相关性,然后对RNAseq中的每个基因或BSseq中的位点进行Wald检验。
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