EvoPhylo:松弛时钟形态学数据的前后处理贝叶斯系统发育学

执行自动形态字符分割系统发育分析和宏观进化参数分析时钟(时间校准)贝叶斯推理分析的输出,如下西蒙斯和皮尔斯(2021)提出的概念<数字对象标识代码:10.1038/s41559-021-01532-x>.

版本: 0.3.2
取决于: R(≥4.0.0)
进口: (≥ 1.16.2),dplyr公司(≥ 1.0.8),集群(≥ 2.1.2),深时间(≥ 0.2.0),ggplot2(≥ 3.3.5),GG排斥(≥ 0.9.1),ggtree(ggtree)(≥3.1.5.902),拼凑,树(treeio)(≥ 1.16.2),Rtsne公司(≥0.15),脱胶(≥ 0.1.0),开发工具(≥2.4.3)
建议: kableExtra(额外),针织物,rmarkdown公司
出版: 2022-11-03
作者: 蒂亚戈·西蒙斯ORCID标识[cre,aut],诺亚·格雷弗ORCID标识[aut],乔尔·巴里多·索塔尼ORCID标识[aut],斯蒂芬妮·皮尔斯ORCID标识[自动]
维护人员: 蒂亚戈·西蒙斯(Tiago Simoes)<trsimoes87 at gmail.com>
错误报告: https://github.com/tiago-simoes/EvoPhylo/issues
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
网址: https://github.com/tiago-simoes/EvoPhylo,https://tiago-simoes.github.io/EvoPhylo/
需要编译:
引用: EvoPhylo引用信息
材料: 新闻
在视图中: 系统发育学
CRAN检查: EvoPhylo结果

文档:

参考手册: EvoPhylon公司.pdf
渐晕图: 字符分区
理论背景
分析FBD参数
分析带有偏移的树
进化速率和选择模式(BEAST2)
进化速率和选择模式(贝叶斯先生)

下载内容:

包源: EvoPhylo_0.3.2.tar.gz公司
Windows二进制文件: r-devel公司:EvoPhylo_0.3.2.zip码,r-释放:EvoPhylo_0.3.2.zip码,r-oldrel:EvoPhylo_0.3.2.zip码
macOS二进制文件: r释放(arm64):EvoPhylo_0.3.2.tgz公司,r-oldrel(arm64):EvoPhylo_0.3.2.tgz公司,r-版本(x86_64):EvoPhylo_0.3.2.tgz公司,r-oldrel(x86_64):EvoPhylo_0.3.2.tgz公司
旧来源: EvoPhylo存档

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