AnanseSeurat:构建ANANSE GRN分析Seurat

能够对单细胞簇进行基因调控网络(GRN)分析,使用GRN分析软件“ANANSE”,Xu等人(2021)<doi:10.1093/nar/gkab598>.从“Seura”对象导出数据,以便“ANANSE”进行GRN分析在“snakemake”中实现。最后,合并结果以进行可视化和解释。

版本: 1.2.0
取决于: R(≥3.50)
进口: 数字播放器,ggplot2,ggpubr公司,马格里特,拼凑,png公司,呜呜声,爱尔兰航空公司,修拉,字符串,实用程序
建议: 冠状病毒,针织者,rmarkdown公司,西尼亚克,测试那个(≥3.0.0)
出版: 2023-11-11年
内政部: 10.32614/CRAN.包装。阿南塞·修拉
作者: 乔斯·斯密茨ORCID标识[自动,cre,cph],慧卿·乔周ORCID标识[aut,fnd,cph]
维护人员: Jos Smits<Jsmits at science.ru.nl>
错误报告: https://github.com/JGASmits/AnanseSeurat/issues网站
许可证: Apache许可证(≥2)
网址: https://github.com/JGASmits/AnanseSeurat网站/
需要编译:
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: AnanseSeurat结果

文档:

参考手册: 安娜塞乌拉.pdf
守夜人: 介绍

下载:

包源: 安娜塞乌拉_1.2.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:AnanseSeurat_1.2.0.zip,r版本:AnanseSeurat_1.2.0.zip,r-oldrel:AnanseSeurat_1.2.0.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):AnanseSeurat_1.2.0.tgz,r-oldrel(arm64):AnanseSeurat_1.2.0.tgz,r-release(x86_64):AnanseSeurat_1.2.0.tgz,r-oldrel(x86_64):Ananse修拉_1.2.0.tgz
旧来源: AnanseSeura档案

链接:

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