ADAPTS:组织轮廓的自动反褶积增强特定细胞

使用流分类或单细胞样本构建(或添加)细胞类型特征矩阵的工具,并对大量基因表达数据进行去卷积。对于评估单细胞RNAseq实验的质量、估计特征矩阵的准确性和确定细胞类型溢出非常有用。请引用:Danziger SA等人(2019)ADAPTS:组织特异性细胞轮廓的自动反褶积增强<doi:10.1371/journal.pone.0224693>.

版本: 1.0.22
取决于: R(≥3.3.0)
进口: 密斯森林,e1071号,漫画,情势图,do并行,实用程序,量子力学,预处理核心,pca方法,foreach公司,nnls公司,护林员
建议: R.rsp公司,取消RNASeq,WGCNA公司
出版: 2022-09-14
内政部: 10.32614/CRAN.包装。适配器
作者: 塞缪尔·丹泽格
维护人员: 塞缪尔·丹泽格(Samuel A Danziger)<sam.Danziger at gmail.com>
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
版权: 百时美施贵宝
需要编译:
材料: 自述文件
在视图中: 组学
CRAN检查: ADAPTS结果

文档:

参考手册: 适配器.pdf
渐晕图: ADAPTS(组织特异性细胞轮廓的自动反褶积增强)渐晕
改编小品#2:(弃用)单细胞分析
改编小品#3:从单细胞数据构建更好的签名矩阵
自适应Vignette#4:构建基于单细胞的矩阵并测试独立数据
自适应Vignette#5:用于鲁棒精度估计的自动重复留半交叉验证

下载内容:

包源: 适配器_1.0.22.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:适配器_1.0.22.zip,r版本:适配器_1.0.22.zip,r-oldrel:适配器_1.0.22.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):适配器_1.0.22.tgz,r-oldrel(arm64):适配器_1.0.22.tgz,r-版本(x86_64):适配器_1.0.22.tgz,r-oldrel(x86_64):适配器_1.0.22.tgz
旧来源: ADAPTS档案

反向依赖关系:

反向进口: scMapper报告

链接:

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