WGCNA:加权相关网络分析

Horvath和Zhang(2005)最初描述的对高维数据执行加权相关网络分析所需的功能<数字对象标识代码:10.2202/1544-6115.1128>兰菲尔德和霍瓦特(2008)<doi:10.1186/1471-2105-9-559>. 包括基本数据清理、相关网络构建、模块识别、汇总以及变量和模块与样本特征的关联等功能。还包括许多用于数据操作和可视化的实用函数。

版本: 1.72-5
取决于: R(≥3.0),动态树剪切(≥ 1.62),快速集群
进口: stats、grDevices、utils、,矩阵统计(≥ 0.8.1),Hmisc公司,插补、花键、,foreach公司,do并行,预处理核心,生存,平行,政府.db,注释Dbi,卢比(≥ 0.11.0)
链接到: 卢比
建议: 组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,信息提奥,,地雷
出版: 2023-12-07
作者: Peter Langfelder和Steve Horvath,由Chaochao Cai、Jun Dong、Jeremy Miller、Lin Song、Andy Yip和Bin Zhang贡献
维护人员: 彼得·朗菲尔德。Langfelder在gmail.com上>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
网址: http://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/
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引用: WGCNA引文信息
材料: 更改日志
在视图中: 组学
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旧来源: WGCNA档案

反向依赖关系:

反向取决于: 差异共存,NetSAM公司
反向进口: 生物M2,生物NAR,BioNERO公司,CEMi工具,csdR公司,DGCA公司,迪帕姆,迪蒙特博士,覆盖层,fastLiquid协会,自由树,GmicR公司,GWENA公司,iNET格栅,马卡隆,MACP公司,MCbiclust公司,国防部,MRPC公司,多WGCNA,净升压,图案,Pigengene公司,斯克泊松,seq2通路,SPsimSeq软件,纳税人识别号,TOmicsVis公司
反向建议: 适配器,生物活性炭,可乐,DDPNA公司,毛茸茸的森林,GRaNIE公司,gsean公司,Hi联系人,maGUI(主图形用户界面),scde(标准码),scGPS,scITD公司,空间热图,TRex选择器
反向增强: 右旋糖

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