5英尺/秒

大鼠神经元型一氧化氮合酶血红素结构域与4-甲基-6-(2-(5-(3-(甲胺基)丙基)吡啶-3-基)乙基)吡啶-2-胺配合物的结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.95 Å
  • R值自由:0.228 
  • R值工作:0.185 
  • 观察到的R值:0.188

wwPDB验证  3D报告 完整报告


配体结构质量评估 


这是条目的1.1版。查看完整信息历史


文学类

通过优化含吡啶连接物的2-氨基吡啶基支架,有效和选择性地抑制人神经一氧化氮合酶。

Wang,H。秦,Y。李,H。罗曼,L.J。马塔塞克,P。普洛斯,T.L。R.B.西尔弗曼。

(2016)医学化学杂志59: 4913


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
一氧化氮合酶,脑422褐家鼠突变: 0 
欧盟委员会:1.14.13.39
UniProt公司
寻找蛋白质第29476页 (褐家鼠)
探索第29476页 
转到UniProtKB:第29476页
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第29476页
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体5独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互

HEM查询

下载理想坐标CCD文件
C[认证A],
H[认证B]
含FE的原卟啉IX
C类34H(H)32铁氮4O(运行)4
KABFMIBPWCXCRK-RGGAHWMASA-L公司
第66周
W66查询

下载理想坐标CCD文件
E[认证A],
J[认证B]
4-甲基-6-(2-(5-(3-(甲基氨基)丙基)吡啶-3-基)乙基)吡啶-2-胺
C类17H(H)24N个4
YUXWMCKGSHXUGW-UHFFFAOYSA-N公司
H4B型
H4B查询

下载理想坐标CCD文件
D[认证A],
本人【授权B】
5,6,7,8-四氢生物蝶呤
C类9H(H)15N个5O(运行)
FNKQXYHWGSIFBK-RPDRRWSUSA-N公司
ZN公司
ZN查询

下载理想坐标CCD文件
G[认证A]锌离子

PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N公司
行为
ACT查询

下载理想坐标CCD文件
F[认证A],
K[认证B]
醋酸盐离子
C类2H(H)O(运行)2
QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M公司
绑定相关性注释
身份证件来源绑定相关性
第66周 绑定数据库: 5英尺/秒 Ki公司:最小值:13,最大值:65.3(nM),来自5次分析
IC50:最小值:91,最大值:142(nM),来自2次分析
绑定MOAD: 5英尺/秒 Ki公司:1次化验中16(nM)
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.95 Å
  • R值自由:0.228 
  • R值工作:0.185 
  • 观察到的R值:0.188 
  • 空间组:第2页12121
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=51.908α = 90
b=110.484β = 90
c=164.053γ = 90
软件包:
软件名称目的
菲尼克斯精炼
XDS公司数据缩减
无目标的数据缩放
REFMAC公司阶段划分

结构验证

查看完整验证报告



配体结构质量评估


进入历史记录

存款数据

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2016-04-20
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2016-06-08
    更改:数据库引用