此条目使用数字符号（#），因为血管瘤样纤维组织细胞瘤与多个基因的体细胞融合有关，包括FUS（137070）、ATF1（123803）、EWS（EWSR1；133450）和CREB1（123810）。
Enzinger（1979）首次将“血管瘤样”纤维组织细胞瘤描述为恶性纤维组织细胞瘤的一种独特变体，通常发生在儿童和青少年中，表现为结节状皮下生长。手术切除后容易复发。典型的显微特征包括与出血区域和囊性假血管间隙密切相关的组织细胞样细胞的分叶状片状物，以及炎性细胞引人注目的袖口，模拟淋巴结转移。如果没有发现典型的囊状间隙、周围纤维化和慢性炎症浸润，则病变可能被误诊为细胞性或硬化性血管瘤、血管外皮细胞瘤、血管内皮瘤等（Waters等人，2000年；Antonescu等人，2007年）。
FUS/ATF1融合基因
Waters等人（2000年）报道了一名5.5岁的女孩，她的左前臂皮下组织深处有一个1.3厘米的硬块。对肿瘤组织的分析显示，在核型研究中注意到2号、12号、16号和17号染色体之间的复杂重排，以及11号染色体长臂的缺失。用RT-PCR研究了t（12；16）位点。发现16p11.2的FUS基因与12q13的ATF1基因结合，产生FUS/ATF1嵌合。Waters等人（2000年）发现，FUS在密码子175处中断，并与ATF1的密码子110融合，导致与甘氨酸到缬氨酸（GGT到GTT）转换的框内连接。
EWS/ATF1融合基因
在血管瘤样纤维组织细胞瘤患者的肿瘤组织中，Hallor等人（2005年）发现了t（12；22）（q13；q12）易位。RT-PCR分析分别在第7和第5外显子之间检测到一个EWS/ATF1融合基因，该融合基因起到组成转录激活剂的作用。
Antonescu等人（2007年）在8名非血缘血管瘤样纤维组织细胞瘤患者的肿瘤组织样本中，发现了一个相同的EWSR1/CREB1融合转录物，EWSR1的第7外显子与CREB1的第七外显子融合。在第九名患者的肿瘤样本中，他们发现了一个EWSR1/ATF1融合基因，该基因将EWSR1的第7外显子连接到ATF1的第5外显子。Antonescu等人（2007）得出结论，EWSR1/CREB1融合基因是该肿瘤类型中最常见的遗传异常。