条目-*602833-H4簇状组蛋白9;H4C9型-OMIM公司
 
*602833

H4簇合组蛋白9;H4C9型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员I;HIST1H4I公司
组蛋白基因簇1,H4I
HIST1集群,H4I
H4组蛋白家族,成员M;H4FM;H4M型


本条目中表示的其他实体:

H4FM/BCL6融合基因,包括

HGNC批准的基因符号:H4C9型

细胞遗传学位置:第62.1页   基因组坐标(GRCh38):6:27,139,282-27,139,678 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第62.1页 Tessadori Bicknell van Haaften神经发育综合征4 619951 AD公司

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822).


克隆和表达

通过克隆B细胞型非霍奇金淋巴瘤复发易位的连接区t(3;6)(q27;p21),Akasaka等人(1997)确定了一个编码组蛋白H4类成员的基因。Albig和Doenecke(1997)指定该基因为H4/m。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)鉴定了小鼠和人类HIST1H4I基因。所有小鼠和人类H4基因,包括HIST1H4I,编码相同的蛋白质。


映射

通过FISH,Akasaka等人(1997)将H4/m基因映射到该区域组蛋白基因簇内的染色体6p21.3。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因集群-1(HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4I。


基因功能

参见HIST1H4A(602822)获取H4组蛋白的功能信息。


细胞遗传学

在2例携带t(3;6)(q27;p21)易位的患者中,Akasaka等人(1997)发现H4/m基因取代了BCL6的5个主要调节元件(109565)与BCL6的编码外显子3-9以相同的转录方向融合。由于H4基因表达与DNA复制紧密耦合,这些作者认为易位会导致细胞周期中BCL6的不当表达,从而导致非霍奇金淋巴瘤的发生。


分子遗传学

在3名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-4(TEBIVANED4;619951),Tessadori等人(2022年)在H4C9基因的核心球状结构域中鉴定的从头杂合错义突变(R41L;602833.0001和H76R;602833.0002)。通过外显子组测序确定突变后,通过国际合作确定患者。gnomAD数据库中不存在这两个数据库。斑马鱼胚胎中突变的表达导致严重的发育缺陷,表明它们具有致病性。作者假设了一种主导效应。所有患者都有发育迟缓,但严重程度和表现高度可变,即使在基因型相同的患者中也是如此。Tessadori等人(2022年)表示斑马鱼检测存在固有局限性。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征4

H4C9、ARG41LEU
   RCV003152473型

一名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-4(TEBIVANED4;619951),Tessadori等人(2022年)在H4C9基因中鉴定出一个新的杂合子c.122G-T颠倒(c.122G-T,NM_003495.2),导致核心球状结构域中保守残基的arg41-to-leu(R41L)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。患者有学习困难、社交问题、发育不良、小头畸形(-4.12 SD)、视力和听力缺陷以及面部畸形。作者还将这种突变称为ARG40LEU(R40L),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸编号的做法。


.0002 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征4

H4C9、HIS76ARG
   RCV003152474型

在2例Tessadori Bicknell van Haaften神经发育综合征-4(TEBIVANED4;619951),Tessadori等人(2022年)在H4C9基因中发现了一个从头杂合的c.227A-G转换(c.227A-G,NM_003495.2),导致核心球状结构域中的保守残基发生his76-to-arg(H76R)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。患者总体生长不良,整体发育迟缓,伴有智力障碍、畸形特征和骨骼异常。P28死于29岁,可能是骨髓增生异常和白血病。作者还将这种突变称为HIS75ARG(H75R),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸的编号的做法。


参考文献

  1. Akasaka,T.、Miura,I.、Takahashi,N.、Akasaka,H.、Yonetani,N.、Ohno,H.、Fukuhara,S.、Okuma,M。非霍奇金淋巴瘤中反复发生的易位t(3;6)(q27;p21)导致BCL6的5素调控区被新的H4组蛋白基因取代。癌症研究。57:7-121997。[公共医学:8988030,相关引文]

  2. W·阿尔比格(Albig,W.)、D·多内克(Doenecke,D.)。人类组蛋白基因簇位于D6S105位点。嗯,遗传学。101: 284-294, 1997.[公共医学:9439656,相关引文][全文]

  3. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966,相关引文]

  4. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563,图像,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Matthew B.Gross-更新日期:2013年7月2日
创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1998年7月10日
卡罗尔:2023年1月20日
阿洛佩兹:2022年12月7日
ckniffin:2022年11月7日
mgross:2022年4月21日
mgross:2013年7月2日
mgross:2010年7月22日
tkritzer:2003年3月31日
tkritzer:2003年3月18日
脱发:1998年9月8日
阿洛佩兹:1998年8月26日
脱发:1998年7月10日

*602833

H4簇合组蛋白9;H4C9型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员I;HIST1H4I公司
组蛋白基因簇1,H4I
HIST1集群,H4I
H4组蛋白家族,成员M;H4FM;H4M型


本条目中表示的其他实体:

H4FM/BCL6融合基因,包括

HGNC批准的基因符号:H4C9

细胞遗传学位置:6p22.1   基因组坐标(GRCh38):6:27139282-27139678 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第62.1页 Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征4 619951 常染色体显性

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822)。


克隆和表达

通过克隆B细胞型非霍奇金淋巴瘤复发易位的连接区t(3;6)(q27;p21),Akasaka等人(1997年)确定了一个编码H4类组蛋白成员的基因。Albig和Doenecke(1997)指定该基因为H4/m。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)鉴定了小鼠和人类HIST1H4I基因。所有小鼠和人类H4基因,包括HIST1H4I,编码相同的蛋白质。


映射

通过FISH,Akasaka等人(1997年)将H4/m基因映射到该区域组蛋白基因簇内的染色体6p21.3。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因群-1(histone gene cluster-1,HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4I。


基因功能

有关H4组蛋白的功能信息,请参见HIST1H4A(602822)。


细胞遗传学

在2例携带t(3;6)(q27;p21)易位的患者中,Akasaka等人(1997年)发现H4/m基因取代了BCL6(109565)的5素调控元件,并以相同的转录方向与BCL6的编码外显子3-9融合。由于H4基因表达与DNA复制紧密耦合,这些作者认为易位会导致细胞周期中BCL6的不当表达,从而导致非霍奇金淋巴瘤的发生。


分子遗传学

在3名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-4(TEBIVANED4;619951)的无关患者(P26-P28)中,Tessadory等人(2022)在H4C9基因核心球状结构域(R41L;602833.0001和H76R;602832.0002)中发现了新发杂合错义突变。通过外显子组测序确定突变后,通过国际合作确定了患者。gnomAD数据库中不存在这两个数据库。突变在斑马鱼胚胎中的表达导致了严重的发育缺陷,表明它们具有致病性。作者假设了一种主导效应。所有患者都有发育迟缓,但严重程度和表现高度可变,即使在基因型相同的患者中也是如此。Tessadori等人(2022年)指出斑马鱼分析存在固有局限性。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征4

H4C9、ARG41LEU
临床变量:RCV003152473

在一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-4(TEBIVANED4;619951)的10.5岁女孩(P26)中,Tessadory等人(2022)在H4C9基因中发现了一个从头杂合子c.122G-T颠倒(c.122G-T,NM_003495.2),导致核心球状结构域保守残基的arg41-to-leu(R41L)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。患者有学习困难、社交问题、发育不良、小头畸形(-4.12 SD)、视力和听力缺陷以及面部畸形。作者还将这种突变称为ARG40LEU(R40L),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸编号的做法。


.0002 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经发育综合征4

H4C9、HIS76ARG
临床变量:RCV003152474

在2名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-4(TEBIVANED4;619951)的非血缘患者(P27和P28)中,Tessadory等人(2022)在H4C9基因中发现了一个从头杂合的c.227A-G转换(c.227A-G,NM_003495.2),导致核心球状结构域中保守残基的his76-to-arg(H76R)替代。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。患者总体生长不良,整体发育迟缓,伴有智力障碍、畸形特征和骨骼异常。P28死于29岁,可能是骨髓增生异常和白血病。作者还将这种突变称为HIS75ARG(H75R),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸的编号的做法。


参考文献

  1. Akasaka,T.、Miura,I.、Takahashi,N.、Akasake,H.、Yonetani,N.,Ohno,H.,Fukuhara,S.、Okuma,M。非霍奇金淋巴瘤中反复发生的易位t(3;6)(q27;p21)导致BCL6的5素调控区被新的H4组蛋白基因取代。癌症研究57:7-121997年。[公共医学:8988030]

  2. W·阿尔比格(Albig,W.)、D·多内克(Doenecke,D.)。人类组蛋白基因簇位于D6S105位点。嗯,遗传学。101: 284-294, 1997.[公共医学:9439656][全文:https://doi.org/10.1007/s004390050630]

  3. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966]

  4. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2022.02.003]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Matthew B.Gross-更新日期:2013年7月2日

创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1998年7月10日

编辑历史记录:
卡罗尔:2023年1月20日
阿洛佩兹:2022年12月7日
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mgross:2013年7月2日
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