条目-*602830-H4簇状组蛋白5;H4C5型-OMIM公司
 
*602830

H4簇合组蛋白5;H4C5型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员E;HIST1H4E公司
组蛋白基因簇1,H4E
HIST1集群,H4E
H4组蛋白家族,成员J;H4FJ;H4/J公司


HGNC批准的基因符号:H4C5型

细胞遗传学位置:第22页   基因组坐标(GRCh38):6:26,204,610-26,205,021 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第22页 Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征3 619950 AD公司

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822).


克隆和表达

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)鉴定了人类HIST1H4E基因。所有H4基因,包括HIST1H4E,编码相同的蛋白质。


映射

通过对染色体6p21.3的YAC连接区的分析,Albig等人(1997年)以35个组蛋白基因簇为特征,包括H4/j。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因集群-1(HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4E。


基因功能

参见HIST1H4A(602822)获取H4组蛋白的功能信息。


分子遗传学

在17例Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950),Tessadori等人(2022年)确定H4C5基因中的从头杂合错义突变(参见,例如。,602830.0001-602830.0005). 通过外显子组测序确定突变后,通过国际合作确定了患者。一些变体(例如R46C;602830.0004)复发;gnomAD数据库中没有任何数据。突变发生在保守残基上,并趋向于在核心球状结构域或C-尾结构域聚集。斑马鱼胚胎中一些突变的表达导致发育缺陷,表明它们是致病性的。作者假设了一种主导效应。值得注意的是,有4名患者(P12-P15)携带相同的R41C错义变异体,该变异体在gnomAD中不存在,但在斑马鱼胚胎中表达时没有引起显著的发育缺陷。所有患者都有整体发育迟缓,但严重程度和表现高度可变,即使在基因型相同的患者中也是如此。Tessadori等人(2022年)表示斑马鱼检测存在固有局限性。


ALLELIC变体( 5精选示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、LYS32THR
   RCV003152468型

一名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950),Tessadori等人(2022)在H4C5基因中鉴定了一个从头杂合的c.95A-c颠换(c.95A-c,NM_003545.3),导致核心球状结构域中保守残基处的lys32-thr(K32T)取代。该突变是通过外显子组测序发现的,但gnomAD数据库中并不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。她患有全球发育迟缓和发育不良。作者还将这种突变称为LYS31THR(K31T),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸编号的做法。


.0002 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、PRO33ARG
   RCV003152469型

一名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950),Tessadori等人(2022年)在H4C5基因中鉴定出一个新的杂合c.98C-G颠倒(c.98C-c,NM_003545.3),导致核心球状结构域中保守残基处的pro33-to-arg(P33R)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。他患有全面发育迟缓,无法行走或说话,痉挛和癫痫。作者还将这种突变称为PRO32ARG(P32R),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸编号的做法。


.0003 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、ARG36TRP
   RCV003152470型

一名12.5岁女性(P10)患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950),Tessadori等人(2022年)在H4C5基因中鉴定出一个从头杂合的c.106C-T转换(c.106C-T,NM_003545.3),导致核心球状结构域中保守残基处的arg36-trp(R36W)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。患者患有发育迟缓和自闭症。作者还将这种突变称为ARG35TRP(R35W),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸编号的做法。


.0004 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950),Tessadori等人(2022年)在H4C5基因中鉴定出一个从头杂合子c.136C-T转换(c.136C-T,NM_003545.3),导致核心球状结构域中保守残基的arg46-to-cys(R46C)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了轻微的发育缺陷,刚刚达到显著水平(p小于0.05),这表明它可能是致病性的。作者假设了一种主导效应。患者总体生长不良,整体发育迟缓,但存在表型异质性。作者还将这种突变称为ARG45CYS(R45C),反映了减少第一个翻译后去除的甲硫氨酸编号的做法。


0005 TESSADORI-VAN HAAFTEN神经发育综合征3

H4C5、TYR99HIS
   RCV003152472。。。

在2名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950),Tessadori等人(2022年)在H4C5基因中鉴定出一个从头杂合的c.295T-c转换(c.295T-c,NM_003545.3),导致在c-tail结构域的保守残基处发生tyr99到his(Y99H)的替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致严重的发育缺陷,这表明它可能是致病性的。作者假设了一种主导效应。患者总体生长不良,整体发育迟缓,但存在表型异质性。作者还将这种突变称为TYR98HIS(Y98H),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸的编号的做法。


参考文献

  1. Albig,W.,Kioschis,P.,Poustka,A.,Meergans,K.,Doenecke,D。人类组蛋白基因组织:一个大簇内的非规则排列。基因组学40:314-3221997。[公共医学:9119399,相关引文][全文]

  2. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966,相关引文]

  3. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563,图像,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Matthew B.Gross-更新时间:2013年7月2日
创建日期:
Rebekah S.Rasooly:1998年10月7日
卡罗尔:2023年1月20日
卡罗尔:2023年1月20日
阿洛佩兹:2022年12月7日
ckniffin:2022年11月7日
mgross:2022年4月21日
mgross:2013年7月2日
mgross:2010年7月22日
tkritzer:2003年3月31日
阿洛佩兹:1998年8月26日
阿洛佩兹:1998年7月14日
阿洛佩兹:1998年7月10日

*602830

H4簇状组蛋白5;H4C5型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员E;HIST1H4E公司
组蛋白基因簇1,H4E
HIST1集群,H4E
H4组蛋白家族,成员J;H4FJ;H4/J公司


HGNC批准的基因符号:H4C5

细胞遗传学位置:6p22.2   基因组坐标(GRCh38):6:26204610-26205021 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第22页 Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征3 619950 常染色体显性

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822)。


克隆和表达

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)鉴定了人类HIST1H4E基因。所有H4基因,包括HIST1H4E,编码相同的蛋白质。


映射

Albig等人(1997年)通过分析染色体6p21.3的YAC连接,确定了35个组蛋白基因簇的特征,包括H4/j。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因群-1(histone gene cluster-1,HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4E。


基因功能

有关H4组蛋白的功能信息,请参见HIST1H4A(602822)。


分子遗传学

在17名患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950)的非血缘患者中,Tessadory等人(2022)在H4C5基因中发现了从头杂合错义突变(参见,例如602830.001-602830.005)。通过外显子组测序确定突变后,通过国际合作确定患者。一些变体(例如,R46C;602830.004)是复发的;gnomAD数据库中没有任何数据。突变发生在保守残基上,并趋向于在核心球状结构域或C-尾结构域聚集。斑马鱼胚胎中一些突变的表达导致发育缺陷,表明它们是致病性的。作者假设了一种主导效应。值得注意的是,有4名患者(P12-P15)携带相同的R41C错义变异体,该变异体在gnomAD中不存在,但在斑马鱼胚胎中表达时没有引起显著的发育缺陷。所有患者都有整体发育迟缓,但严重程度和表现高度可变,即使在基因型相同的患者中也是如此。Tessadori等人(2022年)指出斑马鱼分析存在固有局限性。


ALLELIC变体 5个精选示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、LYS32THR
临床变量:RCV003152468

在一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950)的11个月大女孩(P8)中,Tessadory等人(2022年)在H4C5基因中发现了一个从头杂合的c.95A-c颠换(c.95A-c,NM_003545.3),导致核心球状结构域保守残基的lys32-to-thr(K32T)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。她患有全球发育迟缓和生长迟缓。作者还将这种突变称为LYS31THR(K31T),反映了减少第一个翻译后去除的甲硫氨酸编号的做法。


.0002 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、PRO33ARG
临床变量:RCV003152469

在一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950)的5岁男童(P9)中,Tessadory等人(2022)在H4C5基因中发现了一个新的杂合c.98C-G颠倒(c.98C-G,NM_003545.3),导致核心球状结构域保守残基处的pro33-to-arg(P33R)替代。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。他患有全面发育迟缓,无法行走或说话,痉挛和癫痫。作者还将这种突变称为PRO32ARG(P32R),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸编号的做法。


.0003 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、ARG36TRP
临床变量:RCV003152470

在一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950)的12.5岁女性(P10)中,Tessadory等人(2022)在H4C5基因中发现了一个从头杂合的c.106C-T转换(c.106C-T,NM_003545.3),导致核心球状结构域中保守残基的arg36-trp(R36W)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。患者患有发育迟缓和自闭症。作者还将这种突变称为ARG35TRP(R35W),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸编号的做法。


.0004 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、ARG46CYS
SNP:rs950721550,临床变量:RCV000998549、RCV001420269、RCV003152614、RCV0003346251

在7名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950)的非血缘关系患者(P16-P22)中,Tessadory等人(2022)在H4C5基因中发现了一个从头杂合的c.136C-T转换(c.136C-T,NM_003545.3),导致核心球状结构域保守残基处的arg46-to-cys(R46C)替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了轻微的发育缺陷,刚刚达到显著水平(p小于0.05),这表明它可能是致病性的。作者假设了一种主导效应。患者总体生长不良,整体发育迟缓,但存在表型异质性。作者还将这种突变称为ARG45CYS(R45C),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸的编号。


.0005 TESSADORI-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征3

H4C5、TYR99HIS
临床变量:RCV003152472、RCV003340665

在2名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-3(TEBIVANED3;619950)的非血缘关系患者(P23和P24)中,Tessadory等人(2022)在H4C5基因中发现了一个从头杂合的c.295T-c转换(c.295T-c,NM_003545.3),导致在c-tail结构域的保守残基处发生tyr99到his(Y99H)的替换。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。斑马鱼胚胎中突变的表达导致严重的发育缺陷,这表明它可能是致病性的。作者假设了一种主导效应。患者整体生长发育不良,整体发育迟缓,但存在表型异质性。作者还将这种突变称为TYR98HIS(Y98H),反映了减少第一个翻译后去除的甲硫氨酸编号的做法。


参考文献

  1. Albig,W.、Kioschis,P.、Poustka,A.、Meergans,K.、Doenecke,D。人类组蛋白基因组织:一个大簇内的非规则排列。基因组学40:314-3221997。[公共医学:9119399][全文:https://doi.org/10.1006/geno.1996.4592]

  2. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966]

  3. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2022.02.003]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Matthew B.Gross-更新时间:2013年7月2日

创建日期:
Rebekah S.Rasooly:1998年10月7日

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卡罗尔:2023年1月20日
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mgross:2010年7月22日
tkritzer:2003年3月31日
阿洛佩兹:1998年8月26日
阿洛佩兹:1998年7月14日
阿洛佩兹:1998年7月10日