条目-*602827-H4簇状组蛋白3;H4C3型-OMIM公司
 
*602827

H4簇合组蛋白3;H4C3型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员C;HIST1H4C公司
组蛋白基因簇1,H4C
HIST1集群,H4C
H4组蛋白家族,成员G;H4FG型
H4/G(H4/G)


HGNC批准的基因符号:H4C3型

细胞遗传学位置:第22页   基因组坐标(GRCh38):6:26,103,933-26,104,337 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
6页22.2 Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征1 619758 AD公司

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822).


克隆和表达

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)鉴定了小鼠和人类HIST1H4C基因。所有小鼠和人类H4基因,包括HIST1H4C,编码相同的蛋白质。


映射

通过对染色体6p21.3的YAC连接区的分析,Albig等人(1997年)以35个组蛋白基因簇为特征,包括H4/g。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因集群-1(HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4C。


基因功能

参见HIST1H4A(602822)获取H4组蛋白的功能信息。


分子遗传学

Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-1(TEBIVANED1;619758),Tessadori等人(2017)影响HIST1H4C基因中高度保守残基的杂合错义突变:K92Q(602827.0001)和K92R(602827.0002). 这些突变是通过三基全基因组测序发现的,在1名患者中从头发生,并从另2名患者的未受影响的父亲那里遗传而来,该父亲是嵌合体,他们是同胞。对患者成纤维细胞的研究表明,突变蛋白并入核小体,但突变组蛋白H4分子部分中没有K92上的翻译后标记,如乙酰化和泛素化。患者成纤维细胞的RNA-seq分析显示多种基因的差异表达,包括组蛋白基因和参与染色体组织、DNA包装的基因,以及许多细胞周期相关基因。

Tessadori等人(2022年)在H4C3基因中发现了一个新的杂合K91Q突变(602827.0001)3名患有TEBIVANED1的非血缘男性患者(P4-P6)。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。该变体位于蛋白质的C末端结构域。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。发现另外三个具有类似神经发育障碍的个体(P1-P3)携带影响核心球状结构域(P32A和P32L)中相同保守残基的从头杂合变异体。gnomAD数据库中不存在任何变体。然而,与野生型相比,斑马鱼胚胎中P32A变异体的表达仅诱导了一些发育缺陷;未进行P32L的功能研究。


动物模型

Tessadori等人(2017)发现斑马鱼中HIST1H4C K92Q和K92R突变的表达导致严重的胚胎发育缺陷,包括大脑和眼睛发育不全、身体轴发育缺陷和尾巴畸形。这些发现概括了携带突变的患者的一些特征。对突变胚胎的分析显示,双链DNA断裂、基因组不稳定、头部和尾部细胞凋亡和核断裂增加,并破坏了细胞周期的进展。与对照组相比,也有证据表明H4K92乙酰化和泛素化异常。这些发现表明组蛋白H4K92在早期胚胎发育中起着重要作用。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经发育综合征1

在一名患有Tessadori Bicknell van Haaften神经发育综合征-1(TEBIVANED1;619758),Tessadori等人(2017)在H4C3基因中发现了一个新的杂合c.274A-c颠倒,导致在高度保守的残基上发生lys92-to-gln(K92Q)替换。该突变是通过三基全基因组测序发现的。对患者成纤维细胞的分析显示,突变组蛋白H4分子中K92的翻译后修饰被破坏,以及组蛋白动力学和细胞周期进展相关基因差异表达的RNA-seq证据。(作者将该变体称为LYS91GLN,并指出“对于组蛋白,翻译过程中并入的N末端蛋氨酸残基被切除,导致氨基酸数发生-1移位。”)

Tessadori等人(2022年)在H4C3基因中发现了一个新的杂合c.274A-c突变(c.274A-c,NM_003542.4),导致3名患有TEVANED1的无关男性患者(P4-P6)发生K91Q突变。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。该变体位于蛋白质的C末端结构域。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假定了一种主导效应。患者总体生长不良、张力减退、整体发育迟缓和畸形特征。两人患有自闭症谱系障碍。


.0002 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征1

Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-1(TEBIVANED1;619758),Tessadori等人(2017)在H4C3基因中鉴定出杂合c.275A-G转换,导致在高度保守的残基处发生lys91-to-arg(K91R)替换。该突变是从未受影响的父亲那里遗传而来的,他因该突变而嵌合体。对患者成纤维细胞的分析显示,突变组蛋白H4分子中K91的翻译后修饰被破坏,以及组蛋白动力学和细胞周期进展相关基因差异表达的RNA-seq证据。患者3在婴儿早期死于多器官衰竭。(作者将该变体称为LYS91GLN,并指出“对于组蛋白,翻译过程中并入的N末端蛋氨酸残基被切除,导致氨基酸数发生-1移位。”)


参考文献

  1. Albig,W.,Kioschis,P.,Poustka,A.,Meergans,K.,Doenecke,D。人类组蛋白基因组织:一个大簇内的非规则排列。基因组学40:314-3221997。[公共医学:9119399,相关引文][全文]

  2. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966,相关引文]

  3. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563,图像,相关引文][全文]

  4. Tessadori,F.,Giltay,J.C.,Hurst,J.A.,Massink,M.P.,Duran,K.,Vos,H.R.,van Es,R.M.,《解读发展障碍研究》,Scott,R.H.,van-Gassen,K.L.I.,Bakkers,J.,van-Haaften,G。影响组蛋白H4核心的种系突变通过改变DNA损伤反应和细胞周期控制导致发育综合征。自然基因。49: 1642-1646, 2017.[公共医学:28920961,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年2月21日
Matthew B.Gross-更新日期:2013年7月2日
创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1998年7月10日
阿洛佩兹:2023年3月21日
颂歌:2023年1月20日
阿洛佩兹:2022年12月7日
ckniffin:2022年11月7日
mgross:2022年4月21日
卡罗尔:2022年2月3日
卡罗尔:2022年2月24日
ckniffin:2022年2月21日
mgross:2013年7月2日
mgross:2010年7月22日
tkritzer:2003年3月31日
阿洛佩兹:1998年8月26日
阿洛佩兹:1998年7月14日
阿洛佩兹:1998年7月10日

*602827

H4簇合组蛋白3;H4C3型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员C;HIST1H4C公司
组蛋白基因簇1,H4C
HIST1集群,H4C
H4组蛋白家族,成员G;H4FG型
H4/G(H4/G)


HGNC批准的基因符号:H4C3

细胞遗传学位置:6p22.2   基因组坐标(GRCh38):6:26103933-26104337 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第22页 Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征1 619758 常染色体显性

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822)。


克隆和表达

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002)鉴定了小鼠和人类HIST14C基因。所有小鼠和人类H4基因,包括HIST1H4C,编码相同的蛋白质。


映射

Albig等人(1997年)通过分析6p21.3号染色体上的YAC contig,确定了35个组蛋白基因簇的特征,包括H4/g。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因群-1(histone gene cluster-1,HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4C。


基因功能

有关H4组蛋白的功能信息,请参见HIST1H4A(602822)。


分子遗传学

在来自两个不相关家族的3名Tessadori Bicknell van Haaften神经发育综合征-1(TEBIVANED1;619758)患者中,Tessadori等人(2017)发现了影响HIST14C基因高度保守残基的杂合错义突变:K92Q(602827.0001)和K92R(602827.0002)。这些突变是通过三基全基因组测序发现的,在1名患者中从头发生,并从另2名患者的未受影响的父亲那里遗传而来,该父亲是嵌合体,他们是同胞。对患者成纤维细胞的研究表明,突变蛋白并入核小体,但突变组蛋白H4分子部分中没有K92上的翻译后标记,如乙酰化和泛素化。患者成纤维细胞的RNA-seq分析显示多种基因的差异表达,包括组蛋白基因和参与染色体组织、DNA包装的基因,以及许多细胞周期相关基因。

Tessadori等人(2022年)在3名患有TEBIVANED1的非血缘男性患者(P4-P6)的H4C3基因(602827.0001)中发现了一个新发杂合K91Q突变。通过外显子组测序发现的突变在gnomAD数据库中不存在。该变体位于蛋白质的C末端结构域。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假设了一种主导效应。发现另外三个具有类似神经发育障碍的个体(P1-P3)携带影响核心球状结构域(P32A和P32L)中相同保守残基的从头杂合变异体。gnomAD数据库中不存在任何变体。然而,与野生型相比,斑马鱼胚胎中P32A变异体的表达仅诱导了一些发育缺陷;未进行P32L的功能研究。


动物模型

Tessadori等人(2017年)发现,斑马鱼中HIST1H4C K92Q和K92R突变的表达导致严重的胚胎发育缺陷,包括大脑和眼睛发育不全、身体轴发育缺陷和尾巴畸形。这些发现概括了携带突变的患者的一些特征。对突变胚胎的分析表明,双链DNA断裂累积,基因组不稳定,细胞凋亡增加,头部和尾部细胞核断裂,细胞周期进程中断。与对照组相比,也有证据表明H4K92乙酰化和泛素化异常。这些发现表明组蛋白H4K92在早期胚胎发育中起着重要作用。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征1

H4C3、LYS92GLN
单号:rs2113887393,临床变量:RCV001838836

在一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-1(TEBIVANED1;619758)的9岁女孩(患者1)中,Tessadory等人(2017年)在H4C3基因中发现了一个从头杂合c.274A-c突变,导致在高度保守的残基上发生lys92-to-gln(K92Q)替换。该突变是通过三基全基因组测序发现的。对患者成纤维细胞的分析显示,突变组蛋白H4分子中K92的翻译后修饰被破坏,以及组蛋白动力学和细胞周期进展相关基因差异表达的RNA-seq证据。(作者将该变体称为LYS91GLN,并指出“对于组蛋白,翻译过程中并入的N末端蛋氨酸残基被切除,导致氨基酸数发生-1移位。”)

Tessadori等人(2022年)在H4C3基因中发现了一个从头杂合子c.274A-c颠倒(c.274A-c,NM_003542.4),导致3名患有TEVANED1的无关男性患者(P4-P6)发生K91Q突变。该突变是通过外显子组测序发现的,但gnomAD数据库中并不存在。该变体位于蛋白质的C末端结构域。斑马鱼胚胎中突变的表达导致了严重的发育缺陷,表明它具有致病性。作者假定了一种主导效应。患者总体生长不良、张力减退、整体发育迟缓和畸形特征。两人患有自闭症谱系障碍。


.0002 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征1

H4C3、LYS92ARG
单号:rs2113784630,临床变量:RCV001838837

在患有Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-1(TEBIVANED1;619758)的2个同胞(患者2和3)中,Tessadori等人(2017)在H4C3基因中发现了杂合的c.275A-G转换,导致在高度保守的残基处发生lys91到arg(K91R)的取代。该突变是从未受影响的父亲那里遗传而来的,他因该突变而嵌合体。对患者成纤维细胞的分析显示,突变组蛋白H4分子中K91的翻译后修饰被破坏,以及组蛋白动力学和细胞周期进展相关基因差异表达的RNA-seq证据。患者3在婴儿早期死于多器官衰竭。(作者将该变体称为LYS91GLN,并指出“对于组蛋白,翻译过程中并入的N末端蛋氨酸残基被切除,导致氨基酸数发生-1移位。”)


参考文献

  1. Albig,W.,Kioschis,P.,Poustka,A.,Meergans,K.,Doenecke,D。人类组蛋白基因组织:一个大簇内的非规则排列。基因组学40:314-3221997。[公共医学:9119399][全文:https://doi.org/10.1006/geno.1996.4592]

  2. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966]

  3. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2022.02.003]

  4. Tessadori,F.,Giltay,J.C.,Hurst,J.A.,Massink,M.P.,Duran,K.,Vos,H.R.,van Es,R.M.,《解读发展障碍研究》,Scott,R.H.,van-Gassen,K.L.I.,Bakkers,J.,van-Haaften,G。影响组蛋白H4核心的种系突变通过改变DNA损伤反应和细胞周期控制导致发育综合征。自然遗传学。49: 1642-1646, 2017.[公共医学:28920961][全文:https://doi.org/10.1038/ng.3956]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Cassandra L.Kniffin-更新日期:2022年2月21日
Matthew B.Gross-更新时间:2013年7月2日

创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1998年7月10日

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阿洛佩兹:2023年3月21日
卡罗尔:2023年1月20日
脱发:2022年12月7日
ckniffin:2022年11月7日
mgross:2022年4月21日
卡罗尔:2022年2月3日
卡罗尔:2022年2月24日
ckniffin:2022年2月21日
mgross:2013年7月2日
mgross:2010年7月22日
tkritzer:2003年3月31日
阿洛佩兹:1998年8月26日
阿洛佩兹:1998年7月14日
阿洛佩兹:1998年7月10日