条目-*602826-H4簇状组蛋白11;H4C11型-奥米姆
 
*602826

H4簇合组蛋白11;H4C11型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员J;HIST1H4J公司
组蛋白基因簇1,H4J
HIST1集群,H4J
H4组蛋白家族,成员E;H4FE公司
H4/E(H4/E)


HGNC批准的基因符号:H4C11型

细胞遗传学位置:6页22.1   基因组坐标(GRCh38):6:27,824,092-27,824,480 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第62.1页 Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征2 619759 AD公司

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822).


克隆和表达

Heintz等人(1981年)克隆了一个名为H4/e的基因,编码H4组蛋白。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)鉴定了小鼠和人类HIST1H4J基因。所有小鼠和人类H4基因,包括HIST1H4J,编码相同的蛋白质。


映射

通过分析6p22-p21.3中的YAC连接,Albig和Doenecke(1997)特征在于第二个由16个组蛋白基因组成的簇,包括H4/e,位于主要组蛋白基因簇的2Mb着丝粒上。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因集群-1(HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4J。


基因功能

参见HIST14A(602822)获取H4组蛋白的功能信息。


分子遗传学

一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-2(TEBIVANED2;619759),Tessadori等人(2020年)确定了影响HIST1H4J基因中高度保守残基的从头错义突变(K92E;602826.0001). 该突变是通过基于三组的外显子组测序发现的,但在包括gnomAD在内的公共数据库中并不存在。虽然没有对患者细胞进行研究,但斑马鱼胚胎中突变的表达导致了类似的发育异常(见动物模型)。作者的结论是,突变将导致K92翻译后修饰缺陷,可能导致基因组不稳定,细胞周期受到干扰,HIST1H4C基因中K92突变相似的患者的功能研究证明了这一点(602827).


动物模型

Tessadori等人(2020年)发现斑马鱼胚胎中HIST1H4J K92E突变的表达导致头部结构、大脑和眼睛、身体轴生长和尾巴的发育缺陷,与突变患者的特征相似。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养综合征2(1例患者)

一名14岁西班牙男孩患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-2(TEBIVANED2;619759),Tessadori等人(2020年)在H4C11基因中发现了一个从头杂合子c.274A-G转换(chr6.27792176A-G,GRCh37),导致在高度保守的残基上发生lys92-to-glu(K92E)替换。该突变是通过三基外显子组测序发现的,在公共数据库中不存在,包括gnomAD。未对患者细胞进行研究,但斑马鱼胚胎中突变的表达导致头部结构、大脑和眼睛、身体轴生长和尾巴的发育缺陷,与患者的特征类似。(作者将该变体称为LYS91GLN,并指出“对于组蛋白,翻译过程中并入的N末端蛋氨酸残基被切除,导致氨基酸数发生-1移位。”)


.0002未知重要性的变化

H4C11、ARG41CYS
   RCV003152467型

该变体被归类为具有未知意义的变体,因为其对Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-2的贡献(TEBIVANED2;619759)尚未确认。

一名10个月大的神经发育障碍男孩(第29页),Tessadori等人(2022年)在H4C11基因中发现了一个新的杂合子c.121C-T转换(c.121C-T,NM_021968.4),导致核心球状结构域中的arg41-to-cys(R41C)替换。通过外显子组测序发现的变体在gnomAD数据库中不存在。与野生型相比,斑马鱼胚胎中变异体的表达并没有引起显著的发育缺陷。Tessadori等人(2022年)指出斑马鱼检测存在固有的局限性。患者总体生长不良,伴有小头畸形(-5.14 SD)、张力减退、喂养困难、全身发育迟缓、尿道下裂和隐睾。畸形特征包括圆脸、内眦皱褶、杏仁状眼睛、睑裂向上倾斜、鼻梁宽阔、嘴角向下和下唇外翻。作者还将这种突变称为ARG40CYS(R40C),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸的编号。


参考文献

  1. W·阿尔比格(Albig,W.)、D·多内克(Doenecke,D.)。人类组蛋白基因簇位于D6S105位点。嗯,遗传学。101: 284-294, 1997.[公共医学:9439656,相关引文][全文]

  2. 海因茨,N.,泽尼克,M.,罗德,R.G。人类组蛋白基因的结构:聚集但不串联重复。手机24:661-6681981。[公共医学:6265100,相关引文][全文]

  3. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966,相关引文]

  4. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563,图像,相关引文][全文]

  5. Tessadori,F.、Rehman,A.U.、Giltay,J.C.、Xia,F.,Streff,H.、Duran,K.、Bakkers,J.、Lalani,S.R.、van Haaften,G。人类HIST1H4J基因中的一个从头变异会导致类似于HIST1Hz相关神经发育障碍的综合征。欧洲。J.嗯,基因。28: 674-678, 2020.[公共医学:31804630,图像,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Cassandra L.Kniffin-更新日期:2022年2月21日
Matthew B.Gross-更新日期:2013年7月2日
创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1998年7月10日
卡罗尔:2023年1月20日
阿洛佩兹:2022年12月7日
阿洛佩兹:2022年12月7日
阿洛佩兹:2022年12月7日
ckniffin:2022年11月7日
mgross:2022年4月21日
卡罗尔:2022年2月24日
ckniffin:2022年2月21日
mgross:2013年7月2日
mgross:2010年7月22日
tkritzer:2003年3月31日
阿洛佩兹:1998年8月26日
阿洛佩兹:1998年7月14日
阿洛佩兹:1998年7月10日
阿洛佩兹:1998年7月10日

*602826

H4簇合组蛋白11;H4C11型


备选标题;符号

组蛋白基因簇1,H4组蛋白家族,成员J;HIST1H4J公司
组蛋白基因簇1,H4J
HIST1集群,H4J
H4组蛋白家族,成员E;H4FE公司
H4/E(H4/E)


HGNC批准的基因符号:H4C11

细胞遗传学位置:6p22.1   基因组坐标(GRCh38):6:27824092-27824480 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第62.1页 Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征2 619759 常染色体显性

文本

有关组蛋白、组蛋白基因簇和H4组蛋白家族的背景信息,请参阅HIST1H4A(602822)。


克隆和表达

Heintz等人(1981年)克隆了一个名为H4/e的基因,编码H4组蛋白。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002年)鉴定了小鼠和人类HIST1H4J基因。所有小鼠和人类H4基因,包括HIST1H4J,编码相同的蛋白质。


映射

通过对来自6p22-p21.3的YAC contig的分析,Albig和Doenecke(1997)描述了第二组16个组蛋白基因,包括H4/e,位于主要组蛋白基因簇的2Mb着丝粒。

通过基因组序列分析,Marzluff等人(2002)确定染色体6p22-p21上的组蛋白基因簇,他们称之为组蛋白基因群-1(histone gene cluster-1,HIST1),包含55个组蛋白基因,包括HIST1H4J。


基因功能

有关H4组蛋白的功能信息,请参见HIST1H4A(602822)。


分子遗传学

在一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-2(TEBIVANED2;619759)的西班牙裔男孩中,Tessadory等人(2020年)发现了影响HIST1H4J基因中高度保守残基的从头错义突变(K92E;602826.0001)。该突变是通过基于三组的外显子组测序发现的,但在包括gnomAD在内的公共数据库中并不存在。虽然没有对患者细胞进行研究,但斑马鱼胚胎中突变的表达导致了类似的发育异常(见动物模型)。作者得出结论,突变将导致K92翻译后修饰缺陷,可能导致基因组不稳定,细胞周期受到干扰,HIST1H4C基因(602827)中K92突变相似患者的功能研究证明了这一点。


动物模型

Tessadori等人(2020年)发现,斑马鱼胚胎中HIST1H4J K92E突变的表达导致头部结构、大脑和眼睛、身体轴生长和尾巴的发育缺陷,与在发生突变的患者中观察到的特征类似。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001 TESSADORI-BICKNELL-VAN HAAFTEN神经营养不良综合征2(1例)

H4C11、LYS92GLU
单号:rs2113887393,临床变量:RCV001838835

在一名患有Tessadori-Bicknell-van Haaften神经发育综合征-2(TEBIVANED2;619759)的14岁西班牙裔男孩中,Tessadory等人(2020年)在H4C11基因中发现了一个从头杂合的c.274A-G转变(chr6.27792176A-G,GRCh37),导致在高度保守的残基上发生lys92-to-glu(K92E)替代。该突变是通过三基外显子组测序发现的,在公共数据库中不存在,包括gnomAD。未对患者细胞进行研究,但斑马鱼胚胎中突变的表达导致头部结构、大脑和眼睛、身体轴生长和尾巴的发育缺陷,与患者的特征类似。(作者将该变体称为LYS91GLN,并指出“对于组蛋白,翻译过程中并入的N末端蛋氨酸残基被切除,导致氨基酸数发生-1移位。”)


.0002未知重要性的变化

H4C11,ARG41CYS
临床变量:RCV003152467

该变体被归类为具有未知意义的变体,因为其对Tessadori-Bicknell-van-Haaften神经发育综合征-2(TEBIVANED2;619759)的贡献尚未得到证实。

在一名患有神经发育障碍的10个月大男孩(P29)中,Tessadori等人(2022年)在H4C11基因中发现了一个从头杂合子c.121C-T转变(c.121C-T,NM_021968.4),导致核心球状结构域中的arg41-to-cys(R41C)替代。通过外显子组测序发现的变体在gnomAD数据库中不存在。与野生型相比,斑马鱼胚胎中变异体的表达并没有引起显著的发育缺陷。Tessadori等人(2022年)指出斑马鱼分析存在固有局限性。患者总体生长不良,伴有小头畸形(-5.14 SD)、张力减退、喂养困难、全身发育迟缓、尿道下裂和隐睾。畸形特征包括圆脸、上颚褶皱、杏仁状眼睛、上睑裂、宽阔的鼻梁、下垂的嘴角和外翻的下唇。作者还将这种突变称为ARG40CYS(R40C),反映了去掉第一个翻译后去除的蛋氨酸的编号。


参考文献

  1. W·阿尔比格(Albig,W.)、D·多内克(Doenecke,D.)。人类组蛋白基因簇位于D6S105位点。嗯,遗传学。101: 284-294, 1997.[公共医学:9439656][全文:https://doi.org/10.1007/s004390050630]

  2. 海因茨,N.,泽尼克,M.,罗德,R.G。人类组蛋白基因的结构:聚集但不串联重复。手机24:661-6681981。[公共医学:6265100][全文:https://doi.org/10.1016/0092-8674(81)90092-1]

  3. Marzluff,W.F.、Gongidi,P.、Woods,K.R.、Jin,J.、Maltais,L.J。人类和小鼠的复制依赖性组蛋白基因。基因组学80:487-4982002。[公共医学:12408966]

  4. Tessadori,F.,Duran,K.,Knapp,K.Fellner,M.,《解读发展障碍研究》,Smithson,S.,Beleza Meireles,A.,Elting,M.W.,Waisfisz,Q.,O'Donnell-Luria,A.,Nowak,C.,Douglas,J.,以及其他54人。多组蛋白H4基因之间反复出现的新发错义变异体是神经发育综合征的基础。Am.J.Hum.遗传学。109: 750-758, 2022.[公共医学:35202563][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2022.02.003]

  5. Tessadori,F.、Rehman,A.U.、Giltay,J.C.、Xia,F.,Streff,H.、Duran,K.、Bakkers,J.、Lalani,S.R.、van Haaften,G。人类HIST1H4J基因中的一个从头变异会导致类似于HIST1Hz相关神经发育障碍的综合征。欧洲。J.嗯,基因。28: 674-678, 2020.[公共医学:31804630][全文:https://doi.org/10.1038/s41431-019-0552-9]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2022年11月7日
Cassandra L.Kniffin-更新日期:2022年2月21日
Matthew B.Gross-更新日期:2013年7月2日

创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1998年7月10日

编辑历史记录:
卡罗尔:2023年1月20日
阿洛佩兹:2022年12月7日
阿洛佩兹:2022年12月7日
阿洛佩兹:2022年12月7日
ckniffin:2022年11月7日
mgross:2022年4月21日
卡罗尔:2022年2月24日
ckniffin:2022年2月21日
mgross:2013年7月2日
mgross:2010年7月22日
tkritzer:2003年3月31日
阿洛佩兹:1998年8月26日
阿洛佩兹:1998年7月14日
阿洛佩兹:1998年7月10日
阿洛佩兹:1998年7月10日