条目-*186790-CD3抗原,δ亚单位;CD3D系统-OMIM公司
 
*186790

CD3抗原,δ亚单位;CD3D系统


备选标题;符号

CD3-三角洲
T细胞抗原受体复合物,T3的δ亚单位;T3D型
OKT3,三角洲链


HGNC批准的基因符号:CD3D系统

细胞遗传学位置:11季度23.3   基因组坐标(GRCh38):11:118,338,954-118,342,705 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
11季度23.3 免疫缺陷19,严重合并 615617 应收账

文本

描述

T细胞抗原受体有多种成分:α(参见186880)和β(请参阅186930)由二硫键连接的亚单位,以及T3、ε(CD3E;186830)、δ(CD3D)、γ(CD3G;186740)和zeta(CD3Z;186780).

T细胞受体复合物由α和β或γ和δ变异链组成,与不变链CD3G、CD3D、CD3E和CD3Z相关,配对为突变排斥异二聚体。带有α(TCRA)和β(TCRB)链的T细胞被称为α/βT细胞,而带有γ(TCRG;参见186970)和增量(TCRD;参见186810)链称为γ/δT细胞。在发育过程中,CD3蛋白复合物在胸腺细胞从未成熟前体向最终成熟CD4+或CD8+单阳性T细胞的过渡中起着重要作用。通过基因敲除实现的小鼠4种CD3组分中任何一种的选择性缺失,会导致T细胞发育轻度至重度(尽管不完全)的阻滞。同样,人类的CD3G或CD3E缺陷会导致T细胞成熟的部分停滞和中度免疫缺陷;看见186740186830分别用于描述特定突变(总结Dadi等人,2003年).


基因功能

在胸腺中,识别自身主要组织相容性复合体的未成熟胸腺细胞通过阳性选择得以存活和分化。相反,通过阴性选择去除明显的自身反应性胸腺细胞。CD3D缺乏小鼠的胸腺细胞发育停滞在CD4/CD8双阳性阶段,T细胞抗原受体(TCR;参见186880).Delgado等人(2000年)报告ERK(MAPK3;601795)而不是p38(MAPK14;600289)调节负选择或JNK1(MAPK8;601158),在这些小鼠中也缺乏。他们表明,阳性选择可分化为更成熟的胸腺细胞以及TCR、CD5(153340)和CD69(107273)表达和ERK激活,在TCR参与后,通过CD3D的表达(带或不带细胞质尾部)进行挽救。尽管SLP76(LCP2;601603)和VAV(164875)CD3D缺乏的胸腺细胞磷酸化未受影响,LAT磷酸化(602354)被严重削弱。同样,无尾CD3D的表达恢复了LAT酪氨酸磷酸化和其他下游事件。无尾CD3D的存在也恢复了脂筏中酪氨酸磷酸化CD3Z的水平(参见604597Simons和Ikonen(1997)),其中LAT是构成性定位的,可能解释了LAT磷酸化下游的信号缺陷。

Dadi等人(2003)检查CD3D缺陷婴儿的胸腺,发现T细胞发育在TCR前表达阶段停滞,几乎完全没有循环成熟T细胞,也完全没有γ/δT细胞。结果表明,与CD3E和CD3G不同,CD3D对T细胞发育至关重要。De Saint Basile等人(2004年)对CD3D缺陷胎儿的胸腺进行检查,发现T细胞分化在进入双阳性(CD4+/CD8+)阶段时被阻断,中间CD4-单阳性细胞积聚。他们得出结论,在人类胸腺生成的早期阶段需要CD3D。


基因结构

Van den Elsen等人(1986年)证明T3D基因长约4kb,包含5个外显子。


映射

通过在杂交细胞中使用cDNA克隆,van den Elsen等人(1985)将T3 T细胞抗原(OKT3)δ链的基因指定为11q23-11qter。通过平行方法发现小鼠对应物位于9号染色体上。该基因和THY1都可能具有功能意义(188230)人类11q号染色体和小鼠9号染色体的定位。这种解释并不存在于共同的进化起源中,因为它们没有显示出序列同源性。Rabbitts等人(1985年)确认了11号染色体上的分配。

使用标准克隆技术和场反转凝胶电泳,Tunnacliffe等人(1987)显示了3个CD3基因的紧密物理连锁。CD3-gamma和CD3-delta的基因紧密相连,相距约1.6kb,以头对头的方向组织。CD3-gamma/CD3-delta基因对位于CD3-epsilon基因的300 kb范围内,因此这些基因在11q23上形成紧密相连的簇。就T细胞发育过程中同时激活而言,聚集可能很重要。CD3E与CD3G/CD3D的分离可能只有20kb。通过场反转凝胶电泳和分子克隆,Tunnacliffe等人(1988年)发现这3个基因位于50 kb的DNA范围内,定向3素数--CD3G--5-prime:5-prime--CD3D--3-prime:3-prime--CD3E-5-prime。

使用19个生物素标记探针对涉及带11q23的4种不同易位进行研究,Rowley等人(1990年)发现CD3D在所有4例中都接近断点,PBGD(609806)、THY1、SRPR(182180)和ETS1(164720)位于断点的远端。与含有320kb人类DNA(包括CD3D和CD3G基因)的酵母人工染色体(YACs)的酵母克隆基因组DNA杂交表明,YACs在所有4个易位中都分裂。因此,每个易位的断点都发生在这些YAC所包围的320 kb范围内。


分子遗传学

原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617)表现为T细胞阴性、B细胞阳性、自然杀伤(NK)细胞阳性的严重联合免疫缺陷(SCID)Dadi等人(2003)在CD3D基因(R68X;186790.0001).

在2个IMD19表现为T-、B+、NK+SCID的近亲家庭的受影响成员中,De Saint Basile等人(2004年)确定CD3D基因的纯合子突变(186790.0001186790.0002).

Gil等人(2011年)鉴定了CD3D基因中的纯合剪接位点突变(IVS2+5G-a;186790.0003)2名无血缘关系的厄瓜多尔儿童,其父母无血缘,患有IMD19。两名患者均为T-α/β阴性、T-γ/δ阳性、B阳性和NK阳性。


ALLELIC变体( 3精选示例):

.0001免疫缺陷19

门诺派血统原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617)表现为T-、B+、NK+SCID,Dadi等人(2003)在CD3D基因中鉴定了纯合的202C-T转变,导致该蛋白的细胞外结构域中的arg68到ter(R68X)取代。这3个受影响的个体是近亲,每个人都有不同的同胞关系。

De Saint Basile等人(2004年)确定了两个患有T-、B+、NK+SCID的近亲家庭受影响成员的R68X突变纯合子。在父母的基因组DNA中检测到正常和突变的等位基因。

Yu等人(2011年)回顾性研究了一对患有T-、B+、NK+SCID的兄弟姐妹,他们是R68X突变的纯合子。患者表现出典型的临床特征,包括发育不良、腹泻、复发和/或机会性感染,包括真菌和巨细胞病毒。两者都有淋巴细胞减少,缺乏循环CD3+T细胞,以及T细胞增殖反应降低。两人都接受了骨髓移植;一个同胞不久后死亡,而另一个则活了下来,16岁。


.0002免疫缺陷19

在患有原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617)表现为T-、B+、NK+SCID,来自血亲家庭,de Saint Basile等人(2004)确定CD3D基因第3外显子279C-a颠倒的纯合子,导致cys93-ter(C93X)替换。在父母和未受影响同胞的基因组DNA中检测到正常和突变的等位基因。


.0003免疫缺陷19

Gil等人(2011年)据报道,2名非血缘父母的无关厄瓜多尔男性儿童在13个月和5个月大时出现原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617)表现为SCID和低CD3表达。两名患者均为Tα/β阴性、Tγ/δ阳性、B阳性和NK阳性。患者接受了单倍体CD34(142230)-阳性干细胞移植分别在23个月龄和8个月龄时进行。后者死亡,可能是由于尸检时在多个器官中发现巨细胞病毒所致,但前者在4岁时情况良好。CD3D RNA测序显示,第2外显子在框内缺失,该外显子编码细胞外Ig样结构域。基因组DNA测序检测到内含子2(IVS2+5G-a;186790.0003)CD3D基因。患者的父母是突变的杂合子携带者,他们有一个共同的核心CD3单倍型,这表明他们有共同的创始人突变。定量RT-PCR显示患者外周血单个核细胞中有少量野生型CD3D转录物,Western blot分析显示患者T细胞表达CD3D正常水平的一半。在每个细胞的基础上,患者的T-alpha/beta和T-gamma/delta细胞对有丝分裂原表现出正常反应,但CD69的诱导减少(107273)和CD25(IL2RA;147730).Gil等人(2011年)结论是泄漏的IVS2+5G-A突变减少了CD3D链并阻断了Tα/β而不是Tγ/δ选择。


参考文献

  1. 香港达迪、A.J.西蒙、C.M.罗夫曼。CD3-δ缺陷对严重联合免疫缺陷患者α/β和γ/δT细胞系成熟的影响。《新英格兰医学杂志》349:1821-1828282003。注:勘误表:新工程医学杂志350:1803,仅限2004年。[公共医学:14602880,相关引文][全文]

  2. 圣巴兹勒,G.,盖斯曼,F.,弗洛里,E.,乌林·兰伯特,B.,苏代斯,C.,卡瓦扎纳·卡尔沃,M.,杜兰迪,A.,贾巴多,N.,费舍尔,A.,勒迪斯特,F。CD3δ或ε亚单位缺乏引起的严重联合免疫缺陷。临床杂志。投资。114: 1512-1517, 2004.[公共医学:15546002,相关引文][全文]

  3. Delgado,P.,Fernandez,E.,Dave,V.,Kappes,D.,Alarcon,B。CD3-delta将T细胞受体信号与ERK激活和胸腺细胞阳性选择偶联。《自然》406:426-4302000。[公共医学:10935641,相关引文][全文]

  4. Gil,J.、Busto,E.M.、Garcillan,B.、Chean,C.、Garcia-Rodriguez,M.C.、Diaz-Alderete,A.、Navarro,J.和Reine,J.,Mencia,A.、Gurbindo,D.、Belendez,C.、Gordillo,I.和其他9人。CD3D中的泄漏突变对α-β和γ-δT细胞产生不同影响,并导致Tα/β-T-γ/δ+B+NK+人SCID。临床杂志。投资。121:3872-38762011年。[公共医学:21926461,图像,相关引文][全文]

  5. Rabbitts,T.H.、Lefranc,M.P.、Stinson,M.A.、Sims,J.E.、Schroder,J.、Steinmetz,M.、Spurr,N.L.、Solomon,E.、Goodfellow,P.N。T细胞受体基因和T细胞重排基因的染色体定位:可能与人类T细胞白血病的特异性易位相关。EMBO J.4:1461-14651985年。[公共医学:3875483,相关引文][全文]

  6. Rowley,J.D.,Diaz,M.O.,Espinosa,R.,III,Patel,Y.D.,van Melle,E.,Ziemin,S.,Taillon,M.,Lichter,P.,Evans,G.A.,Kersey,J.H.,Ward,D.C.,Domer,P.H.和Le Beau,M.M。用生物素化探针定位人类急性白血病的染色体带11q23:用酵母人工染色体鉴定11q23易位断点。程序。美国国家科学院。科学。87: 9358-9362, 1990.[公共医学:2251277,相关引文][全文]

  7. Simons,K.,Ikonen,E。细胞膜中的功能性筏。《自然》387:569-5721997。[公共医学:9177342,相关引文][全文]

  8. Tunnacliffe,A.,Buluwela,L.,Rabbitts,T.H。人类11号染色体上三个CD3基因的物理连锁。EMBO期刊6:2953-29571987。[公共医学:2826124,相关引文][全文]

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  10. van den Elsen,P.,Bruns,G.,Gerhard,D.S.,Pravtcheva,D.,Jones,C.,Housman,D.,Ruddle,F.A.,Orkin,S.,Terhorst,C。将T3-T细胞受体复合物的T3-δ亚基的基因编码分配到人类11号染色体的长臂和小鼠9号染色体。程序。美国国家科学院。科学。82: 2920-2924, 1985.[公共医学:3857625,相关引文][全文]

  11. van den Elsen,P.,Georgopoulos,K.,Shepley,B.-A.,Orkin,S.,Terhorst,C。人类和小鼠T细胞受体/T3复合物δ链编码基因的外显子/内含子组织。程序。美国国家科学院。科学。83: 2944-2948, 1986.[公共医学:2939461,相关引文][全文]

  12. Yu,G.P.,Nadeau,K.C.,Berk,D.R.,de Sant Basile,G.,Lambert,N.,Knapnougel,P.,Roberts,J.,Kavanau,K,Dunn,E.,Stiehm,E.R.,Lewis,D.B.,Umetsu,D.T.,Puck,J.M.,Cowan,M.J。九名T-B+NK+SCID患者的基因型、表型和预后。佩蒂亚特。移植。15: 733-741, 2011.[公共医学:21883749,相关引文][全文]


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*186790

CD3抗原,δ亚单位;CD3D系统


备选标题;符号

CD3-三角洲
T细胞抗原受体复合物,T3的δ亚单位;第三天
OKT3,三角洲链


HGNC批准的基因符号:CD3D

细胞遗传学位置:11q23.3   基因组坐标(GRCh38):11:1183338954-118342705 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
11季度23.3 免疫缺陷19,严重合并 615617 常染色体隐性

文本

描述

T细胞抗原受体有多个成分:α(见186880)和β(见186930)亚单位,它们通过二硫键连接,以及T3、ε(CD3E;186830)、δ(CD3D)、γ(CD3G;186740)和zeta(CD3Z;186780)的4个亚单位。

T细胞受体复合物由α和β或γ和δ变异链组成,与不变链CD3G、CD3D、CD3E和CD3Z相关,配对为突变排斥异二聚体。具有α(TCRA)和β(TCRB)链的T细胞被称为α/βT细胞,具有γ(TCRG;见186970)和δ(TCRD;见186810)链的T细胞被称为γ/δT细胞。在发育过程中,CD3蛋白复合物在胸腺细胞从未成熟前体向最终成熟CD4+或CD8+单阳性T细胞的过渡中起着重要作用。通过基因敲除实现的小鼠4种CD3组分中任何一种的选择性缺失,会导致T细胞发育轻度至重度(尽管不完全)的阻滞。同样,人类的CD3G或CD3E缺陷会导致T细胞成熟的部分停滞和中度免疫缺陷;具体突变的描述分别参见186740和186830(Dadi等人,2003年总结)。


基因功能

在胸腺中,识别自身主要组织相容性复合体的未成熟胸腺细胞通过阳性选择得以存活和分化。相反,公然自我激活的胸腺细胞通过阴性选择被清除。CD3D缺乏小鼠的胸腺细胞发育停滞在CD4/CD8双阳性阶段,T细胞抗原受体的表达显著降低(TCR;见186880)。Delgado等人(2000年)报告称,在这些小鼠中,调节负选择的ERK(MAPK3;601795)而非p38(MAPK14;600289)的激活,或JNK1(MAPK8;601158)也缺乏。他们表明,分化为更成熟胸腺细胞的阳性选择,以及TCR、CD5(153340)和CD69(107273)的表达和ERK的激活,在TCR参与后,通过CD3D的表达(带或不带细胞质尾部)得以挽救。尽管SLP76(LCP2;601603)和VAV(164875)的磷酸化在CD3D缺陷的胸腺细胞中没有受到损害,但LAT(602354)的磷酸化严重降低。同样,无尾CD3D的表达恢复了LAT酪氨酸磷酸化和其他下游事件。无尾CD3D的存在也恢复了脂筏中酪氨酸磷酸化CD3Z的水平(参见604597和Simons和Ikonen(1997)),LAT在脂筏中组成性定位,可能解释了LAT磷酸化下游的信号缺陷。

Dadi等人(2003年)检查了CD3D缺陷婴儿的胸腺,发现T细胞发育在TCR前表达阶段停滞,几乎完全没有循环成熟T细胞,也完全没有γ/δT细胞。结果表明,与CD3E和CD3G不同,CD3D对T细胞发育至关重要。De Saint Basile等人(2004年)检查了CD3D缺陷胎儿的胸腺,发现T细胞分化在进入双阳性(CD4+/CD8+)阶段时被阻断,中间CD4单阳性细胞积聚。他们得出结论,在人类胸腺生成的早期阶段需要CD3D。


基因结构

Van den Elsen等人(1986年)证明,T3D基因长约4kb,包含5个外显子。


映射

通过在杂交细胞中使用cDNA克隆,van den Elsen等人(1985年)将T3 T细胞抗原(OKT3)δ链的基因指定为11q23-11qter。通过平行方法发现小鼠对应物位于9号染色体上。该基因和THY1(188230)均定位于人类11q染色体和小鼠9号染色体,这可能具有功能意义。这种解释并不存在于共同的进化起源中,因为它们没有序列同源性。Rabbitts等人(1985年)确认了11号染色体上的分配。

Tunnacliffe等人(1987年)利用标准克隆技术和场反转凝胶电泳证明了3个CD3基因的紧密物理联系。CD3-gamma和CD3-delta的基因紧密相连,相距约1.6kb,以头对头的方向组织。CD3γ/CD3δ基因对在CD3ε基因的300kb范围内,因此这些基因在11q23上形成紧密连接的簇。就T细胞发育过程中它们同时激活而言,聚集可能很重要。CD3E与CD3G/CD3D的分离可能只有20kb。通过场反转凝胶电泳和分子克隆,Tunnacliffe等人(1988)发现这3个基因位于50 kb的DNA范围内,定向3素数--CD3G--5-prime:5-prime--CD3D--3-prime:3-prime--CD3E-5-prime。

Rowley等人(1990年)使用19个生物素标记探针对涉及带11q23的4种不同易位进行研究,发现CD3D在所有4种易位中都接近断点,PBGD(609806)、THY1、SRPR(182180)和ETS1(164720)位于断点的远端。与含有320kb人类DNA(包括CD3D和CD3G基因)的酵母人工染色体(YACs)的酵母克隆基因组DNA杂交表明,YACs在所有4个易位中都分裂。因此,每个易位的断点都发生在这些YAC所包围的320 kb范围内。


分子遗传学

Dadi等人(2003年)在一个表现为T细胞阴性、B细胞阳性、自然杀伤(NK)细胞阳性的严重联合免疫缺陷(SCID)的原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617)家族的3名成员中,发现CD3D基因中存在纯合截断突变(R68X;186790.0001)。

在IMD19表现为T-、B+、NK+SCID的2个近亲家族的受影响成员中,De Saint Basile等人(2004年)确定了CD3D基因的纯合子突变(186790.0001和186790.0002)。

Gil等人(2011年)在2名来自患有IMD19的非血缘父母的无血缘关系厄瓜多尔儿童的CD3D基因(IVS2+5G-a;186790.0003)中发现了纯合子剪接位点突变。两名患者均为T-α/β阴性、T-γ/δ阳性、B阳性和NK阳性。


等位基因变体 3个选定示例):

.0001免疫缺陷19

CD3D、ARG68TER
SNP:rs111033580,gnomAD:rs111033580,临床变量:RCV000083294,RCV002508775

在表现为T-、B+、NK+SCID的门诺派血统原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617)家族的3名受影响成员中,Dadi等人(2003年)在CD3D基因中确定了纯合202C-T转换,导致蛋白质胞外结构域中的arg68-ter(R68X)替代。这3个受影响的个体是近亲,每个人都有不同的同胞关系。

De Saint Basile等人(2004年)在两个患有T-、B+、NK+SCID的近亲家庭的受影响成员中确定了R68X突变的纯合子。在父母的基因组DNA中检测到正常和突变的等位基因。

Yu等人(2011)回顾性研究了一对患有T-、B+、NK+SCID的兄弟姐妹,他们是R68X突变的纯合子。患者表现出典型的临床特征,包括发育不良、腹泻、复发和/或机会性感染,包括真菌和巨细胞病毒。两者都有淋巴细胞减少,缺乏循环CD3+T细胞,以及T细胞增殖反应降低。两人都接受了骨髓移植;一个同胞不久后死亡,而另一个则活了下来,16岁。


.0002免疫缺陷19

CD3D、CYS93TER
SNP:rs111033581,gnomAD:rs111033581,临床变量:RCV000083295

在一名原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617)患者中,该患者表现为一个血缘家族的T-、B+、NK+SCID,de Saint-Basile等人(2004年)在CD3D基因第3外显子中发现279C-a突变的纯合子,导致cys93-ter(C93X)替代。在父母和未受影响同胞的基因组DNA中检测到正常和突变的等位基因。


.0003免疫缺陷19

CD3D、IVS2DS、G-A、+5
SNP:rs730880296,gnomAD:rs730880296,临床变量:RCV000157634,RCV003398816

Gil等人(2011年)报告了2名非血缘父母的无关厄瓜多尔男性儿童,他们在13个月和5个月大时出现原发性免疫缺陷-19(IMD19;615617),表现为SCID和低CD3表达。两名患者均为T-α/β阴性、T-γ/δ阳性、B阳性和NK阳性。这些患者分别在23个月和8个月时接受了单倍体CD34(142230)阳性干细胞移植。后者死亡,可能是由于尸检时在多个器官中发现巨细胞病毒所致,但前者在4岁时情况良好。CD3D RNA测序显示,第2外显子在框内缺失,该外显子编码细胞外Ig样结构域。基因组DNA测序在CD3D基因内含子2(IVS2+5G-a;186790.0003)的5素剪接供体位点+5处检测到纯合G-a转换。患者的父母是突变的杂合子携带者,他们有一个共同的核心CD3单倍型,这表明他们有共同的创始人突变。定量RT-PCR显示患者外周血单个核细胞中有少量野生型CD3D转录物,Western blot分析显示患者T细胞表达CD3D正常水平的一半。在每个细胞的基础上,患者T-alpha/beta和T-gamma/delta细胞对有丝分裂原表现出正常反应,但CD69(107273)和CD25(IL2RA;147730)的诱导减少。Gil等人(2011年)得出结论,泄漏的IVS2+5G-A突变减少了CD3D链,并阻断了T-alpha/beta而非T-gamma/delta选择。


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