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.2022年5月1日;107(5):1119-1130.
doi:10.3324/haematol.2021.278743。

侵袭性B细胞淋巴瘤对CDK12抑制的反应和耐药性

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侵袭性B细胞淋巴瘤对CDK12抑制的反应和耐药性

京高等。 血液学. .

摘要

尽管弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和套细胞淋巴瘤(MCL)患者的治疗取得了显著进展,但由于耐药性的出现和随后的疾病进展,复发性疾病患者的预后仍然很差。迫切需要确定这些疾病的新靶点和治疗策略。在这里,我们报道了MCL和DLBCL对转录靶向药物都非常敏感,特别是THZ531,一种细胞周期蛋白依赖性激酶12(CDK12)的共价抑制剂。通过实施药物基因组学和基于细胞的药物筛选,我们发现THZ531导致癌基因转录程序的抑制,特别是DNA损伤反应途径、MYC靶基因和mTOR-4EBP1-MCL-1轴,有助于显著抑制淋巴瘤在体外我们还通过过度激活MEK-ERK和PI3K-AKT-mTOR通路和上调多药耐药-1(MDR1)蛋白,重新鉴定并建立了获得性THZ531耐药淋巴瘤细胞。值得注意的是,EZH2抑制剂通过竞争性抑制MDR1逆转了对THZ531的耐药性,并与THZ53l结合,协同抑制MCL和DLBCL的体外生长。我们的研究表明,CDK12抑制剂单独或与EZH2抑制剂一起,有望成为治疗难治性DLBCL和MCL的新的有效方法。

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图1。
图1。
地幔细胞淋巴瘤和其他B细胞淋巴瘤细胞系和原始样本对THZ531抑制CDK12的作用非常敏感,无论其遗传背景和耐药状态如何。(A) 原木条形图1050%抑制浓度(IC50)THZ531治疗B细胞淋巴瘤细胞株72小时(B)MCL-1(左)或磷酸4EBP1蛋白水平(右)与THZ531IC的相关性50在B细胞淋巴瘤细胞系中。(C) 原发性套细胞淋巴瘤标本的基于图像的细胞活性分析;3x10像素6细胞接种在含有细胞外基质和淋巴瘤基质细胞的384孔板中。将五种连续稀释浓度的THZ531加入培养基中,每30分钟对平板连续成像144小时。使用数字成像分析算法分析所有图像,以基于膜运动检测细胞活力,并通过曲线下面积(AUC)量化活力的变化。(D) MCL-1(左)、ATM(中)和ATR(右)基因表达的相关性(log2TPM)与CDK12基因表达(log2TPM)。(A)中显示的数据代表了至少三个独立实验。TPM:每千基百万的成绩单。
图2。
图2。
CDK12通过MYC和mTOR-4EBP1-MCL-1轴在套细胞淋巴瘤和MYC相关B细胞淋巴瘤中的转录激活维持细胞生长和生存。(A) Western blot分析THZ531敏感细胞系和在不同时间点用指示剂量的THZ53l治疗的套细胞淋巴瘤原始样本中Ser2、5和7、RNAPII、裂解PARP、磷-p70S6K、p70S6K,磷-4EBP1、4EBP1,MCL-1、BCL-XL、BCL-2和MYC的RNAPII磷酸化。(B) Western blot分析HBL-2细胞中MCL-1、MYC、磷-4EBP1和4EBP1蛋白水平,含和不含强力霉素诱导的4EBP过度表达。(C) Western blot分析在HBL-2细胞中使用和不使用强力霉素诱导4EBP1过度表达的情况下,用指定剂量的THZ531处理24小时,对裂解的PARP、MCL-1、BCL-XL、BCL-2、MYC和4EBP1-蛋白表达进行分析。电池(1x106)接种在含有细胞外基质的384孔板中。将THZ531以五种系列稀释浓度添加到培养基中,每30分钟对板连续成像96小时。使用数字成像分析算法对所有图像进行分析,以基于膜运动检测细胞活力,通过曲线下的面积量化存活率的变化。(E) 用指定剂量的THZ531处理24小时的具有和不具有MCL-1过表达的HBL-2细胞中裂解的PARP、MYC、MCL-1和BCL-XL的蛋白质印迹分析。DOX:多西环素;DMSO:二甲基亚砜。
图3。
图3。
THZ531敏感细胞的转录组分析。(A) 用THZ531处理6小时(左)和24小时(右)后Z138和Jeko-1细胞中常见的转录组变化。红色:上调基因,黑色:下调基因。LFC:日志2原木折变截止线2(1.5),P(P)-值截断为0.05。三个生物独立样本。(B) 根据基因集富集分析(GSEA),标记通路的点图在24小时后用THZ531处理的Z138和Jeko-1细胞系中均呈负富集。较大的点大小表示更负的富集分数。色阶代表重要性。基因根据治疗后的表达倍数变化进行排序。NES:归一化富集分数;FDR:错误发现率。(C) THZ531处理后,KEGG途径的GSEA富集曲线在Z138和Jeko-1中均呈负富集。(D) 药物敏感性显示为根据Z138、Jeko-1、DOHH2和Val细胞系中细胞活力测定获得的剂量-反应曲线计算的曲线下面积的热图(AUC),用于给药72小时(E)药物敏感性显示为AUC的热图,该热图是根据基于图像的细胞活性分析获得的剂量-反应曲线计算得出的,该分析是在治疗72小时后,对每个指示药物的MCL-1过度表达和不过度表达的HBL-2细胞进行的。(F) 用500 nM THZ531治疗12小时的套细胞淋巴瘤原发患者样本中显著负富集GSEA标志基因集(NES<0,FDR<0.25)的文氏图列出了所有四个样本中共同负富集的途径。(D和E)中显示的数据代表了至少三个独立实验。
图4。
图4。
MDR1上调导致套细胞淋巴瘤和其他侵袭性B细胞淋巴瘤对THZ531产生耐药性。(A) 用THZ531治疗72小时后Z138、Jeko-1和REC-1细胞系的剂量-反应曲线。数据显示为每个细胞系三个技术复制的平均值±标准偏差(SD)。(B) Western blot分析在不同时间点用指示剂量的THZ531处理的REC-1细胞中Ser2、5和7、RNAPII、裂解PARP、p70S6K、p70S6K、4EBP1、MCL-1、BCLXL、BCL-2和MYC蛋白表达的RNAPII磷酸化。(C) 火山图显示,与二甲基亚砜(DMSO)处理REC-1细胞相比,THZ531处理24小时后,其mRNA水平没有变化。红色:上调基因,黑色:下调基因。LFC:日志2原木褶皱变化截止2(1.5),P(P)-值截断为0.05。三个生物独立样本。(D) THZ531耐药细胞株REC-1中药物泵基因差异表达条形图THZ531敏感细胞株Z138和Jeko-1。条形长度表示对数2折叠变化。颜色代表表达变化的方向,其中红色代表带有对数的基因2折叠变化大于1.5,蓝色代表log基因2折叠变化小于1.5。(E) 不同剂量的THZ531、塔里基达或THZ531+塔里基达尔治疗72小时后REC-1细胞的剂量反应曲线。数据显示为每个细胞系三个技术复制的平均值±SD。(F) 不同剂量的THZ531、塔里基达或THZ531+塔里基达尔治疗72小时后KARPAS-422-THZ-R和Maver-1-THZ-R细胞系的剂量-反应曲线。数据显示为每个细胞系的三个技术重复的平均值±标准差。(A、E和F)中显示的数据代表了至少三个独立实验。
图5。
图5。
EZH2抑制剂通过与THZ531竞争MDR1,在THZ531-耐药细胞中恢复了对THZ531.的敏感性。(A) ●●●●。在REC-1细胞中对每种指示药物单独或与500 nM THZ531联合进行高通量小分子药物筛选,得到药物反应曲线曲线下归一化区域(AUC)的Z分数。与THZ531结合后具有更有效作用的选定化合物以红色突出显示。(B)左图:REC-1细胞在不同剂量THZ53l、GSK343或THZ531+GSK342治疗72小时后的剂量-反应曲线。右:不同剂量的THZ531、UNC1999或THZ531+UNC1999治疗72小时后REC-1细胞的剂量-反应曲线。数据显示为每个细胞系三个技术复制品的平均值±标准偏差。(C) 用二甲基亚砜(DMSO)或指定剂量的THZ531和/或GSK343处理24小时后,对REC-1细胞中Ser2、RNAPII、裂解PARP、磷-p70S6K、p70S6K,磷-4EBP1、4EBP1,MCL-1、BCL-XL、BCL-2和MYC蛋白表达的RNAPII磷酸化进行Western blot分析。(D) 在不同时间点用二甲基亚砜或指示剂量的THZ531和/或GSK343处理后,对REC-1(左)和Maver-1-THZ-R(右)细胞系中MDR1和裂解PARP蛋白表达进行Western blot分析。(E) 用不同的药物以指示的剂量处理REC-1(左)、KARPAS-422-THZ-R(中)和Maver-1-THZ_R(右)细胞12小时。使用荧光MDR分析试剂盒测定P-gp活性。P-gp抑制剂维拉帕米(30μM)作为阳性对照。结果表示为平均值±平均值标准误差。(B)中显示的数据代表了至少三个独立实验。
图6。
图6。
MEK-ERK和PI3K-AKT-mTOR通路的激活有助于THZ531耐药细胞中MDR1的上调。(A) 初级MCL样品、细胞(3x10)的基于图像的细胞活性分析6)细胞接种在含有细胞外基质和淋巴瘤基质细胞的384孔板中。将五种系列稀释浓度的THZ531和GSK343添加到培养基中,每隔30分钟对平板连续成像144小时。使用数字成像分析算法对所有图像进行分析,以基于膜运动检测细胞活力,并通过曲线下面积(AUC)量化活力的变化。(B) 用二甲基亚砜或指定剂量的THZ531和/或AZD8055、BEZ235或曲美替尼处理24小时或48小时后,对REC-1细胞中MDR1和裂解PARP蛋白表达进行Western blot。(C) 不同剂量的THZ531和/或AZD8055、BEZ235和曲美替尼处理REC-1细胞72 h后的剂量-反应曲线。数据显示为每个细胞系三个技术复制品的平均值±标准偏差。(C)中显示的数据代表了至少三个独立实验。

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