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.2021年1月30日;40(1):48.
doi:10.1186/s13046-021-01849-2。

环状RNA circZFR通过调节SSBP1/CDK2/cyclin E1复合物磷酸化Rb促进宫颈癌进展

附属公司

环状RNA circZFR通过调节SSBP1/CDK2/cyclin E1复合物磷酸化Rb促进宫颈癌进展

周明义等。 实验临床癌症研究杂志. .

摘要

背景:作为一种新型的非编码RNA,环状RNA(circRNAs)在包括癌症在内的各种疾病的发生和发展中起着至关重要的作用。然而,circRNAs在人类宫颈癌中的确切功能尚不清楚。

方法:我们鉴定了宫颈癌和配对相邻正常组织之间上调的circRNA的circRNA特征。使用两个不同的队列和GEO数据库,共鉴定出6个上调的circRNAs,其倍数变化>2,P<0.05。在这六个circRNA中,hsa_circ_0072088(circZFR)是宫颈癌中唯一显著过度表达的外显子circRNA。为了研究circZFR的生物学功能,进行了功能实验。采用CircRNA下拉、CircRNA免疫沉淀(circRIP)和Co-I免疫沉淀(Co-IP)分析来研究circZFR功能的分子机制。

结果:在功能上,circZFR敲除抑制增殖、侵袭和肿瘤生长。此外,circRNA下拉实验结合质谱揭示了circZFR与单链DNA结合蛋白1(SSBP1)的相互作用。在机械上,circZFR与SSBP1结合,从而促进CDK2/cyclin E1复合物的组装。CDK2/cyclin E1复合物的激活可诱导p-Rb磷酸化,从而释放活化的E2F1,导致细胞周期进展和细胞增殖。

结论:我们的发现首次证明了circZFR是一种新的癌细胞核糖核酸,可能是宫颈癌患者潜在的生物标记物和治疗靶点。

关键词:细胞周期调控;宫颈癌;环状RNA;RNA免疫沉淀;RNA结合蛋白。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者声明,他们没有相互竞争的利益。

数字

图1
图1
宫颈癌组织中CircZFR的上调。a。CircRNAs表达谱分析。根据我们的LCHI队列和GEO数据库中的GSE102686数据,宫颈癌组织(T)与配对相邻非癌组织(N)中上调的circRNAs谱的热图。在这两个队列中,CircZFR(hsa_circ_0072088,hsa_carcRNA_103809)在宫颈癌中显著上调。LCHI:辽宁省肿瘤医院和研究所,FC:折叠变化b。维恩图。c。的基因组基因座ZFR公司使用不同的circZFR引物对PCR产物进行基因和Sanger测序,证实了头-尾剪接(外显子13和17)。d。qRT-PCR测定,宫颈癌(CC)中circZFR的水平显著高于邻近正常(AN)和正常宫颈(N)。e、。circZFR在大多数宫颈癌(CC)中的差异表达高于邻近正常组织(AN)(86.7%,26/30)。f、。qRT-PCR检测30例宫颈癌患者及癌旁正常人circZFR的丰度。g、。通过受试者操作特征(ROC)分析评价circZFR对宫颈癌的诊断价值***P(P)<0.001. AUC:曲线下面积,CI:置信区间
图2
图2
CircZFR促进宫颈癌细胞的增殖、迁移和侵袭。a。qRT-PCR分析稳定表达circZFR或control-circZFR(circ-Ctrl)的HeLa和SiHa细胞中circZFR-表达。b-c。通过稳定表达circZFR上调circZFR增加了HeLa和SiHa细胞的增殖能力,如通过CCK-8测定和EdU测定所测量的(比例尺=200微米)。d。集落形成实验表明,稳定的circZFR过表达增加了HeLa和SiHa细胞的克隆形成能力。例如。伤口愈合和跨孔基质凝胶迁移和侵袭试验表明,circZFR的稳定过度表达增强了HeLa和SiHa细胞的迁移和侵袭(比例尺e(电子)= 200μm,标尺英寸如果= 50微米)。小时。流式细胞术(FCM)检测到circZFR过度表达后,细胞周期G0-G1期细胞数量显著减少,S期细胞数量增加*P(P)<0.05, **P(P)<0.01***P(P)<0.001
图3
图3
下调circZFR抑制宫颈癌细胞的增殖、迁移和侵袭。a。使用靶向circZFR结合区(sh-circ)或对照shRNA(sh-Ctrl)的三种不同shRNA,对稳定的cirZFR敲除后HeLa细胞中circZFR-表达进行qRT-PCR分析。Sh2-circ(以下简称sh-circ)表现出最高的击倒效果。b。稳定表达sh-circ或sh-Ctrl的HeLa和SiHa细胞中的CircZFR表达水平。c-d。通过稳定表达sh-circZFR下调circZFR抑制HeLa和SiHa细胞的增殖能力,如CCK-8分析和EdU分析所测(比例尺=200微米)。e、。集落形成实验表明,稳定敲除circZFR可抑制HeLa和SiHa细胞的克隆形成能力。f-h。通过伤口愈合和跨阱基质凝胶迁移和侵袭试验(比例尺:如果= 200μm,标尺英寸小时= 50微米)。i、。稳定敲除circZFR后,用流式细胞仪分析细胞周期。CircZFR敲除G0-G1期阻滞细胞,减少S期*P(P)<0.05, **P(P)<0.01***P(P)<0.001, ****P(P)<0.0001
图4
图4
E2F1通路的CircZFR激活促进了宫颈癌的进展。a。热图显示基因发生改变(折叠变化>2,P(P)<根据TCGA和GTEx数据库,宫颈癌与正常组织的比较。红色表示较高,绿色表示较低。b。使用Cytoscape/BINGO软件进行基因富集。宫颈癌中共有14个上调基因在DNA复制、细胞周期进程和细胞增殖的生物过程中得到富集。c。qRT-PCR检测了稳定过度表达circZFR或circ-Ctrl的HeLa和SiHa细胞中14个候选基因的相对mRNA表达。mRNA表达CCNB1公司,CCNA2号机组,CDC25A型,CDC6型、和TFDP1型在circZFR过度表达后增加。d。E2F1、E2F4和EGR1被鉴定为CCNB1公司,CCNA2号机组,CDC25A型,CDC6型、和TFDP1型使用ChIPbase*P(P)<0.05, **P(P)<0.01***P(P)<0.001
图5
图5
CircZFR诱导Rb磷酸化和E2F1乙酰化。a-b类。在过度表达circZFR或circ-ZFR敲除(sh-circ)的HeLa和SiHa细胞以及相应的对照(分别为circ-Ctrl和sh-Ctrl)中检测到p-Rb S608和S807、ac-E2F1 K117和K125、E2F1、cyclin-E1/−D1和CDK4/2蛋白水平。这些蛋白质的相对强度通过ImageJ(右面板)进行量化。c。肿瘤(T)和配对正常组织(N)中检测到p-Rb S608和S807、ac-E2F1 K117和K125、cyclin-E1和CDK2。d。使用ImageJ软件检测30例宫颈癌患者配对点图中每个蛋白的相对强度。分析采用了双尾配对Student t检验。e、。circZFR的表达与细胞周期蛋白p-Rb和ac-E2F1的相关性。皮尔逊相关系数(r)和第页使用GraphPad Prism 7.0软件执行值*P(P)<0.05, **P(P)<0.01***P(P)<0.001, ****P(P)<0.0001
图6
图6
CircZFR促进CDK2/cyclin-E1和CDK2/SSBP1组装,并与SSBP1相互作用。.i的模型n vivo circRNA下拉使用MS2标记系统,并进行以下无标签质谱(MS)分析。b使用qRT-PCR分析确认circZFR的过度表达。c(c).circZFR-MS2的共转染GFP公司和MS2-CP-Flagm樱桃色诱导MS2 RNA发夹表达的质粒,其具有过度表达的circZFR和可识别MS2 RNA发夹的融合蛋白MS2-CP-Flag(比例尺=200微米)。绿色荧光标记的圆圈ZFR(上)和红色荧光标记的MS2-CP-Flag(下)。d日.Western Blot测试MS2-CP-Flag被反旗拉下(向上)。通过qRT-PCR检测circZFR在具有MS2 CP Flag的复合物中的富集(底部)。化验两次,一式三份。e(电子)使用无标签MS测试含有MS2-CP-Flag的蛋白质复合物。肽与SSBP1匹配。如果circRNA免疫沉淀(circRIP)分析,用于测量稳定过度表达的circZFR和circ-Ctrl的HeLa和SiHa细胞中SSBP1和IgG抗体所抑制的circZFR数量。化验两次,一式三份。从稳定过度表达circZFR或circZFR-敲除(sh-circ)的HeLa细胞制备的裂解物和相应的对照物(分别为circ-Ctrl和sh-Ctrl)使用抗CDK2进行免疫沉淀**P(P)<0.001, ****P(P)<0.0001,MS2-CP:MS2噬菌体外壳蛋白,MS:质谱,GFP:绿色荧光蛋白,circRIP:circRNA免疫沉淀
图7
图7
CircZFR促进宫颈癌细胞在体内的生长。a。裸鼠皮下注射2×107稳定过表达的circZFR和相应的对照HeLa细胞(n个每组10个),21天后取出肿瘤天。b。图a中的肿瘤体积每3个测量一次天。c。测量图a中肿瘤的重量。d。裸鼠皮下注射2×107稳定敲除circZFR和相应的对照HeLa细胞(每组10个),21天后取出肿瘤天。e、。图d中的肿瘤体积每3次测量一次天。f、。测量图d中肿瘤的重量。g、。circZFR-介导的p-Rb磷酸化促进宫颈癌G1/S转变和细胞增殖的模型****P(P)<0.0001

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