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.2020年5月26日;11(5):400.
doi:10.1038/s41419-020-2611-0。

依赖HUWE1的DNA-PKcs neddylation在DNA损伤反应中调节其自身磷酸化

附属公司

依赖HUWE1的DNA-PKcs neddylation在DNA损伤反应中调节其自身磷酸化

郭宗培等。 细胞死亡病. .

摘要

DNA-依赖性蛋白激酶催化亚基(DNA-PKcs)是DNA-PK复合物在DNA双链断裂的非同源末端连接(NHEJ)修复中的核心成分,其活性严格受DNA-PKc磷酸化控制。泛素样蛋白NEDD8参与DNA损伤反应的调控,但NEDD8相关的neddylation是否以及如何影响DNA-PKcs和NHEJ过程仍然是个谜。在这里,我们发现DNA-PKcs在其激酶结构域是多烯二基化的。neddylation E2-结合酶UBE2M和E3连接酶HUWE1(HECT、UBA和WWE域包含E3泛素蛋白连接酶1)负责DNA-PKcs的neddylization。此外,抑制HUWE1依赖的DNA-PKcs neddylation会损害Ser2056处的DNA-PKcs自动磷酸化。最后,HUWE1依赖性DNA PKcs nedylation的缺失降低了NHEJ的效率。这些研究揭示了奈德基化如何调节NHEJ核心复合物的活性。

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数字

图1
图1。DNA-PKcs通过neddylation修饰。
DNA损伤后,DNA-PKcs被neddylated化。将SFB-NEDD8 WT或SFB-NEDD8ΔG转染到HEK293T细胞中,24转染后h,将细胞暴露于10Gy电离辐射。IR处理4小时后,收集细胞并进行链霉亲和素下拉和蛋白印迹。用指示的抗体培养斑点。b条MLN4924处理消除了DNA-PKcs的neddylation。SFB-NEDD8-转染的HEK293T细胞用3μMLN4924用于1h、 用10Gy IR并采集用于链霉亲和素下拉和western blot。c(c)DNA-PKcs脱醛需要NEDP1。HEK293T细胞要么单独转染SFB-NEDD8,要么与NEDP1联合转染。收集细胞进行链霉亲和素下拉和western blot 410后hGy IR处理。IP-western blot检测DNA-PKcs的neddylation。d日,e(电子)内源性DNA-PKcs被neddylated。分别用特异性抗体免疫沉淀内源性DNA-PKcs或内源性NEDD8,并用NEDD8抗体或DNA-PKcs抗体检测免疫沉淀蛋白。(f)MLN4924处理抑制了内源性DNA-PKcs的neddylation。Hela细胞用3μMLN4924用于1h并经受10次Gy IR处理。6小时后,收集细胞并进行IP western印迹。
图2
图2。DNA PKcs激酶结构域和赖氨酸4007位点通过nedylation修饰。
含激酶结构域的DNA-PKcs截短突变体H通过neddylation修饰。左面板显示了不同DNA-PKcs截断突变体的示意图。右图,用不同的突变体共转染HEK293T细胞,并在用NEDD8抗体检测后用Flag抗体免疫沉淀收获的细胞裂解物。b条MLN4924消除了DNA-PKcs截断突变体H的neddylation,而MG132增加了DNA-PK H neddylization。DNA-PKcs突变体H与HA-NEDD8共转染,转染细胞用MLN4924或MG132处理。治疗后,收集细胞并用所示抗体进行Flag IP和western印迹。c(c)DNA-PKcs激酶结构域被neddylated。将仅含有激酶结构域或FATC结构域的不同DNA-PKcs截短突变体与HA-NEDD8 WT或HA-NEDD 8ΔG质粒共转染。转染后10经Gy-IR处理后,收集细胞并用所示抗体进行Flag IP和western印迹。d日NEDD8 K60介导DNA-PKcs的多糖基化。转染后,NEDD8 WT、K60R、K48R或NOK质粒与DNA PKcs H突变体共转染,10经Gy-IR处理后,收集细胞并用所示抗体进行Flag IP和western印迹。e(电子)K4007是DNA-PKcs的主要neddylation位点。DNA-PKcs激酶域中的不同K-R突变体与His-NEDD8共转染。转染后10经Gy-IR处理后,收集细胞并用所示抗体进行Flag IP和western印迹。
图3
图3。HUWE1是DNA-PKcs neddylation E3。
,b条HUWE1与DNA-PK复合物和UBE2M相互作用。用DNA-PKcs抗体或Flag-HUWE1进行免疫沉淀,无论是HUWE 1还是DNA-PKc,Ku70/Ku80,用所示抗体进行免疫印迹检测UBE2M。c(c)HUWE1缺失消除了DNA-PKcs neddylation。HUWE1被特异性siRNA耗尽。收集耗尽的细胞,在用NEDD8抗体检测后用DNA-PKcs抗体进行IP。
图4
图4。DNA-PKcs neddylation促进DNA-PKcsSer2056磷酸化。
HUWE1缺失降低了DNA-PKcs Ser2056磷酸化。用VP-16处理HUWE1 shRNA-缺失细胞并在指定的时间点采集,然后用western blotting检测DNA-PKcs Ser2056磷酸化或ATM Ser1981磷酸化。b条UBA3敲除消除了DNA-PKcs Ser2056磷酸化。用VP-16处理UBA3 siRNA-缺失的HeLa细胞并在指定的时间点收获,然后用western blotting检测DNA-PKcs Ser2056磷酸化。c(c),d日MLN4924处理降低了VP-16或IR处理后DNA-PKcs Ser2056的磷酸化。HeLa细胞用3μMLN4924用于1h后进行VP-16处理或不同剂量的IR处理,然后收集细胞,然后用DNA-PKcs Ser2056抗体或指示抗体进行免疫印迹。
图5
图5。DNA-PKcs neddylation调节NHEJ修复。
HUWE1缺失细胞中γH2AX病灶增加。shHUWE1和对照细胞用10Gy IR,IR后不同时间点用γH2AX抗体染色。b条HUWE1依赖的DNA-PKcs奈德化的耗竭导致细胞阻滞在G1期。c(c)HUWE1依赖的DNA-PKcs奈德化耗竭抑制NHEJ修复。与对照组相比,两种HUWE1 siRNA均显示出统计学意义(第页 < 0.05). 53BP1敲除作为阳性对照。d日HUWE1依赖性DNA PKcs nedylation如何影响NHEJ修复的示意图。

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