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.2019年3月;127(3):366-371.
doi:10.1016/j.jbiosc.2018.08.006。 Epub 2018年9月18日。

利用主成分分析寻找胆汁酸高结合肽抑制肠道胆固醇吸收

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利用主成分分析寻找胆汁酸高结合肽抑制肠道胆固醇吸收

伊藤雅子等。 生物科技杂志. 2019年3月.

摘要

我们之前提出了一种利用点合成肽库和主成分分析(PCA)来探索功能肽的新方法。在这里,我们应用这些方法来确定是否可以在胆汁酸上使用高结合性6聚肽来抑制肠道胆固醇吸收。我们使用512个基础4-聚肽与胆汁酸的结合试验,并从这些选择的高结合和低结合肽中进行。对这些结合基团和512个被测肽的许多物理化学变量的数据进行主成分分析,然后通过此方法将变量简化为两个主成分(PC)。多肽绘制在PCA图上,我们确定了不同的高结合区和低结合区簇。将这些PCA区域应用于6聚体随机肽,我们鉴定出对胆汁酸具有高和低结合能力的6聚体肽。我们证实,高结合肽的平均荧光强度是低结合肽的3.0倍。基于对4肽的PCA分析,我们成功地鉴定了具有高和低结合亲和力的6肽。将这些结果与我们之前基于神经网络的计算分析所获得的结果进行了比较和讨论。

关键词:胆汁酸;胆固醇;肽;肽阵列;主成分分析。

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