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案例报告
.2018年11月;10(11):e9060。
doi:10.15252/emmm.201809060。

氧化锌突变导致线粒体脑病和氧化磷酸化缺陷

附属公司
案例报告

氧化锌突变导致线粒体脑病和氧化磷酸化缺陷

凯尔·汤普森等。 EMBO分子医学. 2018年11月.

摘要

OXA1是YidC/Alb3/OXA1膜蛋白插入酶家族的线粒体成员,是在酵母中组装氧化磷酸化复合物IV和V所必需的。然而,之前有报道称,人体OXA1(OXA1L)的缺失只会损害复合物I和V的组装。我们报告了一名患有严重脑病、张力减退和发育迟缓的患者,他在5岁时死亡,表现为骨骼肌复杂IV缺乏。全外显子组测序鉴定双等位基因氧化锌与疾病分离的变体(c.500_507dup,p.(Ser170Glnfs*18)和c.620G>T,p.,(Cys207Phe))。患者肌肉和成纤维细胞显示OXA1L和复合物IV和V的亚基减少。至关重要的是,野生型人的表达氧化锌患者体内的成纤维细胞挽救了复杂的IV和V缺陷。在人体细胞中靶向消耗OXA1L或黑腹果蝇导致复合物I、IV和V组装缺陷,与患者数据一致。OXA1L的免疫沉淀显示复合物I、IV和V的mtDNA编码亚单位富集。我们的数据验证了这些亚单位的致病性氧化锌并证明OXA1L是组装多个呼吸链复合物所必需的。

关键词:牛津大学;OXA1L;脑病;插入酶;线粒体。

PubMed免责声明

数字

图EV1
图EV1。患者神经成像
  1. A类

    矢状T1加权FSE显示胼胝体后部变薄,脾发育不全。也可以看到明显的皮下脂肪沉积。

  2. B类

    轴向T1 FSPGR显示由于脾发育不全,第三心室较大,心室心房平行。

  3. C类

    患者大脑的MRS显示出正常的光谱模式。

图1
图1。分子遗传学和生物化学研究OXA公司1升变体
  1. A类

    家族谱系详细描述了氧化锌变体,索引大小写用红色星号表示。

  2. B类

    苏木精和曙红染色(i)和改良Gomori三色染色(ii)显示了肌纤维大小的预期变异性,内部细胞核分离。没有再生纤维或坏死的证据,也没有典型的“碎裂-红色”变化的肌膜下线粒体聚集体。在NADH‐四氮唑还原酶(iii)和SDH(iv)反应中都证实了线粒体增殖的缺失。单个COX反应(v)揭示了整个肌肉冷冻切片中酶活性的均匀损失,在连续COX‐SDH反应(vi)中,COX缺乏的SDH阳性纤维均匀突出。所示比例尺为50μm。

  3. C类

    对照(红色)和患者(蓝色)骨骼肌样品中线粒体呼吸复合物的活性。对照肌肉的平均酶活性(n个=25)设置为100%,误差条表示标准偏差。星号表示超出控制范围的值。

  4. D、 E类

    证实性桑格测序显示单亲的每一个亲本都是杂合的氧化锌变体。星号表示标记变体的位置。

  5. F类

    通过RT–PCR对患者mRNA的分析表明,c.620G>T变体影响剪接,并可能导致外显子4(p.(Cys207_Glu2545del))或p.Cys207Phe氨基酸取代的跳过。

  6. G公司

    OXA1L人Cys207残基的进化保护(蓝盒)。

图EV2
图EV2。神经病理学:双侧脑桥空洞、纤细束脱髓鞘和复合物I亚单位下调NDUFS公司3和NDUFB公司8
  1. A类

    脑桥表现为双侧空化(i和ii),特别影响桥脚核,伴有微血管增生(iii)、反应性星形胶质细胞增生(iv)和小胶质细胞活化(v)。神经元和周围神经膜内NDUFS3(vi;箭头)表达下调(对照染色:vii),而SDHA(viii;对照显示在ix)、COXI(x;对照显示于xi)和ATP5B(xii;对照显示位于xiii)表达维持在正常水平。

  2. B类

    黑质神经元也显示NDUFS3(i;箭头,右侧显示对照)表达缺失,而SDHA(ii左侧面板;右侧显示对照组)、COXI(iii左侧面板;左侧显示控制组)和ATP5B(iv左侧面板;右图显示控制)表达水平与对照组相当。

  3. C类

    纤细束显示脱髓鞘(i和ii),而相邻的楔形束有髓(iii)。运动神经元的神经元密度保持不变,NDUFB8(iv)和NDUFS3表达(v)减少,SDHA(vi)、COXI(vii)和ATP5B(viii)表达完整。

数据信息:比例尺=100μm。
图EV3
图EV3。神经病理学:额叶萎缩、胼胝体发育不良和丘脑空洞。皮质区神经元的层流分布完整,线粒体牛津大学在整个额叶、顶叶和枕叶皮层都有表达
  1. A类

    宏观上,额叶皮质萎缩,胼胝体发育不良。

  2. B类

    胶质纤维酸性蛋白(PGFA)免疫组化染色显示丘脑微血管增生,小胶质细胞活化和反应性胶质增生。比例尺:顶部面板=500μm,左下=200μm,右下=100μm。

  3. C–F

    线粒体呼吸链蛋白在额叶(C)、顶叶(D)和枕叶(E)皮质内的患者神经元中的表达与对照神经元(F)的水平相当,并且NDUFS3(i)的表达只有轻微下调,而在患者组织中SDHA(ii)、COXI(iii)和ATP5B(iv)的表达很高。比例尺=100μm。

图2
图2。牛津大学患者组织中的复杂稳态水平和组装分析
  1. A类

    使用VDAC1和β-actin作为负载对照,对患者(P)和对照(C1,C2)成纤维细胞中的OXA1L和OXPHOS复合物亚基进行蛋白质印迹分析。

  2. B类

    患者和对照骨骼肌中OXA1L和OXPHOS复合物亚基的Western blot分析。复合物II亚基SDHA和SDHB用作负荷控制。

  3. C类

    利用Blue Native PAGE分析使用DDM作为洗涤剂溶解的患者成纤维细胞中的呼吸复合物组装。使用NDUFB8(CI)、SDHA(CII)、UQCRC2(CIII)、COXI(CIV)和ATP5A(CV)抗体。*表示部件复合体。

  4. D类

    Blue Native PAGE分析患者膈肌呼吸复合体的组装(P(P) 迪亚)和股四头肌(P(P) 方庭). 使用DDM溶解肌肉线粒体提取物,并使用抗NDUFB8(CI)、SDHA(CII)、UQCRC2(CIII)、COXI(CIV)和ATP5A(CV)的抗体来检测每种复合物。

  5. E类

    对照组成纤维细胞(C1、C2)、患者成纤维细胞氧化锌(P+OXA1L)。α-微管蛋白用作负荷对照。

  6. F类

    正常化为复合物II(CII)的线粒体呼吸复合物I(CI)、III(CIII)和IV(CIV氧化锌(灰色)。对照成纤维细胞的平均酶活性(n个=11)设置为100%,误差条表示标准偏差。

可在线获取此图的源数据。
图3
图3。分析OXA公司1L损耗D.褪黑激素分泌和带有si的人类细胞核糖核酸CRISPR公司/案例9
  1. A类

    CG6404型对照组(黑色和灰色)和OXA1L siRNA处理苍蝇(红色)的mRNA水平正常化为RpL32 mRNA,对照组1(黑色)设置为1。每组四个生物重复。采用Tukey多重比较测试的单向方差分析。误差条代表平均值的标准误差(SEM)。****表示P(P)< 0.0001.

  2. B类

    对照组(Ctrl 1,Ctrl 2)和CG6404型siRNA缺失(OXA1L-IR)苍蝇。每组三次生物复制。Tukey多重比较检验的单向方差分析。

  3. C类

    用NT‐siRNA或OXA1L SmartPool siRNA孵育6天后,对细胞裂解液(≈30μg)进行Western blot分析的代表性数字。评估OXA1L和mt‐LSU(MRPL45,MRPL11)和mt­SSU(MRPS26,MRPS22)组分的稳态水平,以及mtDNA编码蛋白COXII的稳态水平。SDHA和TOM20抗体用作负荷对照。

  4. D类

    对细胞裂解物(≈30μg)进行Western blot分析。用靶向OXA1L的抗体评估消耗效率。mt编码蛋白COXII以及有丝分裂核糖体蛋白MRPL45和MRPS26的稳态水平也进行了可视化。使用靶向β-actin的抗体控制负载的均匀性。这些数字代表了两种生物重复。虚线表示图中省略了一些车道。

  5. E类

    两个独立的细胞系(OXA1L-1和OXA1L-2)在不同浓度的强力霉素(DOX)中生长以调节OXA1L旗帜表达式。通过SDS-PAGE和OXA1L、FLAG表位和TOM20抗体免疫印迹(作为对照)分离线粒体,并与野生型HEK293T细胞(标记为C)的对照线粒体进行比较。

  6. F类

    从接受或不接受10 ng/ml DOX处理5天的细胞中分离出线粒体。在通过免疫印迹法对呼吸复合物I(NDUFA9)、复合物III(UQCRC1)、复合物质IV(COXIV)和复合物V(ATP5A)的超复合物形式进行BN‐PAGE分析之前,将样品溶解在洋地黄素中。

  7. G公司

    通过SDS-PAGE和免疫印迹分析核糖体亚基。印有考马斯亮蓝(CBB)的印迹用于装载控制。

可在线获取此图的源数据。
图EV4
图EV4。苍蝇匀浆的高分辨率呼吸测定CG公司6404只耗竭的苍蝇和对照
  1. A类

    以丙酮酸+脯氨酸为底物的CI+CIII+CIV呼吸。

  2. B类

    以sn‐甘油‐3‐磷酸盐为底物的呼吸(在鱼藤酮存在下)。

  3. C类

    以TMPD和抗坏血酸为底物的CIV呼吸(在鱼藤酮和抗霉素A存在下)。

数据信息:每组三到五次生物复制。采用Tukey多重比较测试的普通单向方差分析。误差条代表SEM**P(P)<0.01***P(P)< 0.001, ****P(P)< 0.0001.
图4
图4。确定的互动合作伙伴OXA公司1L和评估患者成纤维细胞的线粒体蛋白合成
  1. A类

    与OXA1L‐FLAG相互作用蛋白质的亲和纯化质谱分析。将表达OXA1L‐FLAG的对照(HEK293T)或OXA1L‐1细胞溶解在1%(w/v)的洋地黄素中,并与抗FLAG亲和凝胶一起孵育(n个 = 3). 通过无标记定量质谱(LFQ)分析洗脱液。日志2将LFQ强度提交给修改后的双面样品t吨通过材料和方法中描述的基于排列的错误发现率(FDR)统计确定显著性的测试。丰富的呼吸复合物亚单位是彩色编码的,mtDNA编码的亚单位是标记的。数据集EV1中提供了完整数据。

  2. B类

    对对照组(C)和OXA1L患者永生化成纤维细胞(P)进行Western blot分析。OXA1L的稳态水平被评估为OXPHOS系统成分(NDUFB8、COXII和ATP5β)的稳态水平。在单独的蛋白质印迹上,检测有丝分裂核糖体蛋白MRPL3、MRPL45、MRPL11和MRPS26的水平。对于这两种膜,β-actin被用作负荷控制。虚线表示图中省略了一些车道。

  3. C类

    对照组(C1)和患者(P)成纤维细胞用盐酸依米汀处理,以抑制细胞溶质翻译和线粒体蛋白合成,通过[35S] Met/Cys合并1小时脉冲和4或8小时追踪。通过15%聚丙烯酰胺凝胶分离细胞裂解液(50μg)。凝胶用考马斯蓝(CBB)染色,以确认载荷相等。固定和干燥后,使用台风FLA9500荧光成像仪对信号进行可视化。信号是根据既定的迁移模式得出的(Chomyn,1996)。

可在线获取此图的源数据。
图EV5
图EV5。GTE公司x门户表达式配置文件OXA公司1L等容线
使用基因型组织表达项目(GTEx)分析版本V7生成的所有箱线图,通过GTEx门户提供的单个组织eQTL数据集(https://www.gtexport.org/home/).
  1. A类

    OXA1L‐213(OXA1L的主要蛋白质编码亚型)在整个可用组织面板中的百万分之转录物(TPM)表达水平箱线图。方框图显示为中值和25第个和75第个百分位数;如果点高于或低于四分位范围的1.5倍,则显示为异常值。

  2. B–K

    在减少的组织中,亚型OXA1L‐201至212在TPM中的表达水平。缩小的组织面板包括动脉主动脉、冠状动脉、大脑杏仁核、大脑皮层、大脑脊髓、细胞转化的成纤维细胞、心耳、心脏左心室和肌肉骨骼。

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