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.2017年10月9日;10(10):1274-1292.
doi:10.1016/j.molp.2017.09.007。 Epub 2017年9月23日。

H2A。Z通过调控拟南芥启动子核小体结构和增强组蛋白修饰抑制基因表达

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H2A。Z通过调控拟南芥启动子核小体结构和增强组蛋白修饰抑制基因表达

小转戴等。 摩尔工厂. .
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摘要

组蛋白变体H2A的沉积。Z at基因体通过改变植物染色质的可及性来调节转录。然而,H2A的作用。Z在启动子和增强子区域的富集以及H2A如何富集尚不清楚。Z与染色质修饰的其他机制相互作用以调节基因表达仍不清楚。在这里,我们绘制了全基因组H2A。Z、 拟南芥花序中的H3K4me3、H3K27me3、Pol II和核小体占有率。我们展示了H2A。Z在启动子处优先与H3K4me3相关,而在增强子处与H3K27me3和H2A相关。Z沉积与基因表达呈负相关。此外,我们证明了H2A。Z通过在+1核小体上建立低基因可及性和在-1核小体保持高基因可获性来抑制基因表达。我们进一步表明,高水平的基因反应性与H2A相关。Z相关的闭合+1核小体结构。此外,我们发现H2A。Z通过促进H3K27me3和阻止H3K4me3组蛋白修饰来抑制增强子活性。本研究为H2A的未来研究提供了一个框架。Z起作用,为解码染色质修饰和组蛋白变体在转录控制中的相互作用开辟了新的领域。

关键词:ChIP-seq;H2A。Z;RNA-seq;基因表达;组蛋白修饰;核小体占有率。

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