Comparative Proteomic Profiling Using Two-Dimensional Gel Electrophoresis and Identification via LC-MS/MS Reveals Novel Protein Biomarkers to Identify Aggressive Subtypes of WHO Grade I Meningioma

doi:10.1055/s-0037-1601889

.2017年10月；78(5):371-379.

doi:10.1055/s-0037-1601889。 Epub 2017年4月26日。

使用二维凝胶电泳和LC-MS/MS鉴定的比较蛋白质组学图谱揭示了新的蛋白质生物标记物来鉴定WHO I级脑膜瘤的侵袭性亚型

附属公司

¹美国华盛顿州西雅图华盛顿大学神经外科。
²美国华盛顿州西雅图华盛顿大学神经病理学系。
^三美国加州斯坦福大学神经病理学系。

PMID： 28875114
预防性维修识别码： PMC5582960
内政部： 10.1055/s-0037-1601889

双向凝胶电泳比较蛋白质组分析和LC-MS/MS鉴定揭示新的蛋白质生物标记物用于鉴定WHO I级脑膜瘤侵袭性亚型

约书亚·W·奥斯本等。神经外科杂志B颅底. 2017年10月.

.2017年10月；78(5):371-379.

doi:10.1055/s-0037-1601889。 Epub 2017年4月26日。

附属公司

¹美国华盛顿州西雅图华盛顿大学神经外科。
²美国华盛顿州西雅图华盛顿大学神经病理学系。
^三美国加州斯坦福大学神经病理学系。

PMID： 28875114
预防性维修识别码： PMC5582960
内政部： 10.1055/s-0037-1601889

摘要

背景脑膜瘤是最常见的原发性颅内肿瘤。大多数是良性的世界卫生组织（WHO）I级病变，但其中一部分表现为侵袭性。需要蛋白质生物标记物来区分侵袭性和良性I级病变。材料和方法汇集的蛋白裂解物来自五个临床侵袭性I级和五个典型的WHO I级良性肿瘤，它们在手术时被快速冷冻。使用双向凝胶电泳（2DGE）分离各组蛋白质，并使用液相色谱-质谱（LC-MS）鉴定感兴趣的蛋白质斑点。在单个肿瘤样本中使用western blot分析和组织芯片（TMA）验证潜在的生物标记物候选物。结果从2DGE中获得7个候选生物标记物，并通过western blot和TMA进行验证。生物标记物验证数据允许使用二元逻辑回归创建预测模型，该模型正确识别了较大的I级脑膜瘤队列中85.9%的侵袭性肿瘤。结论通过2DGE简单的蛋白质分离和LC-MS鉴定候选生物标记物，可以鉴定7个候选生物标记，当用于预测模型时，可以准确区分WHO I级脑膜瘤的侵袭性行为和良性行为。

关键词：生物标志物发现；质谱；脑膜瘤；蛋白质组；双向凝胶电泳。

PubMed免责声明

利益冲突声明

利益冲突没有作者有任何利益冲突需要披露。

数字

图1
侵袭性和良性WHO I级脑膜瘤的2D凝胶蛋白质组特征。(A类)侵袭性I级和良性I级脑膜瘤的整个蛋白质组分离的图像。(B)侵袭性I级肿瘤和良性I级肿瘤的斑点密度差异。(C类)每个斑点中发现的蛋白质列表，通过质谱鉴定；二维、二维；世卫组织、世界卫生组织。

图2
通过2D凝胶分离鉴定的蛋白质的Western blot验证。具有显著差异的蛋白质的蛋白质印迹显示为具有相应的β-肌动蛋白。所有其他蛋白质都以图形方式显示。(A类)对比较良性I级和侵袭性I级脑膜瘤的单个脑膜瘤中的六种确定的生物标记物进行验证(B)验证所有级别的单个肿瘤中的六种已识别生物标记物。二维、二维。

图3
识别组织微阵列中的蛋白质表达模式，以揭示识别复发性和侵袭性脑膜瘤的特征。(A类)每个蛋白质相对于等级的图形表示。这种方法没有发现年级之间的显著差异。(B)与复发相关的每个蛋白质的图形表示。这种方法显示复发性疾病和非复发性疾病之间没有显著差异。(C类)通过聚类算法识别蛋白质谱。该方法揭示了能够区分复发性和非复发性脑膜瘤的蛋白质之间的几种关系。

图4
组织微阵列分析的代表性染色。六种候选生物标记物的免疫组织化学染色示例显示在不同WHO分级的脑膜瘤中。世卫组织、世界卫生组织。

图5
通过对蛋白质相互作用的文献综述，描述了与每个候选生物标记物相关的潜在统一致癌机制的示意图。

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