摘要
在许多癌症中,细胞经历新陈代谢、细胞生存和抗凋亡防御策略的重新编程,介导这种重新编程的蛋白质代表潜在的生物标记物。在这里,我们通过使用特异性抗体比较慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者和健康献血者外周血单个核细胞的蛋白表达谱,寻找在慢性淋巴细胞白血病中影响诊断、治疗和预后的新生物标记蛋白,质谱和二元logistic回归分析以及其他生物信息学工具。质谱(LC-HR-MS/MS)分析确定了1360个蛋白,其在CLL衍生淋巴细胞中的表达水平发生了改变。其中一些蛋白以前与包括CLL在内的不同癌症类型相关,而另外四种高表达蛋白以前没有报道与癌症相关,这里,DDX46和AK3首次与CLL相关。其中两种蛋白的下调表达导致细胞生长抑制。DDX46高表达水平与CLL患者生存期缩短相关,因此可以作为预后标志物。修饰表达的蛋白质包括参与RNA剪接和翻译的蛋白质,特别是参与凋亡和代谢的线粒体蛋白质。因此,我们重点研究了几种代谢和凋亡调节蛋白,尤其是电压依赖性阴离子通道1(VDAC1),它们同时调节代谢和凋亡。CLL衍生淋巴细胞中Bcl-2、VDAC1、MAVS、AIF和SMAC/Diablo的表达水平显著增加。VDAC1水平与CLL癌CD19+/CD5+细胞的数量以及所测试的所有其他凋亡调节蛋白的水平高度相关。二元logistic回归分析证明了预测疾病概率的能力,准确率超过90%。最后,根据LC-HR-MS/MS显示的CLL患者中几种蛋白质水平的变化,我们可以区分处于稳定疾病状态的患者和那些后来转移到抗癌治疗的患者。因此,过度表达的蛋白可以作为潜在的生物标志物,用于早期诊断、预后、CLL治疗的新靶点和CLL的治疗指导,为个性化治疗奠定基础。
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赠款和资金
这项工作得到了白血病与淋巴瘤协会(LLS TRP grant#6336-11)的资助。