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.2015年6月12日;7(6):3035-52.
doi:10.3390/v7062759。

分枝杆菌IFITMs在人细胞中表达后对流感病毒产生耐药性

附属公司

分枝杆菌IFITMs在人细胞中表达后对流感病毒产生耐药性

威廉·J·梅尔文等。 病毒. .

摘要

脊椎动物中发现的干扰素诱导的跨膜蛋白(IFITM)可限制特定病毒的感染。已知IFITM3对限制小鼠和人类的流感病毒感染至关重要。脊椎动物IFITM被假设是从细菌到原始单细胞真核生物的水平基因转移中获得的。由于细菌IFITM与人类IFITM3具有最小的氨基酸同一性,我们假设对人类细胞中细菌IFITM的检查将深入了解IFITM抗病毒活性所需的基本特征。我们检测了来自禽分枝杆菌和脓肿分枝杆菌的IFITM的潜在抗病毒活性。这两种IFITM在人类细胞中均对流感病毒具有中等程度的耐药性,并将其鉴定为IFITM3的功能同源物。对细菌IFITMs和IFITM3共享的序列元素进行分析,确定了两个疏水结构域,即假定的S-棕榈酰化位点和与IFITM3相互作用相关的保守苯丙氨酸残基,这些都是IFITM3-抗病毒活性所必需的。我们观察到,与IFITM3一样,细菌IFITM也是S-棕榈糖基化的,尽管程度较低。我们还证明了细菌IFITM与IFITM3共免疫沉淀的能力,这表明形成了复合物,并且还观察到细菌IFITMs与IFITM2的强共定位。然而,分枝杆菌IFITM缺乏脊椎动物IFITM3中保守的内分泌靶向基序。因此,当这些细菌蛋白单独表达时,与组织蛋白酶B阳性内溶酶体隔室(IFITM3依赖型流感病毒限制的主要位点)的共定位作用减弱。尽管脊椎动物IFITM的确切进化起源尚不清楚,我们的结果支持了一个模型,即将细菌IFITM基因转移到真核细胞可能提供了对抗病毒感染的选择性优势,这一优势在脊椎动物进化过程中得到了完善,包括S-棕榈糖基化和定位到内吞病毒贩运部位的更强大信号。

关键词:IFITM3;流感病毒;干扰素诱导的跨膜蛋白;棕榈酰化;病毒限制。

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数字

图1
图1
分枝杆菌IFITM与脊椎动物IFITM不同,但具有某些共享氨基酸序列元素。(A类)利用Clustal Omega比对生成的分枝杆菌IFITM的系统发育树。显示了每个IFITM的分枝杆菌种类和相应的UniProt登录号。MAB的IFITM(脓肿分枝杆菌)和MAV(鸟型结核杆菌)选择用于进一步调查的内容用蓝色文本和星号表示;(B类)人(h)IFITM3、鼠(m)IFITM2、hIFITM1、MAB IFITM和MAV IFITM的校准。疏水结构域(HD)1用红色条高亮显示,HD2用绿色条高亮显示。hIFITM3和mIFITM3的YxxΦ基序呈紫色阴影。已知S公司-hIFITM3、mIFITM2和hIFITM1中的棕榈酰化半胱氨酸,以及潜在的S公司-MAB和MAV IFITM中的棕榈酰化半胱氨酸呈红色阴影。已知参与IFITM3二聚化的苯丙氨酸,以及MAB和MAV IFITMs中的同源苯丙氨酸呈蓝色阴影。hIFITM1的双碱基KRGY内吞基序为橙色阴影;(C类)通过比较分枝杆菌IFITM与hIFITM3或()hIFITM1。对于(C类)和(),还显示了mIFITM3的氨基酸百分比恒等式,以进行比较。
图2
图2
人IFITM3的N-末端HA标记不影响其抗流感病毒活性。(A类)用空载体或表达人HA-IFITM3或未标记人IFITM3的载体转染HEK293T细胞。以IFITM3抗体和GAPDH抗体作为负荷对照,通过Western blotting检测细胞裂解物;(B类)在中处理的单元格(A类)用抗IFITM3抗体通过流式细胞术染色进行检测。细胞在IFITM3阳性细胞上选通,蓝色数字表示三份样品的平均+/-标准偏差。Ssc,侧面散射;(C类)在中处理的单元格(A类)和(B类)以1.0的MOI感染IAV H1N1株PR8或模拟感染6 h。与模拟感染对照组相比,通过基于抗IAV核蛋白染色的流式细胞术分析细胞感染率。绘制了代表性实验中三份样品的平均感染率。误差线表示标准偏差。结果代表了5个以上的类似实验。NS,对学生来说不重要t吨测试。
图3
图3
来自分枝杆菌的IFITM在人体细胞中表达时可抑制流感病毒感染。(A类)用等量的空载体或表达人HA-IFITM3、HA-MAB IFITM3或HA-MAV IFITM2的载体转染HEK293T细胞过夜。以抗HA抗体染色和抗GAPDH染色作为负荷对照,通过Western blotting分析裂解产物;(B类)用等量的空载体、人HA-IFITM3、鼠HA-IRGM1或HA-MAV IFITM或一半浓度的HA-MAB IFITM转染HEK293T细胞过夜。以抗HA抗体染色和抗GAPDH染色作为负荷对照,通过Western blotting分析细胞裂解产物;(C类,)细胞转染为B类感染IAV H1N1毒株PR8的MOI为2.5,或感染IAV H3N2毒株X31或SeV的MOI是5.0。然后收集细胞并用抗HA和抗IAV核蛋白抗体或抗SeV抗血清进行染色。与未感染对照组相比,通过基于抗IAV核蛋白或抗SeV抗体染色的流式细胞术分析细胞感染率。载体控制细胞的平均感染率设置为每次感染1。至少有三个独立的实验,每个实验都有三次重复的测量,被平均并绘制图表。误差条表示平均值的标准误差。* 第页与Student’s的病媒控制相比<0.01t吨测试。
图4
图4
分枝杆菌IFITM适度S公司-当在人类细胞中表达时,棕榈糖基化。(A类C类)用指示的小鼠HA-IFITM3构建物或HA-标记的分枝杆菌IFITM表达构建物或空载体对照物转染HEK293T细胞过夜。(A类,B类)用50μM alk-16或DMSO标记细胞1 h作为对照,细胞裂解物在与叠氮罗丹明(az-rho)反应之前,用抗-HA亲和凝胶进行免疫沉淀,然后通过点击化学进行荧光凝胶扫描,以可视化蛋白质棕榈酰化水平。用抗HA抗体进行蛋白质印迹,以比较蛋白质负荷。数据代表了四个实验。*表示用于免疫沉淀的抗体轻链,由于其丰度高而显示出自体荧光;(C类)用IAV株PR8感染细胞6 h,MOI为2.5,并通过基于抗IAV核蛋白染色的流式细胞术分析感染率,与未感染的对照组进行比较。绘制了三个独立实验的代表性三份样品的平均感染率。误差条表示平均值的标准误差。* 第页<0.01(按学生)t吨用水平线表示的样品对比试验。NS,对学生来说不重要t吨测试。
图5
图5
MAV IFITM与IFITM3共免疫沉淀和共定位。(A类,B类)用表达HA标记的分枝杆菌IFITM和人myc-IFITM3的指定构建物转染HEK293T细胞。(A类)在用抗HA或抗myc抗体进行SDS-PAGE和Western blot分析之前,对细胞进行裂解,并用抗HA和抗myc亲和凝胶对部分细胞裂解物进行免疫沉淀。细胞裂解物的Western blotting证实HA-MAV IFITM的输入量相等,并且存在myc-IFITM3;(B类)带有myc-IFITM3的分枝杆菌IFITM的共焦显微镜成像显示它们在细胞中共同定位。抗-HA染色可显示分枝杆菌IFITM,而抗myc染色可显示IFITM3。DAPI染色观察细胞核。合并后的图像显示为黄色区域,表示分枝杆菌IFITM和IFITM3之间存在重叠。
图6
图6
分枝杆菌IFITM定位于溶酶体的效率低于IFITM3。(A类,B类)用编码人HA-IFITM3、HA-MAB IFITM或HA-MAV IFITM的表达质粒以及表达mEmeral-Cathepsin B的质粒转染生长在玻璃盖玻片上的HEK293T细胞(A类)抗-HA染色的共焦显微镜成像提供了IFITM的可视化,mEmerald成像提供了组织蛋白酶阳性溶酶体室的可视化。DAPI染色观察细胞核。合并后的图像显示为黄色区域,表示IFITM和组织蛋白酶B之间存在重叠;(B类)对至少20个单个细胞的每种IFITM与组织蛋白酶B的Manders重叠系数进行量化,如图所示(A类)来自两个独立的实验。平均值用图表表示,误差条代表平均值的标准误差。* 第页<0.0001(学生)t吨与HA-IFITM3进行比较。

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工具书类

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