摘要
NCBI的CDD,即保守域数据库,作为一种公共资源进入其第15(th)年,用于注释具有保守域足迹位置的蛋白质。展望未来,我们努力提高CDD提供的领域注释的覆盖率和一致性。我们维护一个实时搜索系统以及NCBI的Entrez蛋白质数据库中跟踪的序列的预计算域注释存档,可以检索单个序列或批量序列。我们还维护导入程序,以便CDD包含公共领域中可用的多个集合提供的域模型和域定义,以及由内部管理工作生成的那些集合。策展工作旨在增加覆盖面并提供常见蛋白质结构域的细粒度分类,为此提供了丰富的功能和结构数据。CDD管理生成代表性序列片段的对齐模型,该模型与蛋白质3D结构中观察到的域边界一致,并对结构域家族的结构保守核心进行建模,并注释保守特征。客户尽职调查可在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml。
牛津大学出版社代表核酸研究2014出版。这部作品由美国政府雇员撰写,在美国属于公共领域。
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