Recurrent LRP1-SNRNP25 and KCNMB4-CCND3 fusion genes promote tumor cell motility in human osteosarcoma

doi:10.1186/s13045-014-0076-2

.2014年10月10日10:7:76。

doi:10.1186/s13045-014-0076-2。

复发LRP1-SNRNP25和KCNMB4-CCND3融合基因促进人骨肉瘤肿瘤细胞运动

杨吉龙^1 2, 马蒂·阿纳拉^三 4, 平记⁵, 王国文^6 7, 洪正（音）^8 9, 大卫·科德格尔¹⁰, 杜晓玲¹¹, 方志伟¹², 孙保村^13 14, 马蒂·尼克特¹⁵, 陈可欣^16 17, 张伟（音译）¹⁸

附属机构

¹天津医科大学肿瘤医院及研究所骨与软组织肿瘤科，天津，30060，中国。yangjilong@tjmuch.com。
²国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。yangjilong@tjmuch.com。
^三芬兰坦佩雷科技大学信号处理系，坦佩雷，33101。matti.annala@tut.fi。
⁴芬兰坦佩雷大学生物医学技术研究所，坦佩雷，33520。matti.annala@tut.fi。
⁵德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心病理学系，德克萨斯州休斯顿，77030，美国。pji@mdanderson.org。
⁶天津医科大学肿瘤医院及研究所骨与软组织肿瘤科，天津，30060，中国。wgwhrb@163.com。
⁷国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。wgwhrb@163.com。
⁸天津医科大学肿瘤医院与研究所流行病学与生物统计系，天津，30060，中国。zhengh64@aliyun.com。
⁹国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。zhengh64@aliyun.com。
¹⁰德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心病理学系，德克萨斯州休斯顿，77030，美国。dcogdell@mdanderson.org。
¹¹天津医科大学诊断学系，中国天津，30060。xiaolingdu2003@163.com。
¹²北京大学肿瘤医院骨与软组织肿瘤科，北京，100020，中国。fzhiwei66@163.com。
¹³天津医科大学肿瘤医院病理科，天津，30060，中国。sunbaocun@tjmuch.com。
¹⁴国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。sunbaocun@tjmuch.com。
¹⁵芬兰坦佩雷科技大学信号处理系，坦佩雷，33101。matti.nykter@tut.fi。
¹⁶天津医科大学肿瘤医院与研究所流行病学与生物统计系，天津，30060，中国。chenkexin1963@yahoo.com。
¹⁷国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。chenkexin1963@yahoo.com。
¹⁸德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心病理学系，德克萨斯州休斯顿，77030，美国。wzhang@mdanderson.org。

PMID： 25300797
预防性维修识别码： PMC4197299
内政部： 10.1186/s13045-014-0076-2

复发LRP1-SNRNP25和KCNMB4-CCND3融合基因促进人骨肉瘤肿瘤细胞运动

杨吉龙等。血液肿瘤杂志. 2014.

.2014年10月10日10:7:76。

doi:10.1186/s13045-014-0076-2。

作者

杨吉龙^1 2, 马蒂·阿纳拉^三 4, 平济⁵, 王国文^6 7, 洪正（音）^8 9, 大卫·科德格尔¹⁰, 杜晓玲¹¹, 方志伟¹², 孙保村^13 14, 马蒂·尼克特¹⁵, 陈可欣^16 17, 张伟（音译）¹⁸

附属机构

¹天津医科大学肿瘤医院肿瘤研究所骨与软组织肿瘤科，中国天津，30060。yangjilong@tjmuch.com。
²国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。yangjilong@tjmuch.com。
^三芬兰坦佩雷科技大学信号处理系，坦佩雷，33101。matti.annala@tut.fi。
⁴芬兰坦佩雷大学生物医学技术研究所，坦佩雷，33520。matti.annala@tut.fi。
⁵德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心病理学系，德克萨斯州休斯顿，77030，美国。pji@mdanderson.org。
⁶天津医科大学肿瘤医院及研究所骨与软组织肿瘤科，天津，30060，中国。wgwhrb@163.com。
⁷国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。wgwhrb@163.com。
⁸天津医科大学肿瘤医院与研究所流行病学与生物统计系，天津，30060，中国。zhengh64@aliyun.com。
⁹国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。zhengh64@aliyun.com。
¹⁰德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心病理学系，德克萨斯州休斯顿，77030，美国。dcogdell@mdanderson.org。
¹¹天津医科大学诊断学系，中国天津，30060。xiaolingdu2003@163.com。
¹²北京大学肿瘤医院骨与软组织肿瘤科，北京，100020，中国。fzhiwei66@163.com。
¹³天津医科大学肿瘤医院病理科，天津，30060，中国。sunbaocun@tjmuch.com。
¹⁴国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。sunbaocun@tjmuch.com。
¹⁵芬兰坦佩雷科技大学信号处理系，坦佩雷，33101。matti.nykter@tut.fi。
¹⁶天津医科大学肿瘤医院与研究所流行病学与生物统计系，天津，30060，中国。chenkexin1963@yahoo.com。
¹⁷国家癌症临床研究中心，天津医科大学肿瘤研究所和医院，天津，300060，中国。chenkexin1963@yahoo.com。
¹⁸德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心病理学系，德克萨斯州休斯顿，77030，美国。wzhang@mdanderson.org。

PMID： 25300797
预防性维修识别码： PMC4197299
内政部： 10.1186/s13045-014-0076-2

摘要

背景：人类肉瘤中SYT-SSX1/SSX2、PAX3-FOXO1、TPM3/TPM4-ALK和EWS-FLI1等融合基因的鉴定为肉瘤的诊断和靶向治疗提供了重要的思路。在人类骨肉瘤中没有复发性融合的报道。

方法：采用转录组测序技术对11例骨肉瘤的基因融合和突变进行了研究。

结果：11份样本中有9份在TP53通路中存在基因失活改变。与12q位点相关的两个复发融合基因LRP1-SNRNP25和KCNMB4-CCND3通过RT-PCR、Sanger测序和荧光原位杂交进行了鉴定和验证，并在240个其他肉瘤的验证队列中发现了骨肉瘤特异性。LRP1-SNRNP25融合基因的表达促进了SAOS-2骨肉瘤细胞的迁移和侵袭。KCNMB4-CCND3融合基因的表达促进SAOS-2细胞迁移。

结论：我们的研究首次对未经治疗的人骨肉瘤进行了全转录组分析。我们发现了两个与骨肉瘤细胞运动相关的骨肉瘤特异性融合基因，这突出了骨肉瘤的异质性，并为新的治疗方式提供了机会。

PubMed免责声明

数字

图1
**11例骨肉瘤的转录组测序显示了染色体重排的两个热点。**17p中的一个热点与*TP53型*-扰乱重新安排。12q的第二个热点与*MDM2/CDK4型*共放大。

图2
**人类骨肉瘤中复发的TP53通路改变。（A）**我们队列中确定的p53和RB1通路的激活（红色）和失活（蓝色）改变。**（B）**样品8、9、10具有12q的共扩增*CDK4型*和*MDM2型*.12q扩增与*TP53型*基因。**（C）**我们队列中观察到的遗传改变矩阵。11名患者中有9名在*TP53型*通路基因。

图3
**融合基因的验证和鉴定。（A）**的结构*轻轨P1-SNRNP25*融合基因。熔接处的桑格排序如下图所示。**（B）**序列队列中融合转录物的RT-PCR验证。匹配的正常白细胞（WBC）融合呈阴性。**（C）**RT-PCR在20例骨肉瘤的验证队列中发现了第二例融合阳性病例。**（D）**融合导致高表达*SNRNP25号*外显子2-5。**（E）**染色体间重排并列*轻轨P1*和*SNRNP25号*使用荧光原位杂交（FISH）进行验证。箭头表示重叠的探针。

图4
***轻轨P1-SNRNP25*** 和 ***KCNMB4-CCND3公司*** **融合基因促进人骨肉瘤SAOS-2细胞相对于空载体的运动。（A）**Transwell迁移分析。两者都是*LRP1-SNRNP25型*和*KCNMB4-CCND3公司*融合显著促进SAOS-2细胞的迁移。**（B）**Transwell侵入试验。而*轻轨P1-SNRNP25*显著促进SAOS-2细胞的侵袭，*KCNMB4-CCND3公司*融合并未显著促进细胞侵袭。**（C）**伤口愈合试验表明，两种融合都加速了骨肉瘤细胞的迁移。

请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

骨肉瘤基因组学研究及其对靶向治疗的影响：征服人类骨肉瘤的国际合作。
杨JL。杨JL。 Chin J癌症。2014年12月；33(12):575-80. doi:10.5732/cjc.014.10209。Epub 2014年11月21日。 Chin J癌症。2014 PMID：25418192 免费PMC文章。
EWS-FLI1诱导的骨肉瘤模型揭示了成骨分化受损对骨肉瘤发展的关键作用。
Komura S、Semi K、Itakura F、Shibata H、Ohno T、Hotta A、Woltjen K、Yamamoto T、Akiyama H、Yamada Y。 Komura S等人。干细胞报告。2016年4月12日；6(4):592-606. doi:10.1016/j.stemcr.2016.02.009。Epub 2016年3月17日。干细胞报告。2016 PMID：26997645 免费PMC文章。
骨肉瘤中RUNX2（6p21.1）扩增。
Gupta S、Ito T、Alex D、Vanderbilt CM、Chang JC、Islamdoust N、Zhang Y、Nafa K、Healey J、Ladanii M、Hameed MR。 Gupta S等人。 Hum Pathol（Hum病态）。2019年12月；94:23-28. doi:10.1016/j.humpath.2019.09.010。Epub 2019年10月25日。 Hum Pathol（Hum病态）。2019 PMID：31669178 免费PMC文章。
人类骨肉瘤Wnt通路失活的遗传基础。
杜X，杨杰，杨德，田伟，朱忠。 Du X等人。 BMC癌症。2014年6月18日；14:450. doi:10.1186/1471-2407-14-450。 BMC癌症。2014 PMID：24942472 免费PMC文章。
低密度脂蛋白受体相关蛋白1在肿瘤中的作用。
邢平，廖Z，任Z，赵J，宋F，王G，陈K，杨J。 Xing P等人。 Chin J癌症。2016年1月6日；35:6之间。doi:10.1186/s40880-015-0064-0。 Chin J癌症。2016 PMID：26738504 免费PMC文章。审查。

查看所有类似文章

引用人

胃癌和间充质干细胞源性外泌体：从促肿瘤效应到抗癌载体。
Dolatshahi M、Bahrami AR、Sheikh QI、Ghanbari M、Matin MM。 Dolatshahi M等人。 Arch Pharm Res.2024年1月；47(1):1-19. doi:10.1007/s12272-023-01477-8。Epub 2023年12月27日。《Arch Pharm Res.2024》。 PMID：38151649 审查。
TCR-T细胞肿瘤特异性新抗原的筛选、鉴定、设计和临床应用。
李杰、肖Z、王德、贾丽、聂S、曾X、胡伟。李杰等。摩尔癌症。2023年8月30日；22(1):141. doi:10.1186/s12943-023-01844-5。摩尔癌症。2023 PMID：37649123 免费PMC文章。审查。
对59个肉瘤相关融合基因的广泛分析表明，帕佐帕尼是COL1A1-PDGFB融合基因的潜在抑制剂。
Hirose T、Ikegami M、Kojima S、Yoshida A、Endo M、Shimada E、Kanahori M、Oyama R、Matsumoto Y、Nakashima Y、Kawai A、Mano H、Kohsaka S。 Hirose T等人。癌症科学。2023年10月；114(10):4089-4100. doi:10.1111/cas.15915。Epub 2023年8月17日。癌症科学。2023 PMID：37592448 免费PMC文章。
D型细胞周期蛋白与发育和疾病。
Saleban M、Harris EL、Poulter JA。 Saleban M等人。基因（巴塞尔）。2023年7月14日；14(7):1445. doi:10.3390/genes14071445。基因（巴塞尔）。2023 PMID：37510349 免费PMC文章。审查。
新抗原：癌症治疗的潜在靶点。
谢恩，沈刚，高伟，黄Z，黄C，傅L。谢恩等。信号传输目标热。2023年1月6日；8(1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x。信号传输目标热。2023 PMID：36604431 免费PMC文章。审查。

查看所有“被引用”文章

工具书类

1. Fletcher CDM、Bridge JA、Hogendoorn PCW、Mertens F.世界卫生组织软组织和骨肿瘤分类。4.里昂：IARC出版社；2013
1. Taylor BS、Barretina J、Maki RG、Antonescu CR、Singer S、Ladanii M.肉瘤基因组学进展和新的治疗靶点。Nat Rev癌症。2011;11:541–557. doi:10.1038/nrc3087。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学
1. Barretina J、Taylor BS、Banerji S、Ramos AH、Lagos-Quintana M、Decarolis PL、Shah K、Socci ND、Weir BA、Ho A、Chiang DY、Reva B、Mermel CH、Getz G、Antipin Y、Beroukhim R、Major JE、Hatton C、Nicoletti R、Hanna M、Sharpe T、Fennell TJ、Cibulskis K、Onofrio RC、Saito T、Shukla N、Lau C、Nelander S、Silver SJ、Sougnez C等。亚型特异性基因组改变确定了软组织肉瘤治疗的新靶点。自然遗传学。2010;42:715–721. doi:10.1038/ng.619。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学
1. Mitelman F、Johansson B、Mertens F。易位和基因融合对癌症病因的影响。Nat Rev癌症。2007年；7:233–245. doi:10.1038/nrc2091。-DOI程序-公共医学
1. Toguchida J，Nakayama T.肉瘤的分子遗传学：在诊断和治疗中的应用。癌症科学。2009;100:1573–1580. doi:10.1111/j.1349-7006.2009.01232.x。-DOI程序-公共医学

出版物类型

行动

MeSH术语

行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动

[1] Fletcher CDM、Bridge JA、Hogendoorn PCW、Mertens F.世界卫生组织软组织和骨肿瘤分类。4.里昂：IARC出版社；2013

[2] Fletcher CDM、Bridge JA、Hogendoorn PCW、Mertens F.世界卫生组织软组织和骨肿瘤分类。4.里昂：IARC出版社；2013

[3] Taylor BS、Barretina J、Maki RG、Antonescu CR、Singer S、Ladanii M.肉瘤基因组学进展和新的治疗靶点。Nat Rev癌症。2011;11:541–557. doi:10.1038/nrc3087。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学

[4] Taylor BS、Barretina J、Maki RG、Antonescu CR、Singer S、Ladanii M.肉瘤基因组学进展和新的治疗靶点。Nat Rev癌症。2011;11:541–557. doi:10.1038/nrc3087。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学

[5] Barretina J、Taylor BS、Banerji S、Ramos AH、Lagos-Quintana M、Decarolis PL、Shah K、Socci ND、Weir BA、Ho A、Chiang DY、Reva B、Mermel CH、Getz G、Antipin Y、Beroukhim R、Major JE、Hatton C、Nicoletti R、Hanna M、Sharpe T、Fennell TJ、Cibulskis K、Onofrio RC、Saito T、Shukla N、Lau C、Nelander S、Silver SJ、Sougnez C等。亚型特异性基因组改变确定了软组织肉瘤治疗的新靶点。自然遗传学。2010;42:715–721. doi:10.1038/ng.619。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学

[6] Barretina J、Taylor BS、Banerji S、Ramos AH、Lagos-Quintana M、Decarolis PL、Shah K、Socci ND、Weir BA、Ho A、Chiang DY、Reva B、Mermel CH、Getz G、Antipin Y、Beroukhim R、Major JE、Hatton C、Nicoletti R、Hanna M、Sharpe T、Fennell TJ、Cibulskis K、Onofrio RC、Saito T、Shukla N、Lau C、Nelander S、Silver SJ、Sougnez C等。亚型特异性基因组改变确定了软组织肉瘤治疗的新靶点。自然遗传学。2010;42:715–721. doi:10.1038/ng.619。-DOI程序-项目管理咨询公司-公共医学

[7] Mitelman F、Johansson B、Mertens F。易位和基因融合对癌症病因的影响。Nat Rev癌症。2007年；7:233–245. doi:10.1038/nrc2091。-DOI程序-公共医学

[8] Mitelman F、Johansson B、Mertens F。易位和基因融合对癌症病因的影响。Nat Rev癌症。2007年；7:233–245. doi:10.1038/nrc2091。-DOI程序-公共医学

[9] Toguchida J，Nakayama T.肉瘤的分子遗传学：在诊断和治疗中的应用。癌症科学。2009;100:1573–1580. doi:10.1111/j.1349-7006.2009.01232.x。-DOI程序-公共医学

[10] Toguchida J，Nakayama T.肉瘤的分子遗传学：在诊断和治疗中的应用。癌症科学。2009;100:1573–1580. doi:10.1111/j.1349-7006.2009.01232.x。-DOI程序-公共医学

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

您的RSS源

复发LRP1-SNRNP25和KCNMB4-CCND3融合基因促进人骨肉瘤肿瘤细胞运动

附属机构

复发LRP1-SNRNP25和KCNMB4-CCND3融合基因促进人骨肉瘤肿瘤细胞运动

作者

附属机构

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

相关信息